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一例婴儿型Sandhoff病伴嗜酸性粒细胞增多症患儿的临床特点及遗传学分析
编辑人员丨2天前
目的:对1例临床表现为癫痫,发育迟缓并倒退的患儿进行临床和遗传学分析。方法:采用荧光底物法分别测定外周血白细胞氨基己糖苷酶A(hexosaminidase A,Hex A)及氨基己糖苷酶A和B(hexosaminidase A&B,Hex A&B)活性。采集患儿及其家系成员的外周血样,应用二代测序技术对患者进行全外显子组测序,并用Sanger测序方法对变异基因的家系分布进行验证。结果:患儿血白细胞Hex A及Hex A&B酶活性下降。患儿 HEXB基因存在杂合变异,变异位点分别为c.1260_1263del和c.1601G>C。患儿母亲、大哥及大姐为c.1260_1263del杂合携带者,c.1601G>C为新生变异,患儿父母、三个哥哥及一个姐姐均未检出该变异。患儿外周血及骨髓细胞学检查均见嗜酸性粒细胞明显增高。 结论:患儿确诊为婴儿型Sandhoff病。 HEXB基因c.1260_1263del和c.1601G>C变异可能是该患儿的病因。嗜酸性粒细胞增多症可见于婴儿型Sandhoff病。
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编辑人员丨2天前
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一例婴儿型Sandhoff病患儿的HEXB基因突变分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 鉴定1例婴儿型Sandhoff病患儿HEXB基因的致病突变.方法 提取患儿外周血样DNA,应用PCR技术扩增其HEXB基因,并对PCR扩增产物进行直接测序,参考SNP数据库及ESP数据库进行比对.应用PubMed Protein BLAST系统分析HEXB基因编码的氨基已糖苷酶(Hex)的β亚基突变氨基酸的跨种属保守性;用PubMed BLAST CD-search系统分析Hex蛋白β亚基结构缺失所丧失的蛋白功能域;用PolyPhen-2、Mutation Taster及SIFT软件对新突变进行功能预测;通过全外显子基因组测序明确患儿有无其他可疑突变.结果 患儿携带HEXB基因c.1652G>A(p.Cys551Tyr)和c.1389C>G(p.Tyr463?)复合杂合突变.c.1389C>G(p.Tyr463?)在SNP数据库中收录,经PubMed BLAST CD-search系统分析其编码的Hex蛋白β亚基结构存在2个关键的蛋白功能域的丧失,预测为可能有害突变;c.1652G>A(p.Cys551Tyr)在SNP数据库及ESP数据库中均无收录,为未报道过的新突变,经PolyPhen-2、Mutation Taster及SIFT预测软件预测为可能有害突变.经全外显子基因组测序明确患儿除存在上述HEXB基因突变外不存在其他致病突变.结论 HEXB基因c.1652G>A(p.Cys551Tyr)和c.1389C>G(p.Tyr463?)复合杂合突变可能为该患儿的致病原因.基因突变检测可以为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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婴儿Sandhoff病临床特点及基因型分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨婴儿Sandhoff病的临床和HEXB基因突变特点.方法 回顾分析2例婴儿Sandhoff病先证者及其家系的临床资料.结果 2例患儿男女各1例,均在婴儿期起病,首发表现均为发育落后,有过度惊吓、癫痫、腱反射增强、眼底樱桃红斑等,均出现进行性发育倒退,2岁左右基本丧失一切运动和认知能力.头颅MRI检查男性患儿未见异常;女性患儿显示双侧基底节异常信号,小脑萎缩.2例患儿HEXB基因分别为杂合、纯合突变,突变位点系首次报道.男性患儿在学龄前期死亡,女性患儿仍在随访中.结论 精神运动发育迟缓和倒退是婴儿Sandhoff病最早和最常见的表现,丘脑及基底节区异常信号可能是其特征性表现,髓鞘发育不良和脑萎缩也很常见.基因检测有助于确诊.
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编辑人员丨2023/8/6
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婴儿型一例Sandhoff病临床特点及基因突变分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨婴儿型Sandhoff病临床及基因突变特点.方法 回顾性分析1例婴儿型Sandhoff病患儿的临床资料以及基因检测结果.结果 高通量测序结合Sanger测序验证结果显示患儿携带HEXB基因c.1540-1541del(p.Trp514fs)和c.1404delT(p.Pro468fs),依据美国医学遗传学和基因组学协会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南,判定该变异为致病性变异.结论 Sandhoff disease(SD)是由HEXB基因突变引起β-氨基己糖苷酶活性不足,从而导致GM2神经节苷脂在神经系统大量积累,是一种罕见的遗传性溶酶体病,目前缺乏有效的治疗方法.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于生物信息学分析筛选和鉴定肝细胞癌预后相关的代谢基因
编辑人员丨2023/8/5
目的:寻找与肝癌发病机制和预后相关的潜在代谢基因并构建预测肝细胞癌(hepatocellular carcino-ma,HCC)患者预后模型.方法:通过GSEA数据库获得所有与代谢途径相关的基因,从TCGA数据库下载肝癌和正常组织的基因表达数据.将二者的基因相映射,分析这些代谢差异表基因(DEGs)在肝癌标本中的表达情况.然后用单因素Cox回归分析筛选与预后相关的代谢基因.在此基础上,使用LASSO分析进一步筛选预后基因,构建预后风险模型,分析高、低风险组预后情况.并对预后模型中的基因进行KE GG通路富集分析和GO分析.采用单因素Cox分析和多因素Cox回归分析,对预后模型进行独立预后分析,同时绘制No-mogram图对患者预后进行评估.最后,使用GEPIA2数据库比较预后基因在肿瘤组织和正常组织中的表达,分析预后基因对生存期的影响.最后利用GEO数据库中的肝癌样本(GSE14520)进行了外部验证.结果:共获得代谢相关基因959个.这些代谢基因在肝癌样本中表达差异显著的基因有156个,其中上调基因105个,下调基因51个.随后,通过对这些DEGs进行单变量Cox分析,得到58个预后相关的候选基因.在此基础上,通过LASSO分析构建了11个基因的预后模型.预后模型中高风险组较低分险组预后差(P<0.05).该模型可在GSE14520中得到复制.预后模型中基因涉及的通路主要有嘧啶代谢、谷胱甘肽代谢、药物代谢、碳代谢、嘌呤代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢.在这11个基因中,生存分析显示ATIC、ENO1、G6PD、GNPDA1、HEXB、ME1、RRM1、RRM2、UCK2这9个基因高表达和CYP2C9的低表达与肝癌患者不良预后有统计学相关性(P<0.05).结论:本研究建立的11个基因模型和Nomogram图可以帮助临床医生评估肝癌患者的预后.
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编辑人员丨2023/8/5
