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目的 通过分析系统性硬化症伴间质性肺病(systemic sclerosis with interstitial lung dis-ease,SSc-ILD)患者与健康对照肺组织基因表达情况,筛选出SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点,并探究其参与SSc-ILD的可能发病机制.方法 计算2个芯片(GSE76808、GSE81292)中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),取2个芯片共同表达的DEGs,对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析.CTD、GENE和DisGeNET数据库验证SSc-ILD的相关基因.结果 2个芯片共同表达的DEGs 230个,其中59个基因表达上调,171个基因表达下调.CTD数据库中与SSc和ILD存在关联的基因10694个;GENE数据库中与SSc和ILD存在关联的基因50个;DisGeNET数据库中与SSc有关的基因980个.结合芯片和3个数据库分析结果,IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能是SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点.结论 IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能参与了SSc-ILD的发病机制,有望作为SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点.

作者:黄碧青;李菁

来源:中华临床免疫和变态反应杂志 2021 年 15卷 3期

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作者:
黄碧青;李菁
来源:
中华临床免疫和变态反应杂志 2021 年 15卷 3期
标签:
系统性硬化症 间质性肺病 差异表达基因 标志物 治疗靶点
目的 通过分析系统性硬化症伴间质性肺病(systemic sclerosis with interstitial lung dis-ease,SSc-ILD)患者与健康对照肺组织基因表达情况,筛选出SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点,并探究其参与SSc-ILD的可能发病机制.方法 计算2个芯片(GSE76808、GSE81292)中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),取2个芯片共同表达的DEGs,对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析.CTD、GENE和DisGeNET数据库验证SSc-ILD的相关基因.结果 2个芯片共同表达的DEGs 230个,其中59个基因表达上调,171个基因表达下调.CTD数据库中与SSc和ILD存在关联的基因10694个;GENE数据库中与SSc和ILD存在关联的基因50个;DisGeNET数据库中与SSc有关的基因980个.结合芯片和3个数据库分析结果,IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能是SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点.结论 IL-6、CXCL8、CCL2、IL-1B、ICAM1、JUN、PTGS2、TNFAIP3可能参与了SSc-ILD的发病机制,有望作为SSc-ILD的潜在标志物和治疗靶点.

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