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目的 以中医"异病同治"理论为依据,采用网络药理学与分子对接方法探讨化肝煎"异病同治"失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点及可能作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等中药化合物数据库结合文献挖掘获取化肝煎的化学成分和作用靶点;结合GeneCards、OMIM、PharmGKB、DRUGBANK、TTD数据库获取化肝煎治疗失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点.采用Cytoscape软件绘制化肝煎中药-成分-靶点网络,利用Venny软件得出相关交集基因.基于Cytoscape软件绘制化肝煎-成分-靶点可视化网络图,借助STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络,分析获得核心作用靶点.采用Metascape平台工具对其进行基因本体论(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用AutodockTools软件对化肝煎主要活性成分与疾病作用靶点进行分子对接.结果 筛选得到化肝煎化学成分56个,疾病靶点:失眠438个,慢性萎缩性胃炎868个,胃食管反流病4252个,以及20个药物成分和疾病共同靶点.PPI网络中关键蛋白排名靠前的靶点为IL6、NCF1、PTGS2、CRP、MPO、PPARG、TNF等.获得GO富集分析结果排名靠前的有452种生物过程(BP)、19种分子功能(MF)、6种细胞组分(CC),KEGG信号通路主要有6条信号

作者:邓雅凤;王洋洋;鱼涛

来源:药物评价研究 2022 年 45卷 11期

知识库介绍

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作者:
邓雅凤;王洋洋;鱼涛
来源:
药物评价研究 2022 年 45卷 11期
标签:
化肝煎 失眠 慢性萎缩性胃炎 胃食管反流病 异病同治 网络药理学
目的 以中医"异病同治"理论为依据,采用网络药理学与分子对接方法探讨化肝煎"异病同治"失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点及可能作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等中药化合物数据库结合文献挖掘获取化肝煎的化学成分和作用靶点;结合GeneCards、OMIM、PharmGKB、DRUGBANK、TTD数据库获取化肝煎治疗失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点.采用Cytoscape软件绘制化肝煎中药-成分-靶点网络,利用Venny软件得出相关交集基因.基于Cytoscape软件绘制化肝煎-成分-靶点可视化网络图,借助STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络,分析获得核心作用靶点.采用Metascape平台工具对其进行基因本体论(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用AutodockTools软件对化肝煎主要活性成分与疾病作用靶点进行分子对接.结果 筛选得到化肝煎化学成分56个,疾病靶点:失眠438个,慢性萎缩性胃炎868个,胃食管反流病4252个,以及20个药物成分和疾病共同靶点.PPI网络中关键蛋白排名靠前的靶点为IL6、NCF1、PTGS2、CRP、MPO、PPARG、TNF等.获得GO富集分析结果排名靠前的有452种生物过程(BP)、19种分子功能(MF)、6种细胞组分(CC),KEGG信号通路主要有6条信号

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