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钾通道四聚结构域17在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义
编辑人员丨4天前
目的:利用生物信息学分析钾通道四聚结构域17(KCTD17)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及临床意义,并探究相关机制。方法:结合癌症基因图谱数据库,分析KCTD17在ccRCC肿瘤和癌旁组织中转录水平差异及其与临床病理特征相关性。通过Kaplan-Meier和Cox回归分析KCTD17表达与ccRCC总体生存期和无进展生存期的临床关系。利用通路分析KCTD17在ccRCC中参与的机制。CIBERSORT数据库分析KCTD17表达与免疫细胞浸润及免疫检查点基因的相关性。结果:KCTD17在ccRCC癌组织中表达升高(癌比癌旁组织为3.08±0.89比2.49±0.87, t=4.034, P<0.001),其表达与临床分期(Ⅲ期比Ⅰ期为3.220±0.888比2.998±0.897, t=2.298, P=0.01,Ⅲ期比Ⅱ期为3.220±0.888比2.724±1.348, t=2.539, P<0.05,Ⅳ期比Ⅰ期为3.402±0.832比2.998±0.897, t=3.755, P=0.001,Ⅳ期比Ⅱ期为3.402±0.832比2.724±1.348, t=3.371, P<0.01)、分级(G4比G1为3.678±0.67比3.237±0.454, t=3.058, P=0.007;G4比G2为3.678±0.67比2.922±0.943, t=7.572, P<0.001;G4比G3为3.678±0.67比3.102±0.920, t=5.716, P<0.001)、肿瘤分期(T3期比T1期为3.283±0.857比3.008±0.896, t=3.271, P<0.001;T3期比T2期为3.283±0.857比2.767±1.264, t=3.127, P<0.01;T4期比T1期为3.925±0.997比3.008±0.896, t=2.865, P<0.05;T4期比T2期为3.925±0.997比2.767±1.264, t=3.308, P<0.01)、淋巴结转移(转移比非转移为4.018±0.593比3.054±1.027, t=5.777, P<0.001)和远处转移(转移比非转移为3.375±0.791比3.027±0.979, t=3.408, P<0.01)显著正相关。KCTD17高表达患者总体生存率( P<0.01)和无进展生存率( P<0.001)均低于低表达患者,且KCTD17是ccRCC患者总体生存期[风险比( HR):1.408,95%可信区间( CI):1.162~1.705, P<0.001]和无进展生存期( HR:1.609,95% CI:1.308~1.980, P<0.001)的独立预测因素。通路分析显示KCTD17可能通过上皮间质转化( P<0.001)、凝血( P<0.001)、缺氧( P<0.001)、补体( P<0.001)、白细胞介素(IL)-6/酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子3(STAT3)信号( P<0.005)及脂肪酸代谢( P<0.05)及肿瘤免疫微环境相关通路[免疫反应调节( P<0.001)、淋巴细胞活化正向调节( P<0.001)、B细胞受体信号调节( P<0.001)、免疫效应过程调节( P<0.001)、补体激活调节( P<0.001)、经典补体激活途径( P<0.001)和免疫球蛋白受体结合( P<0.001)]参与ccRCC发生发展及导致不良预后。KCTD17高表达组的浆细胞(高表达组比低表达组为0.029±0.020比0.026±0.025, t=1.702, P<0.05)、CD8 T细胞(高表达组比低表达组为0.116±0.102比0.085±0.082, t=3.806, P<0.001)、休眠记忆CD4 T细胞(高表达组比低表达组为0.079±0.059比0.063±0.048, t=3.357, P=0.001)、激活记忆CD4 T细胞(高表达组比低表达组为0.006±0.002比0.004±0.003, t=9.023, P<0.001)、滤泡辅助性T细胞(高表达组比低表达组为0.019±0.014比0.015±0.013, t=3.409, P<0.001)、调节性T细胞(高表达组比低表达组为0.012±0.010比0.009±0.006, t=4.191, P<0.001)、休眠NK细胞(高表达组比低表达组为0.013±0.004比0.010±0.002, t=10.930, P<0.05)、激活NK细胞(高表达组比低表达组为0.033±0.025比0.027±0.020, t=2.732, P<0.05)、M0巨噬细胞(高表达组比低表达组为0.023±0.012比0.016±0.010, t=7.297, P<0.001)、M1巨噬细胞(高表达组比低表达组为0.040±0.029比0.030±0.022, t=4.742, P<0.001)、M2巨噬细胞的浸润(高表达组比低表达组为0.207±0.100比0.155±0.082, t=6.542, P<0.001)丰度升高。KCTD17表达水平与常见免疫检查点基因PD1[相关系数(cor)=0.404, P<0.001]、TIGIT(cor=0.403, P<0.001)、CTLA4(cor=0.398, P<0.001)、LAG3(cor=0.397, P<0.001)、MIF(cor=0.169, P<0.001)显著正相关。 结论:KCTD17在ccRCC中高表达并提示预后不佳,可能与肿瘤微环境免疫抑制相关。
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编辑人员丨4天前
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KCTD15基因在肥胖人群脂肪组织中的表达及其临床意义
编辑人员丨2024/1/20
目的 探讨含钾通道四聚化结构域15(KCTD15)基因在人群脂肪组织中表达水平与临床指标的相关性,分析KCTD15的潜在作用及机制.方法 收集2022年6-9月陆军军医大学第二附属医院骨科及普通外科39例手术患者的脂肪组织,根据体质指数(BMI)将受试者分为超重肥胖组(n=22)和正常体重组(n=17)两组.采用RT-PCR法测定两组共39例患者脂肪组织中KCTD15 mRNA表达,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)的A值作为内参照,计算KCTD15/GAPDH的相对表达量,分析KCTD15表达量与临床指标的相关性.结果 超重肥胖组BMI、腰围、收缩压、舒张压、肌酐均高于正常体重组(t=13.059、9.781、2.185、2.323、2.148),血清钾离子浓度明显低于正常体重组(t=-4.582),差异均有统计学意义(P均<0.05);超重肥胖组脂肪组织中KCTD15 mRNA水平明显低于正常体重组,差异有统计学意义(P<0.01).KCTD15 mRNA水平与BMI、腰围、丙氨酸氨基转移酶、总胆红素、直接胆红素成负相关(r=-0.417、-0.468、-0.398、-0.396、-0.420,P均<0.05),与血清钾离子浓度成正相关(r=0.401,P<0.05).结论 脂肪组织中的KCTD15 mRNA的表达量与BMI、腰围、胆红素成负相关,与血清钾离子成正相关,提示KCTD15基因可能在肥胖的病理生理机制中发挥一定作用.
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编辑人员丨2024/1/20
