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遗传性对称性色素沉着症1例患儿的遗传学分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨1例 ADAR1基因变异所致的遗传性对称性色素沉着症(DSH)患儿的临床及遗传学特征。 方法:选取2020年6月因"手背不规则色素斑疹"就诊于郑州大学第一附属医院皮肤科的1例DSH患儿作为研究对象,收集家系成员的临床资料。对患儿进行全外显子组测序(WES),并用Sanger测序进行家系验证。进一步采用SWISS-MODEL预测野生型及变异型蛋白的三级结构。结果:患儿为13岁男性,手背存在对称性色素沉着和色素脱失斑,临床诊断为DSH。WES及Sanger测序结果显示患儿及其父亲 ADAR1基因第10外显子均存在c.2858dup(p.T954Dfs*20)杂合变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南判定为致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PM1+PP3)。 结论:ADAR1基因c.2858dup(p.T954Dfs*20)变异可能是该DSH患儿的遗传学病因。
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编辑人员丨1周前
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遗传性对称性色素异常症伴发育迟缓一个家系的 ADAR基因变异分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨1个遗传性对称性色素异常症(DSH)伴发育迟缓家系的临床特点及基因变异特点。方法:选择2021年5月28日因"四肢末端皮肤色素异常伴生长发育落后2年余"就诊于郑州大学第一附属医院儿科的1例患儿及其家系成员(共3代11人)作为研究对象,收集相关的临床资料。对患儿进行全外显子组测序,并对候选变异进行Sanger测序家系验证。结果:患儿为2岁7月龄男性,手足以及颜面部对称分布绿豆大小的色素脱失斑和雀斑样色素沉着,其生长发育较同龄儿落后。其家系成员具有DSH的典型表现。基因检测显示患儿及其母亲、大姐均携带 ADAR基因第8外显子c.2657G>A杂合变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会相关指南,c.2657G>A变异被评级为可能致病性变异(PM1+PM2_Supporting+PP1+PP3)。 结论:ADAR基因c.2657G>A变异可能是该DSH家系的遗传学病因。
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编辑人员丨1周前
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全外显子测序筛查胃癌高频突变基因的突变型与野生型在临床病理表型上的差异
编辑人员丨2023/8/6
目的 通过全外显子测序筛查胃癌高频突变基因,探讨这些基因的突变型和野生型在胃癌临床病理表型上的差异.方法 随机收集2016年1至3月就诊于解放军总医院普通外科的30例胃癌组织及术前外周血,采用二代基因测序方法,以正常血白细胞为对照,识别肿瘤样本突变的基因.选取突变频率高于TP53的基因为高频突变.对比分析高频突变基因的突变型与野生型在年龄、性别、部位、分化程度、淋巴结转移数等常见临床病理表型上的差异.结果 共检出27个胃癌相关高频突变基因,大多数与临床病理表型无关.TAS2R43突变型和野生型在胃体癌中差异有统计学意义(55.6%与9.5%,P=0.022),ANKRD36C突变型和野生型在胃体癌中差异有统计学意义(62.5%与9.1%,P=0.005),ANKRD36突变型和野生型在近端胃癌中差异也具有统计学意义(8.33%与44.4%,P=0.049),SYNE1突变型转移淋巴结数目较野生型少(8.8±9.5与2.1±2.4,P =0.006),ADAR突变型发病年龄较低(50.7±11.5)与(64.0±9.8)岁,P=0.006.结论 TAS2R43、ANKRD36、ANKRD36C突变与胃癌发生部位相关,SYNE1突变型与少淋巴结转移的胃癌相关,ADAR突变与低龄胃癌相关.
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编辑人员丨2023/8/6
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3个中国遗传性对称性色素异常症家系ADAR基因新变异的鉴定
编辑人员丨2023/8/5
目的 对3个中国遗传性对称性色素异常症(DSH)家系进行临床特征分析及致病变异鉴定.方法 收集3个中国DSH患者及其家系成员的临床资料并采集外周血,应用全外显子组测序技术(WES)对3个DSH家系的先证者进行变异筛查,并使用Sanger测序技术进行家系基因型-表型共分离验证,最后通过系列生物信息分析软件对新发现变异的致病性进行预测.结果 3个中国DSH家系的先证者均表现为肢端色素沉着减少斑间杂色素沉着过度斑.WES结果发现3个先证者均携带ADAR基因(NM 001111.5)变异,先证者1携带ADAR基因c.3546T>G(p.Tyr1182?)无义变异,先证者2携带ADAR基因c.2770T>G(p.Tyr924Asp)错义变异,先证者3携带ADAR基因c.3116A>C(p.Lys1039Thr)错义变异.前两个变异均未在gnomAD和HGMD等公共数据库中收录,第三个变异在HGMD数据库中收录,人群频率为0.Sanger测序结果表明这3个家系中先证者的父母均未携带相应变异,提示这3个变异均为新发变异.这3个变异位点在不同物种中高度保守,且均位于双链RNA特异性腺苷脱氨酶蛋白的腺苷脱氨酶催化结构域.根据美国医学遗传学和基因组学学会(ACMG)指南,ADAR基因c.3546T>G无义变异被判定为致病(PVS1+PS2+PM2+PP3+PP4),c.2770T>G、c.3116A>C错义变异被判定为致病(PS2+PM1+PM2+PP3+PP4)以及(PS1+PS2+PM1+PM2+PP3+PP4).结论 ADAR基因的新发变异c.3546T>G、c.2770T>G和c.3116A>C可能分别是这3个中国DSH患者的发病原因,以上结果丰富了ADAR基因的突变谱.
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编辑人员丨2023/8/5
