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目的 初步了解青海省结核分枝杆菌临床分离株基因多态性和基因分型特征.方法 2009-2012年收集青海省疾病预防控制中心分离的结核分枝杆菌临床分离株,提取DNA,对15个可变数目串联重复序列(VNTR)位点进行PCR扩增和产物电泳分析,使用BioNumerics软件对菌株进行聚类分析.结果 共检测251株结核分枝杆菌临床分离株的15个VNTR位点,显示这些菌株有明显的基因多态性,15个VNTR位点中Hunter-Gaston指数>0.6的VNTR位点有6个,位点分辨能力最高的是MIRU26,经聚类分析,可分为4个基因群,238个基因型.4个基因群分别占4.9%、91.9%、1.6%和1.6%.结论 青海省流行的结核分枝杆菌菌株存在明显的VNTR基因多态性.

作者:李斌;刘海灿;王兆芬;马永成;苏效东;蒋明霞;万康林;刘寿;赵秀芹

来源:中华流行病学杂志 2015 年 36卷 10期

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作者:
李斌;刘海灿;王兆芬;马永成;苏效东;蒋明霞;万康林;刘寿;赵秀芹
来源:
中华流行病学杂志 2015 年 36卷 10期
标签:
结核分枝杆菌 基因分型 多位点数目可变串联重复序列 Hunter-Gaston指数 Mycobacterium tuberculosis Genotyping Variable number tandem repeats Hunter-Gaston index
目的 初步了解青海省结核分枝杆菌临床分离株基因多态性和基因分型特征.方法 2009-2012年收集青海省疾病预防控制中心分离的结核分枝杆菌临床分离株,提取DNA,对15个可变数目串联重复序列(VNTR)位点进行PCR扩增和产物电泳分析,使用BioNumerics软件对菌株进行聚类分析.结果 共检测251株结核分枝杆菌临床分离株的15个VNTR位点,显示这些菌株有明显的基因多态性,15个VNTR位点中Hunter-Gaston指数>0.6的VNTR位点有6个,位点分辨能力最高的是MIRU26,经聚类分析,可分为4个基因群,238个基因型.4个基因群分别占4.9%、91.9%、1.6%和1.6%.结论 青海省流行的结核分枝杆菌菌株存在明显的VNTR基因多态性.

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