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皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析
编辑人员丨2023/12/9
喉毛花属植物是藏茵陈入药基原植物之一,其属下物种关系一直存在争议.为建立稳定的喉毛花属下系统发育关系,本研究为重建喉毛花属下系统发育关系,通过对皱边喉毛花及其4个近缘种进行Illumina二代测序,共获得12个叶绿体基因组,并分析其结构特征与系统发育关系,为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据.结果表明,(1)皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组均在150 kb左右,基因总数均为131个,其中编码基因81个,1R区核苷酸多态性较低,编码区比非编码区更保守;(2)除ndhB基因外,其余编码基因均受到纯化选择的作用,皱边喉毛花及其近缘种的密码子偏好性较弱;(3)基于蛋白编码序列(CDS)、第一、二位密码子位置(CDS1+2)、第三位密码子位置(CDS3)以及筛选出的高度变异基因间隔区(ndhC_trnV-UAC、psbC_trnS-UGA和psbK_psbI)序列等不同数据集构建的系统发育关系高度一致,皱边喉毛花、镰萼喉毛花及长梗喉毛花相互嵌套.总之,皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组相似度极高,物种之间存在相互嵌套的系统发育关系.研究可加深对喉毛花属系统发育关系的理解,为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据.
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编辑人员丨2023/12/9
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獐牙菜亚族植物的系统发育分析
编辑人员丨2023/8/5
獐牙菜亚族(subtribe Swertiinae)是龙胆科(Gentianaceae)中分类处理较困难的一个亚族.为探讨该亚族各属之间和属内的系统关系,选取了该亚族86种及变种,采用ML和BI方法对样本的叶绿体基因matK和rb?cL片段进行分析,构建了该亚族的系统发育树,用马尔科夫蒙特卡洛算法(MCMC)的分子序列贝叶斯分析推算了该亚族的关键演化时间点.结果显示:①龙胆亚族和獐牙菜亚族各自为单系,且互为姐妹类群;②獐牙菜属、假龙胆属、肋柱花属和喉毛花属均不是单系群,各属的种在系统发育树上互有交叉,特别是獐牙菜属的多个种分别聚到不同的支上,与其它属是并系关系;③獐牙菜亚族49个种在约4 Ma开始形成;④分子数据支持何廷农分类系统对于獐牙菜亚属和多枝亚属的属间划分,部分支持多枝亚属下多枝组和宽丝组的划分;⑤异型花属、獐牙菜属、假龙胆属、喉毛花和肋柱花属的属间分类以及獐牙菜属肉根亚属密花组的系统位置仍需进一步讨论.
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编辑人员丨2023/8/5
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藏药"蒂达"、蒙药"地格达"的品种传承与基原嬗进
编辑人员丨2023/8/5
目的:藏药"蒂达"和蒙药"地格达"同宗同源,是一类治疗肝胆疾病的常用藏蒙药品种的总称,对其进行品种、基原的梳理,以期阐明各自的品种传承与基原嬗进.方法:查阅藏蒙药经典文献并进行药用植物基原调查.结果:藏药"蒂达"和蒙药"地格达"原植物涉及龙胆科Gentianaceae獐牙菜属Swertia、肋柱花属Lomatogonium、花锚属Halenia扁蕾属Gentianopsis、喉毛花属Comastoma、假龙胆属Gentianella、龙胆属Gentiana、百金花属Centaurium,虎耳草科Saxifragaceae虎耳草属Saxifraga、梅花草属Parnassia,堇菜科Violaceae堇菜属Viola,豆科Leguminosae米口袋属Gueldenstaedtia,罂粟科Papaveraceae紫堇属Corydalis,石竹科Caryophyllaceae卷耳属Cerastium,唇形科Labiatae薄荷属Mentha,菊科Compositae异型菊属Leibnitzia,以及十字花科Brassicaceae糖芥属Erysimum等9科17属101种8变种植物.结论:藏药"蒂达"和蒙药"地格达"各品种以及基原植物科属种虽然繁杂,但各自品种传承有序,基原嬗进关系明确,所用的各品种与藏蒙药经典记载、不同藏蒙地域药用植物分布以及临床用药经验等密切相关.
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编辑人员丨2023/8/5
