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巴西橡胶树HbSIP2互作蛋白的筛选和鉴定
编辑人员丨2023/8/6
可溶性无机焦磷酸酶在天然橡胶生物合成中具有重要的调控作用,HbSIP2是胶乳中关键的可溶性无机焦磷酸酶基因.为了深入了解HbSIP2调控橡胶生物合成的机理,本研究对HbSIP2互作蛋白进行了筛选和鉴定.结果表明:诱饵载体pGBKT7-HbSIP2无自激活活性,且对酵母无毒性作用,可以用于酵母文库筛选.将诱饵载体与橡胶树胶乳cDNA文库进行杂交,初步筛选获得20个与HbSIP2互作的蛋白.进一步通过双分子荧光互补实验证实,HbSIP2能够与橡胶延伸因子发生蛋白互作.本研究结果为HbSIP2调控橡胶生物合成的机理研究提供了重要的理论依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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橡胶草SRPP/REF家族基因的鉴定及表达分析
编辑人员丨2023/8/5
橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)是研究天然橡胶生物合成的理想模式植物,小橡胶粒子蛋白/橡胶延伸因子(SPPP/REF)家族在天然橡胶合成中扮演重要角色.本研究开展对橡胶草TkSRPP/REF家族的基因鉴定、生物信息学分析及响应茉莉酸甲酯的表达分析,从橡胶草全基因组中识别到10个SRPP/REF家族基因,包含9个SRPP基因(TkSRPP1～9)和1个REF基因(TkREF1),理化性质分析发现大部分TkSRPP/REF蛋白等电点(4.6～8.7)小于6,蛋白分子量为5.6～44.6 kDa,SRPP亚家族蛋白亲水系数均小于零,REF1略大于零.亚细胞定位和跨膜结构域分析表明TkSRPP/REF均定位在细胞质中,REF1蛋白具有跨膜结构域,而SRPP亚家族蛋白均无跨膜结构域.与拟南芥、橡胶树和莴苣的SRPP/REF蛋白一起构建系统发育树共分为5个聚类组(Ⅰ～Ⅴ),TkSRPP/REF家族分布在其中4个聚类组(Ⅱ～Ⅴ),大部分与莴苣家族类似主要分布在Ⅲ和Ⅳ组,而仅少数与橡胶树和拟南芥的家族成员在同一聚类组,表明橡胶草与莴苣SRPP/REF蛋白有更近的亲缘关系.TkSRPP/REF基因中有9个具有3个外显子,1个(SRPP8)含有2个外显子.TkSRPP/REF家族蛋白共有6个motif (1～6),REF亚家族只有2个motif2,属于REF保守结构域,不同聚类组上的TkSRPP亚家族蛋白的motif数量存在差异.TkSRPP/REF家族基因的启动子上具有多个激素和非生物胁迫响应元件.克隆获得8个TkSRPP/REF基因,转录组数据分析表明茉莉酸甲酯能够诱导TkSRPP3-4和TkREF1基因上调表达.qRT-PCR分析显示,茉莉酸甲酯处理6和24 h后TkREF1基因的表达水平分别下降0.5倍和上调1.5倍,而TkSRPP4基因的表达水平分别上升4.3和8.9倍.上述结果为深入研究TkSRPP/REF基因家族的功能与茉莉酸调控橡胶合成的机制提供了参考.
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编辑人员丨2023/8/5
