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基于Web of Science核心集重症护理研究可视化分析
编辑人员丨1周前
目的:通过知识图谱可视化技术对Web of Science核心集已发表的重症护理相关文献进行数据分析,归纳重症护理研究现状及热点。方法:检索2011年1月至2020年12月Web of Science核心集数据库,对提取信息进行数据标准化处理,利用知识图谱可视化等方法对提取数据进行分析处理。结果:共纳入783篇重症护理领域相关文章,文献数量呈逐年递增趋势,其中杂志《Amercian Journal of Critical Care》(305篇)上刊登最多,美国(437篇)是发表文献最多的国家,澳大利亚(centrality=0.67)是中心度最高的国家,我国在发文数量及中心性方面均处于中下水平。国家间有合作,但并非紧密合作;作者间相互合作呈小聚集,大分散状态。被引文献聚类分析与关键词突现分析显示重症护理领域多个方面曾为研究热点,其中"重症监护后综合征""儿童重症护理"为近年来研究热点。结论:重症护理研究领域仍处于上升发展阶段,重症监护后综合征及儿童重症护理为重症护理研究最新热点。
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编辑人员丨1周前
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基于RNA-seq的脓毒症相关性脑病小鼠海马转录组分析及竞争性内源性RNA调控网络的构建
编辑人员丨1周前
目的:采用转录组测序技术(RNA-seq)筛选脓毒症相关性脑病(SAE)小鼠海马差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA,构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。方法:清洁级健康雄性C57BL/6小鼠10只,6~8周龄,体质量20~25 g,采用随机数字表法分为2组( n=5):假手术组(Sham组)和脓毒症组(Sepsis组)。Sepsis组采用盲肠结扎穿孔(CLP)法制备小鼠脓毒症模型,Sham组只开腹不进行盲肠结扎和穿孔。分别于术前1 d及术后3 d时行Morris水迷宫实验和条件恐惧实验检测小鼠认知功能。随后Sham组随机处死3只小鼠,Sepsis组处死认知功能测试最差的3只小鼠,取海马组织,通过BGISEQ-500平台行转录组测序,得到差异表达的mRNA和lncRNA,测序结果通过深圳华大基因科技服务有限公司提供的Dr.Tom平台行可视化分析,利用Cytoscape软件构建ceRNA调控网络。 结果:与Sham组比较,Sepsis组逃避潜伏期延长,靶向限停留时间百分比和僵直时间百分比降低( P<0.05)。转录组数据分析共获得差异表达的lncRNA 62个,其中45个lncRNA表达上调,17个lncRNA表达下调;差异表达的mRNA 282个,其中173个mRNA表达上调,109个mRNA表达下调。对差异表达的mRNA进行生物学过程的GO富集分析,结果显示差异表达的mRNA参与了记忆、学习或记忆、炎症应答、衰老相关行为减退的调空、突触可塑性调节等生物学过程;对差异表达的mRNA进行KEGG通路富集分析,结果显示差异表达的mRNA富集于IL-17信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等。对差异表达的mRNA进行KDA分析,结果示Ch25h、Il6ra、Lcn2、Sgk1、Nr4a3、Osm、Saa3、Ccl7、Sqle、Dhcr24为SAE的关键基因。基于9个lncRNA、28个mRNA和134个miRNA成功构建了SAE小鼠海马的ceRNA调控网络。 结论:RNA-seq结果分析发现Ch25h、Il6ra、Lcn2、Sgk1、Nr4a3、Osm、Saa3、Ccl7、Sqle、Dhcr24 10个mRNA以及Rian、Gm35874、Gm34347等lncRNA是调控小鼠SAE的关键基因;同时成功构建了SAE小鼠海马基于lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络。
