目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法探究葡萄糖代谢参与缺血性脑卒中(IS)的机制及其关键基因.方法 本实验时间为2022年11月—2023年6月.从GEO数据库GPL6883平台下载IS芯片数据集GSE16561,其包括39例IS患者(IS组)和24例健康受试者(对照组)外周血的总RNA表达谱数据,对其进行预处理,基于WGCNA筛选与IS组相关性最强的模块内基因,将其与在GeneCards数据库选取的相关性得分＞5分的基因取交集,得到IS葡萄糖代谢相关基因并对其进行基因本体论(GO)功能富集分析.基于蛋白质相互作用(PPI)网络分析,采用机器学习算法[随机森林(RF)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)算法]筛选IS葡萄糖代谢关键基因.比较GSE16561中IS组和对照组IS葡萄糖代谢关键基因表达量,同时绘制IS葡萄糖代谢关键基因诊断IS的ROC曲线,通过曲线下面积(AUC)评估其诊断效能.结果 WGCNA共得到了11个基因共表达模块,其中棕色模块与IS组相关性最强(r=0.56,P=2×10-6),其共包含461个基因.GeneCards数据库中相关性得分＞5分的基因共2 386个,将其与棕色模块基因取交集,共得到85个IS葡萄糖代谢相关基因.GO功能富集分析结果显示,IS葡萄糖代谢相关基因主要涉及的生物学过程(BP)为对肽的反应、对肽激素的反应、细胞碳水化合物代谢过程,主要涉
作者：王曼曼；宁文华；王海明；刘伊滢；李思颖；高京；魏向阳
来源：实用心脑肺血管病杂志 2024 年 32卷 5期
