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氟中毒表观遗传学发病机制研究进展
编辑人员丨6天前
氟中毒发病机制复杂,具体机制尚无定论。环境中的有毒物质诱导表观遗传修饰改变对人类健康的影响是一个备受关注的新兴领域。近年来,研究者们发现,氟化物能诱导多种表观遗传调控的改变,并参与地方性氟中毒的发生发展。本文对目前在细胞培养、动物模型和人群研究中氟化物暴露与表现遗传修饰机制相关重要发现进行综述,重点从DNA甲基化、组蛋白翻译后修饰、非编码RNAs以及基因组印记等表观遗传调控模式探讨氟中毒发病机制,以期为地方性氟中毒的分子遗传学机制研究提供新的思考方向。
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编辑人员丨6天前
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不同遗传学检测技术在Prader-Willi综合征诊断中的应用
编辑人员丨6天前
目的:通过对2例不同类型的Prader-Willi综合征的诊断,分析不同的分子遗传实验技术在这类罕见遗传病诊断中应用的优点和局限性。方法:首先应用染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)对2例全面发育迟滞的婴幼儿血液样本进行初步检测,之后对病例1行CMA家系分析,用ChAS和UPD-tool软件计算检测数据。对病例2加做甲基化特异性PCR检测。结果:病例1经CMA和UPD-tool家系分析诊断为母源单亲二体型Prader-Willi综合征,并发现该病例的15号染色体实际为同源/异源一体的整条母源单亲二体型。病例2经CMA结合甲基化特异性PCR检测诊断为缺失型Prader-willi综合征。结论:针对不同分子遗传检测技术的优点和局限性合理选择正确的实验方法,能够有效地帮助临床和准确诊断基因组印记病,以便及早干预、治疗,获得更好的疗效和预后。
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编辑人员丨6天前
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希佩尔-林道基因3996位腺苷到肌苷编辑与人表皮生长因子受体2阳性乳腺癌预后的相关分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨希佩尔-林道(VHL)腺苷到肌苷编辑(ATIE)与人表皮生长因子受体2阳性(Her-2 +)乳腺癌患者预后的关系及其机制。 方法:基于癌症基因组图谱数据库筛选与Her-2 +乳腺癌患者预后关联的VHL ATIE。随机选取2014年至2019年广东省妇幼保健院相关患者81例,直接测序法检测ATIE位点的水平。采用荧光定量聚合酶链反应和蛋白印记法检测VHL表达。细胞计数试剂盒检测乳腺癌细胞耐药的半数抑制浓度(IC 50)。生存分析采用Cox回归,组间比较采用 t检验和方差分析,相关分析采用Spearman等级相关检验。 结果:数据库分析显示VHL转录本3996位腺苷到肌苷编辑(c.A3996I; HR=3.612,95% CI=1.093~11.940, P<0.05)、c.A3914I( HR=4.985,95% CI=1.442~17.230, P<0.05)与Her-2 +乳腺癌患者预后显著相关。直接测序法证实c.A3996I真实存在,低编辑患者组的死亡风险高于高编辑组( HR=3.980,95% CI=1.075~14.740, P<0.05),且淋巴结转移2/3期患者组c.A3996I的编辑水平显著低于淋巴结转移1期和无转移患者组[(9.923±5.741)%比(13.980±7.532)%和(17.820±9.424)%, F=5.140, P<0.01]。该位点编辑水平与增殖细胞核抗原表达( r=-0.282, P<0.05)呈负相关。c.A3996I编辑水平与VHL信使RNA( r=0.406, P<0.05)和蛋白( r=0.467, P<0.01)表达水平呈显著正相关,且在c.A3996I低编辑组,miR-143-5p与VHL的表达呈显著负相关( r=-0.145, P<0.05),但在高编辑组中两者无相关( r=0.051, P>0.05)。并且,耐曲妥珠单抗乳腺癌细胞VHL的表达显著低于正常细胞(0.540±0.116比1.011±0.195, t=4.159, P<0.01),未敲低VHL的乳腺癌细胞IC 50低于敲低组(5.489 μg/ml比22.120 μg/ml, F=22.440, P<0.01),且敲低VHL的乳腺癌细胞迁移能力显著上升(1 634±204比1 140±252, t=3.049, P<0.05)。 结论:c.A3996I编辑可抑制VHL表达及其功能而影响Her-2 +乳腺癌患者预后。
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编辑人员丨6天前
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DLK1-DIO3印记与生长发育研究进展
编辑人员丨6天前