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编辑人员丨1周前
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护理大数据应用现状及发展趋势的可视化分析
编辑人员丨1周前
目的:分析国内外护理大数据相关研究,了解其应用现状与发展趋势,为我国护理大数据的发展提供借鉴。方法:以CNKI、万方数据库和Web of Science核心合集收录的护理大数据相关文献为数据来源,检索时限为建库至2019年9月30日。采用Excel软件对文献的发表年份、国家、机构及期刊进行统计分析,采用VOSviewer软件对关键词和国家合作关系进行共现分析,绘制可视化图谱。结果:共纳入中文文献195篇,英文文献5 751篇。2001—2019年护理大数据相关研究总体呈增长趋势。我国护理大数据相关研究较少,研究机构较分散,主要刊登在护理期刊上。护理大数据英文文献主要涉及5个领域,分别为健康管理、评估与预测、数据挖掘技术、数据分析与云计算、大数据研究平台;中文文献主要涉及3个领域,分别为信息化护理、护理质量管理和大数据的应用类型。美国处于国家合作关系的中心位置并占据主导地位。结论:我国护理大数据研究尚处于起步阶段,研究内容不够聚焦,可从规范护理标准术语、构建多元的数据监测平台、提高护理人员信息素养等方面进一步探索,加快我国护理大数据在临床的应用,进而为患者提供精准的护理服务。
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编辑人员丨1周前
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小鼠动静脉内瘘增生狭窄的差异基因测序比对分析
编辑人员丨1周前
目的:构建小鼠颈内动静脉内瘘(arteriovenous fistula,AVF)模型,筛选AVF内膜增生狭窄过程中的差异表达基因,分析研究参与AVF内膜增生狭窄的异常表达信号通路及作用机制。方法:选取雄性C57BL/6小鼠46只,按简单随机法分为AVF组和假手术组,每组23只。AVF组行小鼠颈内AVF成形术,假手术组分离右侧颈外静脉、颈总动脉后缝合切口。应用转录组学可逆链终止物和合成测序法测定AVF内膜增生狭窄小鼠全基因组序列,建立微阵列数据集;应用基因芯片数据分析多重假设检验校正(Benjamini & Hochberg法)筛选AVF增生狭窄过程中的差异表达基因;利用R语言富集分析筛选AVF内膜增生狭窄过程中的差异表达基因,并对差异表达基因及信号通路进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;应用多样性增量分析BUSCA软件进行AVF增生狭窄差异表达基因亚细胞定位;应用STRING数据库及Cytoscape软件进行差异表达基因的蛋白网络互作可视化分析。结果:AVF组造模成功21只,失败2只,故最终AVF组21只,假手术组亦仅执行手术操作21只。小鼠颈内AVF模型创新采用连续-间断缝合法,提高了此模型建模的成功率。差异基因测序比对分析显示,AVF增生狭窄过程中差异表达基因2 514个,其中上调基因1 323个,下调基因1 191个;GO功能富集分析显示,差异基因主要富集在代谢过程、活性激活、氧化还原及线粒体等;KEGG通路富集分析显示,差异富集在代谢、能量物质合成、糖尿病、氧化应激等相关信号通路;亚细胞定位统计分析显示,差异蛋白主要在线粒体蛋白(24.24%)、胞质蛋白(17.51%)、细胞核蛋白(13.13%)、细胞膜蛋白(11.45%)、细胞外蛋白(10.77%)。结论:线粒体氧化应激损伤可能参与AVF内膜增生狭窄的病理损害过程。
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编辑人员丨1周前
