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目的:探究Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting RNA,piRNA)与糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的相关性。方法:使用高通量测序技术检测DN患者肾组织(实验组)及肾肿瘤患者肿瘤旁肾组织(对照组)中piRNA的差异表达谱,通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析对差异表达piRNA的生物学功能进行阐述。采用实时荧光定量PCR检测目标piRNA在DN患者血清中的表达水平。采用Spearman相关分析法分析血清目标piRNA与DN患者临床指标之间的相关性。结果:高通量测序结果显示,以|log 2差异倍数|≥2且 P<0.05为筛选条件,与对照组相比,DN组显著差异表达的piRNA共127个,其中99个表达上调,28个表达下调,上调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-161686、piRNA-hsa-349255、piRNA-hsa-355720、piRNA-hsa-151229及piRNA-hsa-154959,下调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-1929960、piRNA-hsa-174194、piRNA-hsa-148658、piRNA-hsa-172594及piRNA- hsa-172421。PCR验证 P值较小且表达量较高的3个上调和3个下调基因,结果显示,血清piRNA- hsa-77976的表达在DN患者中显著下调( P=0.028),与测序结果一致,其余基

作者:雷寓淇;周思捷;乔颖进;高丹;刘风勋;吕林晓;潘少康;刘东伟;刘章锁

来源:中华肾脏病杂志 2023 年 39卷 4期

知识库介绍

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作者:
雷寓淇;周思捷;乔颖进;高丹;刘风勋;吕林晓;潘少康;刘东伟;刘章锁
来源:
中华肾脏病杂志 2023 年 39卷 4期
标签:
糖尿病肾病 RNA,未翻译 RNA,小分子干扰 高通量测序 生物信息学分析 Diabetic nephropathies RNA, untranslated RNA, small interfering High-throughput sequencing Bioinformatics analysis
目的:探究Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting RNA,piRNA)与糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的相关性。方法:使用高通量测序技术检测DN患者肾组织(实验组)及肾肿瘤患者肿瘤旁肾组织(对照组)中piRNA的差异表达谱,通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析对差异表达piRNA的生物学功能进行阐述。采用实时荧光定量PCR检测目标piRNA在DN患者血清中的表达水平。采用Spearman相关分析法分析血清目标piRNA与DN患者临床指标之间的相关性。结果:高通量测序结果显示,以|log 2差异倍数|≥2且 P<0.05为筛选条件,与对照组相比,DN组显著差异表达的piRNA共127个,其中99个表达上调,28个表达下调,上调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-161686、piRNA-hsa-349255、piRNA-hsa-355720、piRNA-hsa-151229及piRNA-hsa-154959,下调前5位的piRNA分别是piRNA-hsa-1929960、piRNA-hsa-174194、piRNA-hsa-148658、piRNA-hsa-172594及piRNA- hsa-172421。PCR验证 P值较小且表达量较高的3个上调和3个下调基因,结果显示,血清piRNA- hsa-77976的表达在DN患者中显著下调( P=0.028),与测序结果一致,其余基

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