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环状核糖核酸转化/转录域关联蛋白和微小核糖核酸-761在冠心病中的表达及临床意义
编辑人员丨6天前
目的:探究环状核糖核酸转化/转录域关联蛋白(circular RNA transformation/transcription domain associated protein,circTRRAP)和微小 RNA-761(microRNA-761,miR-761)在冠心病患者血清中的表达及与心肌损伤的相关性.方法:从2019年12月到2022年12月,在湖南中医药大学第一附属医院接受治疗的80例冠状动脉疾病患者被纳入研究组,同时,80名健康人为对照组.实时荧光定量PCR法用来检测血清中circTRRAP、miR-761表达水平;检测两组心肌损伤相关指标cTnI、cTnT、CK-MB和BNP的水平;采用Person相关性系数分析circTRRAP、miR-761表达与心肌损伤指标的相关性;以ROC曲线探究血清circTRRAP和miR-761水平对冠心病的诊断价值.结果:观察组的circTRRAP水平显著高于对照组,而miR-761水平则远低于对照组(P<0.05).在心肌损伤指标cTnI、cTnT、CK-MB以及BNP方面,观察组的表达较对照组明显升高(P<0.05).Pearson法结果显示,冠心病患者血清circTRRAP水平与miR-761呈负相关(r=-0.422,P<0.05).此外,冠心病患者血清circTRRAP表达水平与cTnI、cTnT、CK-MB和BNP呈显著性的正相关(P<0.05);miR-761 表达水平与cTnI、cTnT、CK-MB和BNP呈显著性的负相关(P<0.05).circTRRAP水平诊断冠心病的曲线下面积(AUC)为0.917,敏感度为78.3%,特异性为95.0%;miR-761水平诊断冠心病的AUC为0.907,敏感度为97.8%,特异性为72.5%;circTRRAP和miR-761联合诊断的AUC为0.991,敏感度为93.5%,特异性为97.5%.结论:冠心病患者血清中circTRRAP的表达水平较高,miR-761的表达水平较低,且血清circTRRAP和miR-761表达水平对冠心病患者早期诊断均有重要作用.
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-761的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
微小RNA(miRNA,miR)是高度进化保守的长度为18~ 25个核苷酸的非编码核糖核酸,能够在转录后水平调节基因的表达.近年来,大量研究表明miR-761参与细胞内线粒体的分裂、融合及合成,并在不同肿瘤中发挥着抑癌或促癌的作用.此外,还与心血管疾病、海马神经元的塑形和发育等密切相关.本文就miR-761的研究进展进行综述.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-23b靶向ITGAM调控巨噬细胞极化参与糖尿病肾病的生信分析
编辑人员丨2023/8/5
对美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)-基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中人单核细胞源巨噬细胞的基因组芯片进行生物信息学分析,寻找巨噬细胞极化参与糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾纤维化的关键基因,预测潜在的上游miRNA,探索疾病治疗的新靶点.从GEO数据库中采集人单核细胞源巨噬细胞的基因组表达数据,使用在线工具GEO2R下载数据并筛选差异表达基因,通过WebGestalt数据库对差异表达基因进行GO和KEGG分析,通过STRING v11.0数据库构建差异表达基因的蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并应用Cytoscape v3.7.2软件进行可视化分析;采用cytoHubba插件分析PPI网络的关联程度并筛选关键表达基因.研究通过在线工具GEO2R筛选出289个表达上调的差异基因,GO分析发现M2型巨噬细胞上调表达的差异基因多在细胞外基质(extracellular matrix,ECM)形成、细胞通讯调节、抗原加工提呈、免疫反应以及炎症反应等生物学过程中富集;在ECM、细胞膜、内膜系统和溶酶体等细胞及相关组分中富集;在抗原结合、蛋白质活性和分子功能调节等分子功能中富集;KEGG分析发现差异表达基因在瞬时受体电位(transient receptor potential,TRP)通道的炎性介质调节和 Ras 相关蛋白 1(Ras-related protein 1,Rap1)等信号通路中富集.整合素 αM(integrin αM,ITGAM)、CD1A、CD1E、FCGR2B、ITGAE、CD1C、CD1B、SDC1、MRC1、CD209、CR1、CDH1、MYC、FN1、PPARG、FOS、PIK3R1、CAT、P2RY1、CYSLTR1、GNAQ、PLCB1、NMB、LPL和ABCG2等是关键基因.对筛选出的关键基因ITGAM上游的miRNA进行预测,结果表明,hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-125a-5p,hsa-miR-761 和 hsa-miR-4319 等可调控 ITGAM 的表达.miR-23b 可能通过靶向作用于巨噬细胞中的ITGAM调控其向M2型巨噬细胞极化,参与DN炎症和纤维化过程的调节.
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编辑人员丨2023/8/5
