虽然先天性肺气道畸形（congenital pulmonary airway malformation, CPAM）发病涉及的分子机制并不清楚，但已经发现许多潜在基因与肺囊肿的形成相关。现综述CPAM气管囊性病变结构特点，以及成纤维细胞生长因子、性别决定区域-2基因和其他信号通路在CPAM发生、发展中的调节作用。

[目的]探究三峡库区干流和支流水体硫氧化菌群落组成和多样性及其与水体理化性质的相关性.[方法]于2017年3月在三峡库区支流和干流共选取9个采样点,测量各采样点水体理化参数,针对水体样品的soxB基因进行系统发育分析、聚类分析和多样性分析,并分析水体理化性质与硫氧化菌群落组成和多样性的相关性.[结果]克隆文库分析显示,本研究的三峡库区水体样品中硫氧化菌分属于α-Proteobacteria和p-Proteobacteria纲,其中β-Proteobacteria的硫氧化菌是群落构成主体,在于流和支流的采样点中相对丰度均高于95.6％.聚类分析和主坐标分析(PCoA)显示,各支流采样点之间以及支流样点和其对应干流样点之间的硫氧化菌群落构成差异较大,而干流采样点间硫氧化菌群落构成差异较小.Mantel检验结果显示,硫氧化菌群落组成与水体的温度、盐度、溶氧量、藻含量和pH等理化参数呈显著(P＜0.05)相关.Pearson相关性分析显示硫氧化菌的群落多样性与藻含量和DIC呈现显著负相关.[结论]三峡库区支流和干流水体中硫氧化菌主要由β-Proteobacteria纲构成,库区干流水体中硫氧化菌群落构成较为相似,而不同支流水体中的硫氧化菌群落构成差异较明显,并且支流和对应干流交汇处的水体中硫氧化菌群落组成差异明显,水体理化性质是导致这一差异的重要原因之一.

[目的]探究西藏热泉沉积物中硫氧化细菌群落多样性及其环境影响因素.[方法]选取西藏5个地热区的25个热泉样点,现场测量各采样点的水体理化参数,并采集热泉水和沉积物样品.通过功能基因(硫代硫酸盐水解酶编码基因:soxB)克隆文库分析方法,研究沉积物样品中硫氧化细菌群落的组成和多样性,并统计分析其与环境参数之间的相关性.[结果]克隆文库分析结果显示,西藏热泉沉积物样品中的硫氧化细菌主要分属于α-Proteobacteria、β-Proteobacteria和γ-Proteobacteria纲.研究样品中的硫氧化菌群落香农指数与溶解有机碳的浓度(R=0.489,P＜0.05)呈显著正相关.另外,统计发现西藏各热泉之间的硫氧化菌群落组成差异较大,其优势硫氧化细菌种群差异明显,大多数样点的优势硫氧化细菌种群为β-Proteobacteria,少量样点以αt-Proteobacteria和γ-Proteobacteria为主.Mantel检验结果显示,西藏热泉样品中的硫氧化细菌群落组成与温度、硫化物、电导率、海拔、总溶解固体和pH显著(P＜0.05)相关.[结论]西藏热泉沉积物中的硫氧化细菌群落广泛分布,且主要以变形菌门为主.地理隔离和理化差异导致了热泉沉积物样品间的硫氧化菌群落组成差异.

[目的]探究化能自养硫氧化细菌Halothiobacillus sp.LS2介导的以乙炔为电子受体的厌氧硫氧化反应.[方法]稀释涂布法测定细胞生长情况,离子色谱仪测试硫氧化动力学中SO42-和S2O32-以及基于相对荧光定量法的基因表达分析.[结果]尽管菌株LS2在以氧气为电子受体时的最大反应速率Vmax更高,但在厌氧条件下且以乙炔为电子受体时,菌株LS2的生长量是氧气为电子受体时的2倍,且硫氧化酶基因soxB的表达量显著高于氧气作为电子受体时.[结论]菌株LS2不仅可以以乙炔为电子受体完成厌氧硫氧化反应,且这一代谢过程的产能效率较有氧硫氧化过程更高.本研究首次发现了微生物介导的以乙炔为电子受体的厌氧硫氧化反应,对丰富硫的生物地球化学循环理论有积极意义.

沉积物中微生物介导的硫循环在有机物分解和养分循环中发挥重要作用,但目前我们对水产养殖生态系统中的参与硫酸盐还原和硫氧化过程的微生物多样性及其调控机制仍知之甚少.[目的]探究硫酸盐还原菌(sulfate-reducing bacteria,SRB)和硫氧化菌(sulfur-oxidizing bacteria,SOB)的垂直分布特征及其主要的环境驱动因素.[方法]本研究利用高通量测序和荧光定量PCR(qPCR)分析了罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)养殖池塘沉积物表层(0-1 cm)、中层(10-11 cm)和底层(20-21 cm)中的细菌、SRB和SOB的丰度、多样性和群落组成.[结果]细菌(16S rRNA)、硫酸盐还原菌(dsrB)和硫氧化菌(soxB)的基因拷贝数呈现着从表层到中层急剧骤降的趋势(ANOVA,P＜0.05),但中层和底层样品之间的差异却并不显著(P＞0.05),以及α多样性分析显示3个群体的物种丰富度和均匀度都随深度而逐步降低,这都说明硫循环过程主要发生于沉积物的表层.γ-、δ-和 β-变形菌分别是细菌、SRB和SOB的优势类群;其中SRB以Desulfobacca属和脱硫八叠球菌属(Desulfosarcina)为主,前者在表层有着最低的比重,而后者却与之相反;硫杆菌(Thiobacillus)作为细菌和SOB的优势属,更广泛地分布于中层沉积物中.RDA分析和Mantel检验揭示了影响细菌群落的主要环境因子是NO3-、SO42-、TOC和TON,而SRB的群落变异主要是由As、TON、NO3-和Pb所驱动,以及SOB的群落变化则主要响应了 TC、NO2-、NH4+和TON浓度.[结论]养殖池塘底栖的细菌、SRB和SOB的丰度、多样性和群落结构的垂直分布特征可能受到多种环境因素共同的影响.