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白细胞共同抗原相关磷酸酶受体在大鼠视觉可塑性调控中的作用
编辑人员丨6天前
目的:探讨白细胞共同抗原相关磷酸酶受体(LAR)在大鼠视觉可塑性调控中的作用。方法:选取初生Wistar大鼠40只,按照随机数字表法分为5个组,每组8只,分别于出生后1、3、5、7和9周各处死一组幼鼠。另选取32只10周龄健康清洁级成年Wistar大鼠32只,按照随机数字表法分为正常对照组、双眼形觉剥夺(BFD)组、氟西汀组和BFD+氟西汀组,每组8只。正常对照组大鼠不做任何干预,其余各组根据分组分别进行双眼眼睑缝合2周和/或0.2 mg/ml氟西汀无菌水溶液喂养4周。采用免疫荧光法观察各组大鼠视皮层LAR和硫酸软骨素多糖(CSPGs)的表达分布,采用Western blot法检测各组大鼠视皮层LAR表达量。结果:大鼠视皮层LAR表达分布于细胞膜、细胞质及轴突,CSPGs表达分布于细胞间质;大鼠视皮层LAR和CSPGs荧光强度随周龄的增大出现增强的趋势。出生后1、3、5、7、9周大鼠视皮层LAR蛋白相对表达量分别为(100.00±3.20)%、(108.37±2.26)%、(113.69±2.33)%、(131.83±3.78)%和(140.11±4.02)%,总体比较差异有统计学意义( F=31.70, P=0.001)。大鼠视皮层LAR蛋白的相对表达量随视觉发育周龄的增大而逐渐增加(标准化 β=0.961, P=0.007)。正常对照组成年大鼠视皮层LAR荧光强度最强,氟西汀组、BFD组和BFD+氟西汀组视皮层LAR荧光强度显著下降。正常对照组、氟西汀组、BFD组和BFD+氟西汀组大鼠视皮层LAR蛋白相对表达量分别为(100.00±2.96)%、(81.02±2.77)%、(71.99±3.09)%和(52.90±2.01)%,总体比较差异有统计学意义( F=18.16, P=0.015),其中氟西汀组、BFD组及BFD+氟西汀组LAR蛋白相对表达量均较正常对照组明显下降,差异均有统计学意义( t=31.30、36.10、41.72,均 P<0.01)。 结论:视皮层LAR可能作为CSPGs特异性受体参与视觉可塑性的调控。
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编辑人员丨6天前
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基于生物信息学探讨SARS-CoV-2介导免疫炎症反应诱发动脉粥样硬化进展的潜在机制与防治中药筛选
编辑人员丨2023/8/5
目的 应用生物信息学技术,从免疫炎症角度探索严重急性呼吸综合征冠状病毒-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)感染诱导动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)进展的核心靶点及重要通路,进而预测潜在防治中药.方法 从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中获取新型冠状病毒肺炎患者和动脉粥样硬化患者芯片数据,利用"limmar"包及"Venn"包筛选2种疾病的共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对共同DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopediaofgenes and genomes,KEGG)分析,注释其功能及重要通路.对2组基因集进行免疫细胞和免疫功能打分,评估免疫细胞浸润水平.利用STRING数据库,构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络;通过Cytoscape的CytoHubba插件识别中枢(hub)基因,引入另外2组数据集对hub基因进行外部验证得到核心基因,并对核心基因分别进行免疫浸润分析及基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA),最后通过Coremine Medical数据库预测调控核心基因的潜在中药.结果 得到新型冠状病毒肺炎相关基因7898个,AS进展相关基因471个;共同DEGs51个,其中高表达基因32个,低表达基因19个.GO与KEGG分析结果显示,共同DEGs主要定位在氯氰菊酯-包膜内吞囊、血小板α颗粒、吞噬泡膜与小泡,经由Toll样受体信号通路、中性粒细胞胞外陷阱形成、补体和凝血级联反应等信号通路,参与髓样分化因子(myeloid differentiation factor 88,MyD88)依赖性Toll样受体信号通路转导、白细胞介素-8(interleukin-8,IL-8)生成与正向调节、IL-6生成与正向调节等生物途径,发挥调节烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸氧化酶活性、Toll样受体结合、脂肽及糖胺聚糖结合等功能.免疫浸润分析结果展现了新型冠状病毒肺炎与AS免疫微环境状态.经筛选共获得5个hub基因,Toll样受体2(Toll-likereceptor2,TLR2)、分化抗原簇 163(cluster of differentiation 163,CD163)及补体 C1q 亚组分亚单位 B(complement C1 q subcomponent subunit B,C1QB)基因通过了外部验证,成为核心基因.核心基因在免疫浸润分析及GSEA富集分析中均显示出与免疫过程和炎症反应具有较强相关性.川芎、桃仁、当归、黄芩、蒲公英、太子参、黄精等35味中药可作为潜在防治药物.结论 TLR2、CD163及C1QB是SARS-CoV-2介导免疫炎症反应促进AS进展的核心分子,靶向预测的中药是延缓SARS-CoV-2感染后AS进展的潜在药物.
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编辑人员丨2023/8/5
