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目的:了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)基因型及基因特征。方法:2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本,经核酸检测和病毒分离后,扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列,即E1基因的739个核苷酸片段,然后与世界卫生组织(World Health Organization, WHO)推荐的13个基因型的32株参考株序列进行比对以确定基因型别,同时与我国其他省份流行RV株序列进行基因亲缘性关系分析。结果:本研究分离获得4株RV病毒株,经基因亲缘性关系分析显示,这些病毒株分属于1E-Cluster A基因亚型和2B-Cluster C基因亚型,与我国同期其他省份RV流行趋势基本一致。青海省4株病毒株在氨基酸水平高度保守,但也存在地区特异性的突变位点。结论:本研究为青海省风疹防控策略的制定提供了一定的实验室数据。

作者:李崇亥;汪春翔;赵生仓;王晓彤;周青;朱贞;范丽霞

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2020 年 34卷 6期

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作者:
李崇亥;汪春翔;赵生仓;王晓彤;周青;朱贞;范丽霞
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2020 年 34卷 6期
标签:
青海省 风疹病毒 1E基因型 2B基因型 Qinghai Province Rubella virus 1E genotype 2B genotype
目的:了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)基因型及基因特征。方法:2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本,经核酸检测和病毒分离后,扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列,即E1基因的739个核苷酸片段,然后与世界卫生组织(World Health Organization, WHO)推荐的13个基因型的32株参考株序列进行比对以确定基因型别,同时与我国其他省份流行RV株序列进行基因亲缘性关系分析。结果:本研究分离获得4株RV病毒株,经基因亲缘性关系分析显示,这些病毒株分属于1E-Cluster A基因亚型和2B-Cluster C基因亚型,与我国同期其他省份RV流行趋势基本一致。青海省4株病毒株在氨基酸水平高度保守,但也存在地区特异性的突变位点。结论:本研究为青海省风疹防控策略的制定提供了一定的实验室数据。

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