目的:研究人乳头瘤病毒(HPV) 16型LCR基因在湖北地区部分宫颈癌组织中的变异特点,通过系统发生学分析探讨宫颈癌患者感染的HPV16型变异株的流行型别及特征.方法:从22例宫颈癌手术切除标本中提取组织DNA,用HPV16 LCR特异性引物进行PCR扩增,对扩增的LCR产物片段进行测序,用Paup 4.0软件使用邻接法对HPV16变异株进行系统发生学分析.结果:在22例宫颈癌组织中LCR基因存在着12个位点的基因变异.高频率突变位点有5个.其中第7 521位核苷酸由G变异为A,变异频率为100％;第7 730位核苷酸由A变异为C,变异频率为86.4％,第7 842位核苷酸由G变异为A,变异频率为77.3％,第7 714位由T变异为G,变异频率为31.8％;第7 930位核苷酸由C变异为T,变异频率为31.8％.HPV 16 LCR中的5个高频位点,均位于可与多个转录因子结合的区域.对LCR基因进行的系统发生学分析表明,湖北地区流行的HPV16病毒株主要为亚洲型(As)变异体(77.2％),其次为欧洲型(E)(22.8％),没有发现非洲-1型(Af-1),非洲-2型(Af-2)和亚洲美洲型(AA) HPV16变异体.结论:湖北地区宫颈癌组织中LCR存在着一定程度的基因变异,其中一些高频位点与国内、外报道的结果有明显差异,可能是湖北地区LCR的突变热点.
作者：张帆；丁晓华；熊斌
来源：武汉大学学报（医学版） 2013 年 34卷 5期
