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目的 对2014-2019年长沙市风疹病毒进行分子流行病学、基因特征及溯源研究.方法 风疹疑似患者鼻咽拭子先通过荧光逆转录聚合酶链反应(real time-PCR,RT-PCR)进行风疹病毒核酸检测,风疹病毒阳性标本再进行RT-PCR扩增E1基因片段,序列拼接后构建进化树及氨基酸同源性分析.结果 截至2019年10月31日,收集到市区上送风疹疑似病例标本1 726份,其中阳性87份(5.04%),2014年至2019年风疹阳性率分别为1.27%(6/471)、1.70%(4/235)、1.83%(4/218)、0%(0/133)、11.18%(18/161)和10.83% (55/508).2018年开始风疹病例显著增多.感染人群中62.07% (54/87)分布于10~20岁.本研究共获得31株风疹病毒序列,2014年3株2B型,1株1E型;2016年1株2B型;2018年10株1E型;2019年16株1E型.GenBank序列号为MN251800-MN251830.进化树分析显示2018-2019年毒株与香港地区本土循环流行的1E基因型毒株位于同一分支,区别于2018年以前长沙市地区流行的毒株.毒株之间的核苷酸同源性为99.5%~100.0%,与WHO参考株核苷酸同源性为96.0%~96.4%.E1基因第324位A突变为T,第329位F突变为L,关键位点未发生变化.结论 2018-2019年长沙地区风疹流行毒株为不同地区同一1E基因型毒株感染造成,应加强本地学生及成年人中风疹疫苗接种计划及风疹病毒学的

作者:黄政;李灵之;肖姗;姚栋;欧新华

来源:中国热带医学 2020 年 20卷 6期

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作者:
黄政;李灵之;肖姗;姚栋;欧新华
来源:
中国热带医学 2020 年 20卷 6期
标签:
风疹病毒 进化树 1E基因型 基因特征
目的 对2014-2019年长沙市风疹病毒进行分子流行病学、基因特征及溯源研究.方法 风疹疑似患者鼻咽拭子先通过荧光逆转录聚合酶链反应(real time-PCR,RT-PCR)进行风疹病毒核酸检测,风疹病毒阳性标本再进行RT-PCR扩增E1基因片段,序列拼接后构建进化树及氨基酸同源性分析.结果 截至2019年10月31日,收集到市区上送风疹疑似病例标本1 726份,其中阳性87份(5.04%),2014年至2019年风疹阳性率分别为1.27%(6/471)、1.70%(4/235)、1.83%(4/218)、0%(0/133)、11.18%(18/161)和10.83% (55/508).2018年开始风疹病例显著增多.感染人群中62.07% (54/87)分布于10~20岁.本研究共获得31株风疹病毒序列,2014年3株2B型,1株1E型;2016年1株2B型;2018年10株1E型;2019年16株1E型.GenBank序列号为MN251800-MN251830.进化树分析显示2018-2019年毒株与香港地区本土循环流行的1E基因型毒株位于同一分支,区别于2018年以前长沙市地区流行的毒株.毒株之间的核苷酸同源性为99.5%~100.0%,与WHO参考株核苷酸同源性为96.0%~96.4%.E1基因第324位A突变为T,第329位F突变为L,关键位点未发生变化.结论 2018-2019年长沙地区风疹流行毒株为不同地区同一1E基因型毒株感染造成,应加强本地学生及成年人中风疹疫苗接种计划及风疹病毒学的

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