生长发育是一个重要的生命过程,它始于精卵结合,终于青春期结束。在这一过程的任何一个时期出现异常,都会影响到个体的发育,这种影响有的是暂时且可以逆转的,有的则是永久性的。目前研究显示,基因组印记通常在胎儿生长发育中起着至关重要的作用。人14q32.1-q32.31的印记DLK1-DIO3位点作为最大的印记簇,当其印记发生错误时将导致多种发育障碍。细胞的表观遗传学改变要早于其他类型的改变,对于生长发育异常的预防具有指导意义,因此本文将通过对DLK1-DIO3与生长发育的研究进展作一综述。
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编辑人员丨6天前
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Angelman综合征的诊断与治疗
编辑人员丨6天前
Angelman综合征是由于母源染色体15q11.2-q13区域UBE3A基因功能缺陷所导致的基因组印记遗传病。临床上表现为严重神经发育障碍,包括智力障碍、语言缺失、癫痫发作及异常的脑电发放、运动障碍、睡眠及喂养问题、特殊面容及特异的行为特征。
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编辑人员丨6天前
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细胞分裂调节蛋白1在胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨6天前
目的:观察细胞分裂调节蛋白1(PRC1)在胶质瘤中的表达特征及其水平高低对患者生存期的影响,以及体外调控其表达后对胶质瘤细胞的影响,探讨PRC1在胶质瘤中的临床意义。方法:通过对胶质瘤数据库肿瘤基因组图谱(TCGA)中胶质瘤数据库挖掘PRC1 mRNA水平在胶质母细胞瘤与非肿瘤脑组织、不同WHO级别、病例类型间的水平差异,对56例胶质瘤肿瘤样本的免疫组织化学染色评价PRC1的表达特征及其与Ki67之间的关系,通过蛋白印记实验比较6个胶质瘤细胞系与人星形胶质细胞中PRC1的蛋白表达水平差异,对TCGA数据库中高表达PRC1组患者与低表达PRC1组患者的转录组数据进行生信分析研究PRC1可能调控的分子信号通路,探讨PRC1在胶质瘤中的临床意义。组间比较采用两独立样本的 t检验,等级资料采用秩和检验,生存分析采用Kaplan-Meier法。 结果:胶质瘤WHO级别越高(Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级),PRC1 mRNA和蛋白水平越高( t=9.665、11.200、24.980、8.120、5.957, P<0.05),且在胶质母细胞瘤中水平显著高于少突神经胶质瘤、少突星形胶质细胞瘤,以及星形胶质细胞瘤( t=16.110、15.460、13.290, F=20.540, P<0.05)。胶质母细胞瘤中PRC1 mRNA水平较正常脑组织显著增高( t=3.797、5.008、4.435、5.867、4.809、6.242, P<0.05)。胶质母细胞瘤细胞系中,PRC1的蛋白表达水平均显著高于正常星形胶质细胞( t=6.432, P<0.05),差异有统计学意义。PRC1高表达组患者的中位生存期显著小于PRC1低表达组,分别为13.3、40.45个月( χ2=23.990, P<0.05),差异有统计学意义。PRC1参与调控了细胞周期和p53信号通路,并且PRC1与Ki-67呈正相关( r=0.815、7.774, P<0.05)。 结论:PRC1在胶质瘤中异常高表达,并且高表达PRC1肿瘤增殖明显增强,恶性程度更高,预示较差的临床预后,PRC1可能是一个新的胶质瘤治疗靶点。
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编辑人员丨6天前
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儿童矮身材遗传学诊断与研究的挑战和机遇
编辑人员丨6天前
矮身材的诊断过程实质上是确定身材矮小病因的过程。随着遗传学新技术的广泛临床应用,已证实越来越多的基因与矮小相关。下丘脑垂体发育异常的基因变异,下丘脑垂体-生长激素-胰岛素样生长因子1轴相关的基因变异,生长板参与软骨细胞增殖、肥大和分泌软骨细胞外基质过程的基因异常,染色体及基因组印记基因异常等均可导致身材矮小。为明确矮身材病因,规范生长激素合理临床应用,须重视对矮身材儿童的遗传学分析和研究力度。
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编辑人员丨6天前
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单细胞RNA测序解析普通小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34 +细胞的类型与功能
编辑人员丨6天前
