-
基于分子对接技术探索京制牛黄解毒片治疗新型冠状病毒肺炎的机制
编辑人员丨2023/8/5
目的 通过网络药理学和分子对接技术探索京制牛黄解毒片治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在分子机制.方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索京制牛黄解毒片的有效活性成分及作用靶点;运用Gene Cards数据库获取COVID-19的相关靶点,并采用交集法筛选出与京制牛黄解毒片活性成分作用的共同靶点,通过Cytoscape 3.7.2软件构建"药材-化合物-作用靶点-疾病"网络,并利用String平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库对靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(K EGG)通路富集分析.通过分子对接评价"药材-化合物-作用靶点-疾病"网络中排名前10的成分与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶及血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)的结合作用.结果 京制牛黄解毒片中共筛选出活性化合物420个,作用靶点334个,与COVID-19交集靶点有60个,筛选得到关键化合物15个和关键靶点17个;GO及KEGG富集分析得出与京制牛黄解毒片治疗COVID-19作用相关的生物过程100个、相关信号通路52条,主要涉及细胞凋亡、炎症反应、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、鞘脂信号通路和缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等.分子对接结果显示,京制牛黄解毒片中核心成分与SARS-CoV-23CL水解酶和ACE2的亲和作用良好.结论 京制牛黄解毒片中槲皮素和木犀草素等黄酮类活性成分以及植物甾醇类成分可与SARS-CoV-23CL水解酶和ACE2结合,作用于细胞凋亡、TNF和鞘脂信号通路的前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、诱导型一氧化氮合酶(NOS2)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基γ亚型(PIK3CG)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、凋亡调节因子(BCL2)、转录因子p65(RELA)、凋亡调节剂(BAX)和TNF等关键靶标,发挥调节免疫、抗炎、调节细胞凋亡、抗病毒感染和改善肺纤维化的作用,从而起到治疗COVID-19的作用.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
基于网络药理学探讨京制牛黄解毒片治疗口腔溃疡的作用机制及实验验证
编辑人员丨2023/8/5
目的 运用网络药理学和动物实验验证,探讨京制牛黄解毒片治疗口腔溃疡(Oral ulcer,OU)的作用机制.方法 通过中药成分数据库(TCMSP、TCMID)筛选出京制牛黄解毒片组成药物的主要化学成分及其潜在靶点;通过Genecards、OMIM、Drugbank和PharmGKB数据库获得OU疾病相关基因;利用cytoscape3.8.2软件构建药物-化学成分-靶点-疾病网络图;采用STRING数据库构建靶点相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络.采用R软件(4.0.4)将京制牛黄解毒片中化学成分预测靶点和OU疾病的共同靶点进行基因本体(Gene ontology,GO)及基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;最后通过复制大鼠口腔溃疡模型,对京制牛黄解毒片治疗口腔溃疡的药效及核心信号通路进行验证.结果 经数据库分析,共获得京制牛黄解毒片29个关键活性成分,核心靶点包括Mitogen-activated protein kinase 1/3(MAPK1/3)、Protein kinase B(AKT1/PKB)、Signal transducer and activator of transcription(STAT3)、Heat shock protein 90(HSP90)、Vascular endothelial growth factor(VEGF)、Interleukin-6(IL-6)、Epidermal growth factor receptor(EGFR)等,GO功能富集和KEGG通路富集主要影响PI3K-AKT(Phosphoinositide 3-kinase/protein kinase B)、Tumor necrosis factor(TNF)、Interleukin-17(IL-17)及Hypoxia-inducible factor 1(HIF-1)等信号通路.大鼠实验证实京制牛黄解毒片可显著减小溃疡面积,明显改善口腔溃疡程度和溃疡的病理变化,显著降低血清促炎因子TNFα、IL-1β、IL-6和Interferonγ(IFN-γ)水平,升高抗炎因子IL-4水平;同时显著降低溃疡组织VEGF蛋白水平.结论 京制牛黄解毒片具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,对大鼠实验性口腔溃疡具有治疗作用,其作用机制与调节炎症信号通路有关,为后续京制牛黄解毒片临床应用和机制研究提供了参考.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
