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目的:建立一种宏基因组二代测序(mNGS)DNA流程检测BALF标本的性能确认方法。方法:以Hela细胞代表宿主细胞,向无菌生理盐水中加入不同浓度Hela细胞、7种病原体(肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、白色念珠菌、新型隐球菌、烟曲霉和腺病毒)和干扰物质制备模拟BALF标本,同时收集临床BALF标本,以传统检测方法为参比方法,评价mNGS检测结果,确定mNGS的最低检出限、精密度、抗干扰能力、稳定性和准确度。结果:模拟标本中,肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、白色念珠菌、新型隐球菌、烟曲霉和腺病毒7种病原体的最低检出限分别为150、262、102、67、96、83 CFU/ml和439 拷贝/ml。模拟阳性标本中所有病原体重复检测结果符合率均为100

作者:宋慧娟;鲁艳军;田磊;陈中举;汪玥;刘为勇;毛莉妍;孙自镛;彭静

来源:中华检验医学杂志 2023 年 46卷 10期

知识库介绍

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宋慧娟;鲁艳军;田磊;陈中举;汪玥;刘为勇;毛莉妍;孙自镛;彭静
来源:
中华检验医学杂志 2023 年 46卷 10期
标签:
支气管肺泡灌洗液 宏基因组二代测序 性能确认 准确度 结核分枝杆菌 Bronchoalveolar lavage fluid Metagenomic next-generation sequencing Performance validation Accuracy Mycobacterium tuberculosis
目的:建立一种宏基因组二代测序(mNGS)DNA流程检测BALF标本的性能确认方法。方法:以Hela细胞代表宿主细胞,向无菌生理盐水中加入不同浓度Hela细胞、7种病原体(肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、白色念珠菌、新型隐球菌、烟曲霉和腺病毒)和干扰物质制备模拟BALF标本,同时收集临床BALF标本,以传统检测方法为参比方法,评价mNGS检测结果,确定mNGS的最低检出限、精密度、抗干扰能力、稳定性和准确度。结果:模拟标本中,肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌、白色念珠菌、新型隐球菌、烟曲霉和腺病毒7种病原体的最低检出限分别为150、262、102、67、96、83 CFU/ml和439 拷贝/ml。模拟阳性标本中所有病原体重复检测结果符合率均为100

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