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扎那纹胸鮡g型溶菌酶的cDNA克隆及组织表达分析
编辑人员丨2023/8/19
目的 鉴定扎那纹胸鮡g型溶菌酶(GzLysG)编码序列,分析其在宿主免疫系统中的作用.方法 通过巢氏PCR技术克隆了GzLysG cDNA序列,通过ExPASy、SignalP 5.0、CDD、Clustal Omega等在线软件对GzLysG蛋白进行生物信息学分析,利用RT-qPCR技术分析了GzLysG mRNA在不同组织中的表达情况.结果 GzLysG cDNA的开放阅读框全长558 bp,编码 185 个氨基酸,其蛋白序列分子量为 20 478.20 u,理论等电点为 9.16,是一种稳定的碱性亲水性蛋白质.该蛋白无信号肽,含有g型溶菌酶典型的催化活性位点、GEWL 结构域和 SLT 结构域.高级结构分析发现,GzLysG蛋白以α螺旋和无规则卷曲结构为主,其分子表面有一条与溶菌酶活性密切相关的狭长裂缝.系统进化分析表明溶菌酶在物种进化过程中较为保守,且GzLysG与斑马鱼来源的溶菌酶表现出较近的亲缘关系.组织表达谱分析发现,GzLysG mRNA在免疫保护相关的皮肤、肌肉和鳃组织中具有较高表达量.结论 GzLysG在扎那纹胸鮡固有免疫防御中可能发挥重要作用.
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编辑人员丨2023/8/19
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