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广西南丹瑶鸡PGC-1α基因的克隆与生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/6
PGC-1α是影响脂肪沉积的重要候选基因,广西南丹瑶具有皮薄肉好的特点.因此,本研究的目的通过克隆和分析广西南丹瑶鸡PGC-1α基因全序列来阐述广西南丹瑶鸡优质肉品质形成的分子机理.根据GenBank上公布的参考序列(NM_001006457.1)设计引物,PCR扩增并克隆PGC-1α基因编码区全序列.结果显示,与参考序列(NM_001006457.1)相比,存在T51C、T81C、T90C、C111T、T465C、G646A、C741T、C1572G、T1579G、T1720C10处碱基突变,其中T51C、T81C、T90C、C111T、T465C、C741T、C1572G 7处为同义突变,无氨酸改变.G646、T1579G、T1720C 3处为错义突变,分别造成天冬氨酸突变为天冬酰胺,丝氨酸突变为丙氨酸,丝氨酸突变为脯氨酸.同源性分析结果显示,广西南丹瑶鸡与家鸡、家鸽、小鼠、猪、人的同源性分别为99.62％、96.5％、83.7％、85.1％、85.9％.本研究的结果提示,广西南丹瑶鸡PGC-1α基因存在多处错义突变,这些突变可能是造成南丹瑶鸡优质的原因之一.
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编辑人员丨2023/8/6
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广西南丹瑶鸡PGC-1α基因646位点多态性分析
编辑人员丨2023/8/6
广西南丹瑶鸡是广西优良的地方品种,其特点是皮脂薄且肉质好,但其形成的分子机制不清楚.过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活子1α (peroxisome proliferator-activated receptor-γ coactivator-1,PGC-1α)是影响脂肪沉积的重要候选基因.本研究以广西麻鸡作为对照,利用PCR-RFLP技术分析了广西南丹瑶鸡PGC-1α基因646位点的多态性.结果显示,广西南丹瑶鸡和广西麻鸡PGC-1α基因646位点都存在A和G两个等位基因,A等位基因频率在广西南丹瑶鸡和广西麻鸡分别为0.35和0.23.AA、AG和GG 3种基因型频率在广西南丹瑶鸡中分别为0.05、0.60和0.35,在广西麻鸡分别为0.07、0.33和0.6.本研究的结果提示A等位基因可能有助于减少广西南丹瑶鸡皮下脂肪的沉积.
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编辑人员丨2023/8/6
