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目的:探究肺结核患者血清外泌体中差异表达的微小RNAs(miRNAs)及其功能.方法:分子排阻法和超滤离心法提取纯化实验组及对照组血清外泌体,粒径检测、透射电镜和Western blot进行鉴定,miRNeasy Micro Kit提取外泌体总RNA;Illumina HiSeq2500高通量测序检测miRNAs表达谱;生物信息学分析实验组和对照组差异表达的miRNAs并预测其靶基因及其靶基因潜在功能.结果:分子排阻和超滤离心获得的微囊泡直径为30~100 nm、形态完整、球形、大小较为均一,表达蛋白TSG101、HSP70、CD63、Calnexin无表达.高通量测序分析显示,实验组显著差异表达的miRNAs共63个,其中32个上调表达,31个下调表达.GO富集分析显示差异表达的miRNAs靶基因生物学过程方面主要富集于细胞组织代谢,细胞组分方面主要富集于细胞器和细胞质,分子功能方面主要富集于催化活性、核酸结合转录因子活性.KEGG富集分析显示差异表达的miRNAs可显著富集于肾素-血管紧张素系统(RAS)、转化生长因子(TGF)、环腺苷酸单磷酸-蛋白激酶A(cGMP-PKG)等信号通路,并参与赖氨酸调节、甘油磷脂途径及类固醇激素生物合成等代谢通路和蛋白质消化吸收、神经突触囊泡循环等生物过程.结论:肺结核患者血清外泌体miRNAs表达谱与对照组比较差异具有统计学意义,差异表达的miRNAs可能通

作者:邢佳;曾娅莉;邓建军

来源:陕西医学杂志 2023 年 52卷 7期

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作者:
邢佳;曾娅莉;邓建军
来源:
陕西医学杂志 2023 年 52卷 7期
标签:
微小RNAs 肺结核 外泌体 信号通路 高通量测序 富集 miRNAs Pulmonary tuberculosis Exosomes Signaling pathway High-throughput sequencing Enrichment
目的:探究肺结核患者血清外泌体中差异表达的微小RNAs(miRNAs)及其功能.方法:分子排阻法和超滤离心法提取纯化实验组及对照组血清外泌体,粒径检测、透射电镜和Western blot进行鉴定,miRNeasy Micro Kit提取外泌体总RNA;Illumina HiSeq2500高通量测序检测miRNAs表达谱;生物信息学分析实验组和对照组差异表达的miRNAs并预测其靶基因及其靶基因潜在功能.结果:分子排阻和超滤离心获得的微囊泡直径为30~100 nm、形态完整、球形、大小较为均一,表达蛋白TSG101、HSP70、CD63、Calnexin无表达.高通量测序分析显示,实验组显著差异表达的miRNAs共63个,其中32个上调表达,31个下调表达.GO富集分析显示差异表达的miRNAs靶基因生物学过程方面主要富集于细胞组织代谢,细胞组分方面主要富集于细胞器和细胞质,分子功能方面主要富集于催化活性、核酸结合转录因子活性.KEGG富集分析显示差异表达的miRNAs可显著富集于肾素-血管紧张素系统(RAS)、转化生长因子(TGF)、环腺苷酸单磷酸-蛋白激酶A(cGMP-PKG)等信号通路,并参与赖氨酸调节、甘油磷脂途径及类固醇激素生物合成等代谢通路和蛋白质消化吸收、神经突触囊泡循环等生物过程.结论:肺结核患者血清外泌体miRNAs表达谱与对照组比较差异具有统计学意义,差异表达的miRNAs可能通

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