目的:单细胞RNA测序解析普通小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34 +细胞的类型与功能。 方法:该研究为实验研究。构建CD34 +细胞谱系追踪小鼠,实现CD34 +细胞在荧光条件下可视化。取6只7~8周龄雄性CD34 +细胞谱系追踪小鼠(设为糖尿病组),腹腔注射链脲佐菌素构建糖尿病模型,于小鼠13周龄时在其背部制备全层皮肤缺损创面;另取6只13周龄雄性CD34 +细胞谱系追踪小鼠(设为对照组),在其背部制备全层皮肤缺损创面。伤后4 d,分别收集对照组3只小鼠和糖尿病组2只小鼠创面组织,消化制备单细胞悬液,采用荧光活化细胞分选法筛选出CD34 +细胞后进行单细胞RNA测序,采用R语言的Seurat 4.0.2程序通过降维可视化和细胞聚类分析CD34 +细胞类型并筛选注释各CD34 +细胞亚群的标记基因,对2组小鼠创面组织间CD34 +成纤维细胞(Fb)、平滑肌细胞、角质形成细胞(KC)、类软骨细胞的差异表达基因(DEG)进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析,探索细胞功能。 结果:伤后4 d,2组小鼠创面组织中CD34 +细胞均包含7种细胞类型,具体为内皮细胞、Fb、KC、巨噬细胞、T细胞、平滑肌细胞和类软骨细胞,其中Fb细分为5个亚群。与对照组比较,糖尿病组小鼠创面组织中的CD34 +内皮细胞、Fb亚群1、Fb亚群4、KC、类软骨细胞占比升高,CD34 +Fb亚群2、Fb亚群3和平滑肌细胞占比下降。注释CD34 +类软骨细胞、内皮细胞、Fb亚群1、Fb亚群2、Fb亚群3、Fb亚群4、Fb亚群5、KC、巨噬细胞、平滑肌细胞、T细胞的标记基因分别为转移相关肺腺癌转录本1、脂肪酸结合蛋白4、Gremlin 1、补体成分4B、H19印记母源表达转录本、Dickkopf Wnt信号通路抑制剂2、纤维调节蛋白、角蛋白5、CD74分子、G蛋白信号调节蛋白5、可诱导T细胞共刺激分子。KEGG和GO富集分析显示,与对照组比较,糖尿病组小鼠伤后4 d创面组织中CD34 +Fb差异表达显著的DEG显著富集于炎症反应、细胞外基质(ECM)组装、细胞增殖调控、衰老相关条目( P值均<0.05),CD34 +平滑肌细胞差异表达显著的DEG显著富集于细胞迁移、凋亡过程、转录的正调控、吞噬体等条目( P值均<0.05),CD34 +KC差异表达显著的DEG显著富集于线粒体功能、转录、神经退行性疾病相关条目( P值均<0.05),CD34 +类软骨细胞差异表达显著的DEG显著富集于节律调控、ECM、病毒感染等相关条目( P值均<0.05)。 结论:CD34 +细胞在普通小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面愈合过程中均存在高异质性,2种小鼠创面间CD34 +细胞亚群差异表达显著的DEG显著富集的相关功能与创面愈合过程紧密相关。
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编辑人员丨6天前
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可疑复发性胎儿Beckwith-Wiedemann综合征产前诊断一例并文献复习
编辑人员丨6天前
目的:探讨产前可疑Beckwith-Wiedemann综合征(Beckwith-Wiedemann syndrome, BWS)胎儿的遗传学检测,以提高该综合征的产前遗传学诊断率。方法:1例既往孕18周超声发现胎儿脐膨出、胎盘增厚引产孕妇,此次妊娠孕13周超声再次发现胎儿脐膨出、胎盘增厚。行绒毛活检取样术后,应用单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array, SNP array)芯片对全基因组拷贝数变异分析,之后应用甲基化特异性多重连接探针扩增(methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification, MS-MLPA)技术检测染色体11p15区域 H19和 KCNQ1基因的甲基化状态和拷贝数变化。同时采集胎儿父母外周血行染色体高分辨G显带核型分析和SNP array检测。 结果:胎儿绒毛SNP array提示11p15.5区域有176 kb杂合缺失;MS-MLPA提示印记控制区域2甲基化缺失, KCNQ1(L02903)基因拷贝数减少50%。胎儿父母的SNP array检测和染色体G显带核型分析均未发现异常。诊断该例胎儿为BWS。 结论:孕早期超声发现胎儿脐膨出、胎盘异常增厚等宫内异常表现时,应选择相应的遗传学检测,建议产前诊断选择MS-MLPA和SNP array,避免漏诊BWS。
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编辑人员丨6天前
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两对多次发生胎儿畸形夫妻的遗传学分析
编辑人员丨6天前
目的:筛查两对夫妻多次发生胎儿畸形的致病性基因变异。方法:在取得知情同意后,抽取夫妻外周血,提取基因组DNA。应用全外显子组测序技术对基因组中外显子及其剪接区进行深度测序,用Sanger测序验证所筛选的候选基因变异位点。结果:1对反复出现胎儿骨发育畸形的夫妻分别携带 ALPL c.997+1G>T和c.871G>A(p.Glu291Lys)杂合变异,两个变异均导致ALPL蛋白的碱性磷酸酶功能下降或丧失。在胎儿反复发生脐膨出的另一对夫妻中,女方携带 CDKN1C基因c.637_652 delins CCC缺失插入变异,导致CDKN1C蛋白编码发生移码且提前终止(p.Ala213Profs*55)。 CDKN1C基因变异可呈现父系印记导致的母系显性遗传特征,引起具有脐膨出病征的Beckwith-Wiedemann综合征。 结论:在胎儿反复发育畸形两对夫妻中,尽管没有先证者基因信息,但是通过其反复发生的病征和夫妻间基因比对分析,能推测出相应的遗传病因,为夫妻的再生育提供依据。
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编辑人员丨6天前
