目的 应用全基因组测序技术分析宁波市利福平耐药结核分枝杆菌(RR-TB)耐药特征,为RR-TB感染患者的临床诊疗及疫情防控提供科学依据.方法 选取宁波市耐药肺结核唯一定点诊疗机构(宁波市第二医院)耐药监测期间保存的2018-2019年59株RR-TB临床分离株,提取总DNA后进行全基因组测序.应用Perl脚本处理原始数据,并通过结核分枝杆菌(MTB)耐药基因数据库确定耐药基因相关突变,同时结合表型药敏试验结果综合分析本地区RR-TB临床分离株对异烟肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)、阿米卡星(AM)、卷曲霉素(CAP)、左氧氟沙星(LFX)、丙硫异烟胺(PTO)及对氨基水杨酸(PAS)9种抗结核药物的耐药特征.结果 59株RR-TB菌株INH、RIF的耐药率分别为83.05％、100.00％;基于全基因组测序的59株RR-TB菌株共检测到40种耐药相关基因突变类型,其中以katG基因Ser315Thr(62.71％),rpoB基因Ser450Leu(62.71％),rpsL 基因 Lys43Arg(50.85％)和 embB 基因 Met306Val(30.51％)为主;59 株 RR-TB 菌株分为 2 个基因型,分别为L2型(89.83％)和L4型(10.17％);其中,L2型菌株又分为2个亚型,分别为L2.1型菌株(1.89％)和L2.2型菌株(98.11％);L4型菌株又分为3个亚型,分别为L4.2型菌株(16.67％),L4.4型菌株(66.67％)和L4.5型菌株(16.67％);

作者：陈琴；车洋；柳正卫；贺天锋；杨天池；桑国鑫

来源：中华医院感染学杂志 2023 年 33卷 16期