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陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析
编辑人员丨6天前
目的:分析陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的基因特征。方法:采集患者咽拭子标本,接种MDCK细胞进行病毒分离获得毒株,采用全基因组深度测序方法获得分离株的8个基因节段序列,通过GenBank数据库中Blast程序进行核苷酸同源性分析,构建系统进化树,分析病毒基因特征。结果:病例咽拭子标本经实验室确诊为EA H1N1 SIV,后分离毒株命名为A/Shaanxi-Weicheng/1351/2022(H1N1v)。同源性分析显示,该分离株的PB2、NP、HA、NA和M基因均与A/swine/Beijing/0301/2018(H1N1)核苷酸同源性最高,分别为98.29%、98.73%、97.41%、97.52%和99.08%。进化树显示,该分离株属于G4基因型EA H1N1 SIV,其中PB2、PB1、PA、NP和M基因来自pdm/09 H1N1,HA和NA基因来自EA H1N1,NS基因来自三源重配H1N1。其HA蛋白裂解位点为IPSIQSR↓G,为低致病性流感病毒的分子特征。NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变。PB2蛋白701N、PA蛋白P224S突变、NP蛋白Q357K突变、M蛋白P41A突变和NS蛋白92D均说明其对哺乳动物的适应性增强。结论:该患者为陕西省首例人感染G4基因型EA H1N1 SIV病例,该病毒为低致病性,但其对哺乳动物的适应性增强,需要加强对此类SIVs的监测。
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编辑人员丨6天前
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季节性流感疫苗免疫血清对欧亚类禽H1N1猪流感病毒的交叉反应
编辑人员丨6天前
目的:评估季节性流感疫苗免疫血清对欧亚类禽H1N1猪流感病毒的交叉反应。方法:9株人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒株来自江苏、河北、山东、云南、湖南、福建和天津等省份的国家级流感监测网络实验室,通过深度测序分析其血凝素特性。于2019年10月在云南省安宁市接种2019-2020年度季节性流感疫苗的儿童(2~5岁)、成人(24~57岁)和老年人(60~84岁)中各招募30名志愿者,采集其接种疫苗前和接种1个月后血清。通过血凝抑制试验评估免疫前后血清对2015年以来分离的4株人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒的交叉反应。结果:9株欧亚类禽H1N1猪流感病毒的血凝素基因同源性较一致,但与甲型流感病毒[A(H1N1)pdm09](以下简称“疫苗株”)的血凝素重链和轻链氨基酸基因的差异分别为90~101个和24~30个氨基酸。疫苗株抗血清对疫苗株的抗体滴度为2 560,欧亚类禽H1N1猪流感病毒以及欧亚类禽H1N1猪流感病毒抗血清对疫苗株的抗体滴度均为640。接种季节性流感疫苗的儿童、成人和老年组人群针对疫苗株的抗体滴度≥40者占比分别为90.0%、70.0%和73.3%;而对4株欧亚类禽H1N1猪流感病毒仅为46.7%、36.7%和33.3%~43.3%。结论:接种季节性流感疫苗不能对欧亚类禽H1N1猪流感病毒产生有效的交叉保护作用。
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编辑人员丨6天前
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引起某禽类养殖场疫情的H3N2亚型流感病毒全基因组进化分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源.方法 采用个案调查等流行病学调查方法开展现场调查,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用EditSeq和MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析.结果 此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%,核酸检测阳性率73.33%,分离到季节性A(H3N2)型流感病毒5株.进化分析显示分离到的H3N2流感病毒的8个基因片段均与2015-2016年流感疫苗株处于同一分支上,没有发生与禽或猪流感病毒的基因重组.5株流感病毒的血凝素(HA)有14个氨基酸位点发生了替换,其中8个位于抗原决定簇上;对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行氨基酸推测分析显示,所有流感病毒均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,对M2离子通道抑制剂药物耐药.糖基化位点分析显示,NA新增两个糖基化位点NRT151-153、NAT245-247,其余基因未变.结论 此次暴发疫情为一起季节性A(H3N2)型流感病毒暴发,病毒发生了抗原漂移,未发现与禽流感、猪流感病毒基因重组的现象.
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编辑人员丨2023/8/6
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我国马群中H 3N 8亚型流感病毒基因来源的研究
编辑人员丨2023/8/5
通过毒粒8个基因节段部分核苷酸序列、HA基因全核苷酸序列分析和比较及NP基因种系发生等分析,证实了A/Eq/Jilin/1/89(H 3N 8)毒株的8个基因节段均来源于禽的毒株,而与人、猪和马的毒株相差甚远,它也并不是通过禽的与马人或猪的重组而来。故我们将我国马群中分离到的H 3N 8亚型毒株称之为新的(禽的)马流感病毒。根据Np基因种系发生等分析,新毒株为近期内传入马流感病毒,但究竞是直接由禽传入,还是先通过其它动物而后传入,至今尚不十分清楚。本结果进一步证实了甲型流感病毒能引起不同宿主间的传播并发生流行。这为弄清人流感大流行株的起源提供了重要线索,也为我国和世界其它国家敲响了警钟。
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编辑人员丨2023/8/5
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广西猪源A(2009/H1N1)流感病毒的进化分析及其致病性研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 对一株分离自广西兴安的猪源A(2009/H1N1)流感病毒进行遗传演化分析及致病性研究,为流感疫情防控提供科学依据.方法 通过SPF鸡胚进行流感病毒分离,对8个基因进行RT-PCR扩增、测序及进化分析;以6周龄雌性BALB/c小鼠为感染模型进行病毒滴定,分析临床数据评估病毒致病性.结果 分离的甲型H1N1病毒株A/swine/Guangxi/18/2013(H1N1) HA、NS和NP基因属于古典型H1N1,NA和M基因源于类禽型H1N1,PA和PB2基因归属禽源,PB1基因来自人源H3N2.HA裂解位点序列为PSIQSR↓ GLF,具有低致病性特征.以50μl 106 TCID50感染小鼠后其体重发生明显变化,最高体重平均变化率为86.98%,死亡率为12.5%;感染第3d测定肺、鼻甲病毒滴度(Log10 TCID50/ml)分别为5.25±0.28和3.89±0.47.结论 A/swine/Guangxi/18/2013(H1N1)为2009/H1N1流感病毒,能感染小鼠而造成体重下降并产生明显的临床症状.该病毒能在小鼠肺与鼻甲中进行复制,具有低致病性特征.
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编辑人员丨2023/8/5
