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目的:基于生物信息学方法分析胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)的表达及其与预后的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载2021年1月至2021年12月168例胰腺癌样本RNA测序数据(HTSeq-FPKM)和相应的临床信息,从GEPIA2数据库中下载2021年1月至12月179例胰腺癌患者数据,同时整合TCGA和GTEx数据库中的171个正常胰腺组织样本。分析GEPIA2数据库中胰腺癌患者CDCA5 mRNA相对表达量及其与患者总生存(OS)和无病生存(DFS)的关系;结合患者临床资料,采用单因素和多因素Cox比例风险模型分析胰腺癌患者OS的影响因素;使用基因集富集分析(GSEA)探讨CDCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路。结果:在GEPIA2数据库中,胰腺癌组织中CDCA5 mRNA相对表达量较正常胰腺组织升高,差异有统计学意义( P<0.05)。根据CDCA5 mRNA相对表达量的中位值将胰腺癌患者分为高表达组(89例)和低表达组(89例)(等于中位值者未分组),CDCA5 mRNA高表达的胰腺癌患者较低表达患者OS( P=0.024)和DFS差( P=0.025)。TCGA数据库中,N分期( HR=2.15,95

作者:李书珍;周献青;韦唯;易艳;马润瑶;杨彤;覃海莲;杨桂淇

来源:肿瘤研究与临床 2023 年 35卷 4期

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作者:
李书珍;周献青;韦唯;易艳;马润瑶;杨彤;覃海莲;杨桂淇
来源:
肿瘤研究与临床 2023 年 35卷 4期
标签:
胰腺肿瘤 细胞分裂周期相关蛋白5 预后 基因集富集分析 Pancreatic neoplasms Cell division cycle associated protein 5 Prognosis Gene set enrichment analysis
目的:基于生物信息学方法分析胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)的表达及其与预后的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载2021年1月至2021年12月168例胰腺癌样本RNA测序数据(HTSeq-FPKM)和相应的临床信息,从GEPIA2数据库中下载2021年1月至12月179例胰腺癌患者数据,同时整合TCGA和GTEx数据库中的171个正常胰腺组织样本。分析GEPIA2数据库中胰腺癌患者CDCA5 mRNA相对表达量及其与患者总生存(OS)和无病生存(DFS)的关系;结合患者临床资料,采用单因素和多因素Cox比例风险模型分析胰腺癌患者OS的影响因素;使用基因集富集分析(GSEA)探讨CDCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路。结果:在GEPIA2数据库中,胰腺癌组织中CDCA5 mRNA相对表达量较正常胰腺组织升高,差异有统计学意义( P<0.05)。根据CDCA5 mRNA相对表达量的中位值将胰腺癌患者分为高表达组(89例)和低表达组(89例)(等于中位值者未分组),CDCA5 mRNA高表达的胰腺癌患者较低表达患者OS( P=0.024)和DFS差( P=0.025)。TCGA数据库中,N分期( HR=2.15,95

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