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单细胞测序数据分析瘢痕疙瘩和局限性硬皮病组织中周细胞的差异
编辑人员丨1周前
目的:探讨瘢痕疙瘩和局限性硬皮病组织中周细胞的异质性及其演化轨迹差异,为研究2种皮肤纤维化疾病的致病机制和治疗靶点提供新的线索。方法:选取GEO和GSA-Human数据库中的3例局限性硬皮病、4例瘢痕疙瘩及其对应的邻近正常皮肤样本细胞的单细胞转录组测序数据,绘制数据的表达矩阵。采用R语言的Seurat 4.3.0包进行处理后分群绘制 t-SNE可视化图谱。采用Monocle 2.24.0包对其中的周细胞进行拟时序轨迹分析。 结果:瘢痕疙瘩和局限性硬皮病皮肤组织无监督聚类为19个不同的细胞群体,其中周细胞为C7、C11群,高表达PDGFRB和RGS5基因,占总细胞数的7.53%。周细胞进一步可分为8个亚群,拟时序分析发现基因表达变化主要有细胞命运1(fate 1)和细胞命运2(fate 2)2个分支轨迹,依照时序周细胞可分为5个状态(S1~S5);其中S4占前分支的绝大部分,代表最初状态的周细胞;S5构成细胞命运1分支的大部分,代表分化较早期状态的周细胞;S1、S2、S3构成命运2分支的大部分,其中S3代表分化中期状态的周细胞,而S1、S2则代表分化晚期状态的周细胞。在正常皮肤中,各分化状态的周细胞均匀分布,而瘢痕疙瘩周细胞主要分布于前支(S4)、分支1(S5)及分支2中的前一部分(S3),分别代表初始、早期及分化中期的细胞状态,分支基因表达动态分析显示其高表达SOX4、COL4A1、COL6A3、AHR、CXCL3和IL1R1等基因;而局限性硬皮病的周细胞主要分布于分支2的中后部分(S1、S2),代表分化末期的细胞,高表达ACTA2和MYH11等基因。结论:瘢痕疙瘩和局限性硬皮病中周细胞具有异质性以及不同的演化轨迹;瘢痕疙瘩周细胞更具有干细胞样特性,通过高表达与细胞干性、上皮-间质转换、侵袭性和免疫微环境调控相关的基因,对其侵袭性和复发的病理特性发挥重要作用;而局限性硬皮病中周细胞可能主要转分化为肌成纤维细胞,导致其纤维化病理表型。
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编辑人员丨1周前
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ICU谵妄患者扩散张量成像与静息态功能磁共振成像研究
编辑人员丨1周前
目的:应用静息态功能磁共振成像(fMRI)技术分析重症监护病房(ICU)谵妄患者的脑功能,应用扩散张量成像(DTI)技术进一步分析谵妄患者的脑区结构变化,从功能影像学的新视角探讨ICU谵妄患者脑功能、结构变化及相关性,为谵妄的诊断提供可视化依据。方法:选择2017年1月1日至12月31日在遵义医科大学附属医院ICU住院的谵妄患者作为研究对象;选择同期与谵妄患者性别、年龄、文化程度相匹配的健康志愿者作为对照组。记录患者入ICU 24 h内重症监护谵妄筛查量表(ICDSC)评分。所有受试者均通过fMRI和DTI技术进行磁共振扫描,采用脑区局部一致性(ReHo)数据分析方法评估谵妄患者静息态脑功能的异常变化;采用FSL软件进行DTI数据处理,分别提取脑区的各向异性分数(FA)和平均弥散率(MD),评估脑结构损伤情况;比较两组间的ReHo、FA及MD值。提取谵妄患者ReHo值较健康对照者降低具有统计学意义脑区的ReHo值与ICDSC评分进行Pearson相关分析。结果:共选择22例谵妄患者,剔除检查过程中不配合、使用镇静剂及扫描结果伪影者7例,最终共15例患者纳入谵妄组;共15例健康志愿者纳入健康对照组。①两组受试者性别、年龄、受教育时间比较差异无统计学意义;谵妄组患者ICDSC评分明显高于健康对照组(分:6.07±1.28比1.07±0.88, P<0.01)。② fMRI扫描及分析结果:与健康对照组相比,谵妄组患者小脑、右侧海马、纹状体、中脑、脑桥的ReHo值明显升高(均 P<0.05,AlphaSim校正),而双侧额上回、双侧额中回、左侧额下回、颞叶、顶叶的ReHo值明显降低(均 P<0.05,AlphaSim校正)。