目的 分析2011-2017年上海市风疹病毒(rubella virus,RV)野毒流行株的分子流行病学特征.方法 选择2011-2017年上海市报告疑似麻疹/风疹病例中经实验室诊断排除麻疹,确定为风疹病例所对应的咽拭子标本进行RV分离,用一步法逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增病毒E1基因,扩增产物进行核苷酸序列测定,并进行分子流行病学分析.结果 684份咽拭子标本共分离到395株RV,获得其中377株RV的739个核苷酸(nucleotide,nt)(nt8731～9469)序列.序列同源性分析表明,377株RV分离株分别属于两个不同的基因型,109株为1E基因型,与来自中国的参考株(RVi/Shandong.CHN/0.02/)亲缘性关系更近,其他分离株均为2B基因型,5株分离株在2B基因型中成一个独立小分支.377株RV分离株大部分的核苷酸突变为无义突变,氨基酸(amino acid,aa)序列高度保守,除1株外所有1E基因型RV分离株在E1蛋白aa338位点发生相同突变(亮氨酸→苯丙氨酸),而2B基因型分离株以及其他基因型WHO参考株在该位点均未发生改变.结论 2011-2017年上海市存在两种不同基因型RV流行,其中2011-2013年1E基因型为优势基因型.继2011年首次监测到2B基因型RV后,便持续存在流行,并自2014年起成为上海市的优势基因型.

作者：杨玉颖；王静；唐伟；朱贞；李云逸；王嘉瑜；李崇山；刘畅

来源：中华实验和临床病毒学杂志 2018 年 32卷 6期