四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国特有的珍稀濒危雉科Phasianidae鸟类.以四川老君山国家级自然保护区和四川马鞍山自然保护区为研究区域,基于2020-2022年红外相机的监测数据,采用非参数核密度估计方法对两地四川山鹧鸪种群的日活动节律进行了比较研究.结果显示:老君山种群在繁殖季的日活动节律为多峰型,非繁殖季为双峰型;而马鞍山种群的日活动节律均为双峰型.但2个种群的活动模式差异未达到显著性水平.这表明,四川山鹧鸪的日活动节律兼具保守性和可塑性,丰富了该物种的基础生态学资料.

内源性逆转录病毒(ERV)是插入到宿主基因组中的、可以稳定遗传的病毒基因组,能够在宿主体内表达和复制,调节插入位点附近的基因表达,以及抑制同源病毒的感染.从四川山鹧鸪Arborophila rufipectus基因组中确定了3 962个全长ERV拷贝,其中4个具有完整的结构,72个具有自我复制的能力,554个含有gag、pol或env基因所编码的蛋白质结构域.根据逆转录酶序列的相似性,确定了7个ERV家族,并依据与其他物种的相似性对家族进行了命名.其中,AruERV-L包含122个ERV拷贝,为拷贝数最多的家族.7个ERV家族的年龄分布在0～ 12百万年,其中AruERV-K1是最年轻的家族,其约86％的拷贝年龄在1百万年以内.

四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是我国西南山地特有的雉科Phasianidae鸟类,国家Ⅰ级重点保护野生动物,仅分布于四川省中南部和云南省东北部的少数山区森林中(郑光美,2015).2019年5月,在四川省屏山县老君山国家级自然保护区,通过红外相机监测到1只体羽部分白化的四川山鹧鸪成年雌鸟(图1:左).

基于2006年4月-2018年6月四川老君山国家级自然保护区四川山鹧鸪Arborophila rufipectus固定样点监测数据,对四川山鹧鸪栖息地利用及变化进行了分析,结果显示:(1)不同年间四川山鹧鸪对样点的利用率存在差异,2006-2012年对样点的利用频次呈现下降趋势,2012年后呈现上升趋势;(2)利用样点的平均海拔为1 580 m±183 m,年间差异不大,总体保持稳定;(3)对人工林的利用频次最低,2006-2012年对原始林和次生林的利用偏好不明显,2012年之后对原始林的利用率大于次生林;(4)高频利用的生境具有海拔较高、坡度较小、灌丛盖度和竹丛盖度较大、且为原始林的特点.高海拔区域的原始林是保护区需要重点加强保护的区域;加强对低海拔区域人类活动的管控,促进次生林恢复,同时加强对人工林的改造,促进人工林林下灌丛和竹丛生长,将有利于保护区内四川山鹧鸪的栖息与繁衍.

四川山鹧鸪Arborophila rufipectus是中国特有的珍稀濒危鸟类.本研究对1只成年雄性四川山鹧鸪个体的心脏、肝脏和肾脏进行了转录组测序、组装和注释.其原始序列过滤后分别产生了5.70 G、4.60 G和5.16 G数据.286661条转录本经过Trinity组装并去掉冗余后共得到234488个基因.BUSCO评估组装完整性为97.6％.81.29％的unigenes不包含开放阅读框(ORF),16.43％的包含1个ORF,而2.28％的包含2个及以上ORF.70737个基因在NR、GO、KEGG、Swiss和COG数据库获得注释结果,占比30.17％,其中NR数据库的注释结果占比最高(29.27％),而COG数据库的注释结果最低(4.37％).5个数据库共同注释到的基因6998个,NR数据库中单独注释到的基因最多(23773个).本研究为四川山鹧鸪功能基因的挖掘提供了基础数据,并为保护该物种提供了遗传数据.

四川山鹧鸪 Arborophila rufipectus 属鸡形目 Galliformes雉科Phasianidae山鹧鸪属Arborophila(郑光美,2017),是我国西南山地特有鸟类,国家一级重点保护野生动物.因种群数量稀少和分布区狭窄,被IUCN濒危物种红色名录列为濒危(EN)物种(BirdLife International,2016),同时被列入《国家"十四五"林草规划抢救性保护珍稀濒危野生动物名录》(国家林业和草原局,农业农村部,2021).四川山鹧鸪仅分布于四川省中南部及云南省东北部的少数山区森林中(雷富民,卢汰春,2006;郑光美,2017).目前对该鸟类的自然生活史了解十分有限(郑光美,2015;付义强,陈本平,2017;Fu et al.,2020).

物种编目是生物多样性研究和保护的基础,开展野生动物多样性监测对更新本底物种编目至关重要.目前红外相机的应用十分普通,已成为陆生大中型兽类和林下鸟类监测的最有效方法之一.老君山国家级自然保护区位于四川省屏山县,面积35 km2,是我国第一个以四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus)等珍稀濒危雉科鸟类以及常绿阔叶林生态系统为主要保护对象的保护区.本文整理了保护区2013年4月至2020年9月的红外相机监测数据并进行了详细的物种鉴定,提供了按照年度统计的红外相机监测数据集.本数据集展示了不同监测年度下的相机位点坐标和相机工作日、每个相机位点拍摄的兽类和鸟类物种数、独立有效记录数、整体鸟兽物种名录(包括分布海拔、分布区域以及不同年度下的网格占有率与相对多度指数等)、代表性物种的红外相机照片等.该数据集是保护区开展红外相机监测工作以来首次全面的成果汇总,可为保护区制定针对性保护与管理决策提供重要科学依据.