相关分析显示,谵妄患者左侧额上回ReHo值与ICDSC评分呈显著负相关( r=-0.794, P<0.05),说明额内侧回脑功能区改变与谵妄的发生最密切。③ DTI扫描及分析结果:与健康对照组相比,谵妄组患者左侧小脑、双侧额叶、左侧颞叶、胼胝体、左侧海马的FA值明显降低(均 P<0.05,AlphaSim校正),而额内侧回、右侧颞上回、前扣带回、双侧岛叶、左侧尾状核的MD值明显升高(均 P<0.05,AlphaSim校正),提示谵妄患者多个脑区结构和功能受损。 结论:谵妄患者多个脑区静息脑功能活动异常,左侧额上回静息脑功能活动异常与谵妄的发生密切相关;谵妄患者多个脑区存在结构损伤;额叶、颞叶、胼胝体、海马、小脑结构改变且功能异常可作为谵妄诊断的初步影像学评价指标。
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编辑人员丨1周前
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2010至2020年ICU谵妄领域研究进展:基于知识可视化分析
编辑人员丨1周前
目的:基于知识可视化分析,探讨2010至2020年ICU谵妄领域研究进展。方法:收集2010至2020年科学网核心数据库(WOS)及中国知网(CNKI)收录的ICU谵妄相关国内外论著和综述,对文章基本信息进行计量学分析。使用Excel 2019软件对年发文量进行数据分析;使用VOSviewer 1.6.15软件进行国家、机构和作者信息提取,并绘制相关合作网络,以探究该领域主要研究力量分布及合作关系;使用CiteSpace 5.0.R1软件对高频关键词和突增关键词进行分析,并绘制共被引文献网络,以反映ICU谵妄领域近10年来研究基础演化过程,以及该领域前沿热点信息。结果:共收集2010至2020年中文期刊ICU谵妄研究领域论文1 102篇以及英文"Article"和"Review"2 422篇,显示文献发表量均呈逐年上升趋势;在文献质量方面,大多数文章影响因子集中在2~3,影响因子在5及以上的文章占27.9%(337/1 209)。通过可视化分析得出,美国在ICU谵妄研究领域发文量最多(1 152篇)且在国际上交流密切,英格兰和加拿大分列第二位和第三位,分别为220篇及204篇;而从发文机构上看,美国范德堡大学医学院不但在发文量上遥遥领先(149篇),且该领域排名前3位的高影响力作者都来自该机构。目前我国在ICU谵妄研究领域发文量低于上述发达国家,但反映突增情况的Burst指数位列第一(7.09),说明国内作者对该领域的兴趣与投入正在增加。国内机构中首都医科大学护理学院发文量最多(23篇),该机构吴瑛为中文发文量最多的作者(14篇),但并未形成规模较大的科学团体,且各个机构间缺乏交流与合作。关键词共现分析显示,国内外ICU谵妄研究领域的热点主要围绕在机械通气患者谵妄的预防与治疗、右美托咪定对于谵妄的作用及谵妄危险因素等方面。通过对共被引文献网络进行聚类显示,聚类4(风险评估)目前处于不断发展的过程中,是ICU谵妄研究领域的新趋势。结论:目前ICU谵妄领域的国内外研究存在较大差距,其主要研究力量多集中于美国科研机构,未来研究趋势倾向于谵妄相关风险评估。
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编辑人员丨1周前
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黑色素瘤大数据人工智能科研平台的建设及应用
编辑人员丨1周前
