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目的:克隆黄连重金属ATP酶基因CcHMA3,并对其编码蛋白进行生物信息学以及差异表达分析.方法:根据黄连基因组和转录组数据,利用PCR扩增CcHMA3 的全长cDNA并进行生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测CcHMA3 基因在黄连植株中的表达差异.结果:克隆获得CcHMA3 基因,开放阅读框全长为 3 030 bp,编码1 009 个氨基酸;蛋白相对分子量为109.03 kD,理论等电点为6.7;蛋白序列中含有6 个跨膜结构域和 2 个保守结构域,亚细胞定位预测表明CcHMA3 位于质膜上,具有一定亲水性.qRT-PCR结果表明,CcH-MA3 基因在黄连不同组织中的相对表达量由高至低依次为须根、根茎、叶柄、叶片;当镉处理后,CcHMA3 基因在须根中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),且对不同镉胁迫处理时间存在明显不同的响应表达.结论:该研究为进一步深入研究CcHMA3 基因在黄连重金属镉代谢过程中的调控机制,进而寻找可能的阻断方式奠定实验基础.

作者:程华春;王文斌;莫静;李小芳;聂晶;汪波

来源:中药材 2023 年 46卷 12期

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作者:
程华春;王文斌;莫静;李小芳;聂晶;汪波
来源:
中药材 2023 年 46卷 12期
标签:
黄连 CcHMA3 基因克隆 镉胁迫 表达分析 Coptis chinensis Franch. Cc HMA3 Gene cloning Cadmium stress Expression analysis
目的:克隆黄连重金属ATP酶基因CcHMA3,并对其编码蛋白进行生物信息学以及差异表达分析.方法:根据黄连基因组和转录组数据,利用PCR扩增CcHMA3 的全长cDNA并进行生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测CcHMA3 基因在黄连植株中的表达差异.结果:克隆获得CcHMA3 基因,开放阅读框全长为 3 030 bp,编码1 009 个氨基酸;蛋白相对分子量为109.03 kD,理论等电点为6.7;蛋白序列中含有6 个跨膜结构域和 2 个保守结构域,亚细胞定位预测表明CcHMA3 位于质膜上,具有一定亲水性.qRT-PCR结果表明,CcH-MA3 基因在黄连不同组织中的相对表达量由高至低依次为须根、根茎、叶柄、叶片;当镉处理后,CcHMA3 基因在须根中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),且对不同镉胁迫处理时间存在明显不同的响应表达.结论:该研究为进一步深入研究CcHMA3 基因在黄连重金属镉代谢过程中的调控机制,进而寻找可能的阻断方式奠定实验基础.

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