目的:建立黑色素瘤大数据人工智能科研平台,实现对临床全量数据的结构化存储和精准化管理,提高临床科研效率。方法:基于规范化、结构化后的全量集成数据,利用大数据技术对复旦大学附属中山医院2007年10月至2020年9月各业务系统数据进行抽取、整合,建立黑色素瘤大数据库。通过人工智能技术深度挖掘疾病特征,采用数据库自带算法进行生存分析。结果:平台提供患者筛选导出、统计分析、追溯原始病例、自动选择数据分析算法与模型等功能,实现了数据可视化、队列预览、秒级响应和一站式智能自动化提取入库等目标,可快速完成研究闭环。经筛选核对,收集到信息完整的患者共152例,其中,男性78例,女性74例;就诊年龄30~97岁,中位年龄61岁;肿瘤部位最多位于足部(133例),最少位于腹股沟区(2例)和背部(2例);肿瘤最大直径1~80 mm,平均最大直径23.55 mm,中位值20 mm;Clark评级集中分布于Ⅳ级(62例);17例患者肿瘤表面伴溃疡形成;10例患者出现淋巴结转移;远处器官转移以肺部为主(5例);超过80%患者的肿瘤组织Breslow厚度<1 mm。对随访满5年且数据资料齐全的49例患者的生存分析显示,年龄≥70岁、Clark评级≥Ⅳ级、Breslow厚度≥4 mm是黑色素瘤预后的危险因素( P<0.05)。 结论:黑色素瘤大数据人工智能科研平台实现了对黑色素瘤临床数据的结构化存储和精准化管理,为临床数据的高效运用提供了解决方案。
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编辑人员丨1周前
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人工智能辅助多参数流式细胞术诊断儿童急性B淋巴细胞白血病微小残留病
编辑人员丨1周前
目的:建立人工智能(AI)模型,评价AI辅助多参数流式细胞术(MFC)诊断儿童急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)微小残留病(MRD)的可行性。方法:以北京大学第一医院门诊B-ALL MRD随访病例227例标本进行AI应用探索性研究,以多维空间密度分布的非监督学习分群聚类算法为基础,对MFC数据进行聚类分析;同时参考人工逻辑设门思路和细胞的抗原表达水平,应用决策树和随机森林等监督学习算法判别细胞分类,并将AI分析B-ALL MRD结果以二维图、降维t-分布领域嵌入算法(t-SNE)和热图进行可视化呈现。通过与人工分析比较,评价AI辅助MFC诊断B-ALL MRD的性能和一致性。结果:AI分析可快速检测出骨髓中B细胞系各阶段淋巴细胞和B-ALL MRD细胞的数量和百分比;且在多次重复检测时各参数差值的变异系数( CV)均为0。AI分析速度较传统人工分析提高4~5倍。与人工分析比较,AI分析B-ALL MRD细胞的查全率(敏感度)和阴性预测值为100%,准确度为82.44%。经人工审核后的AI分析结果再与人工分析比较,去除了假阳性,其查准率(阳性预测值)和准确度均可达100%。人工审核后的AI分析B细胞系各阶段淋巴细胞和B-ALL MRD细胞的百分比与人工分析结果差异无统计学意义( P均>0.05)。 结论:本研究初步建立的AI模型数据分析重复性好、分析速度快,具有较高的查全率(敏感度)和阴性预测值,可用于基于本研究的8色抗体组合方案辅助MFC诊断儿童B-ALL MRD。
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编辑人员丨1周前
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循证护理理念在我国护理学专业教育领域应用现状的可视化分析与展望
编辑人员丨1周前
目的:分析循证护理理念在我国护理学专业教育中的研究热点和发展趋势,为在教学中落实与应用提供参考依据。方法:本研究采用定量分析方法。应用CiteSpace软件,以中国知网、万方数据、维普3个数据库为检索源,呈现并分析2000年至2019年我国护理学专业本科教学中与循证护理理念相关的研究热点和发展趋势。结果:共收集508篇文献,数据分析显示,发文量逐年增加,由2003年的6篇增长至2019年的62篇;发文机构集中于我国各循证医学研究中心的合作单位;研究热点围绕临床护理带教、PBL教学方法、学生评/批判性思维培养等方面,基于循证的教学改革呈多样化和专科化趋势。结论:循证护理理念在我国护理学专业教育领域的应用呈上升态势,未来应当提高学生的证据获取与应用能力。
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编辑人员丨1周前
