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杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/6
为解析杜仲BR 相关基因功能,本研究通过前期构建的杜仲转录组数据库注释的信息,获得BRI1同源序列.设计特异性引物,以杜仲基因组DNA 及cDNA 为模板进行PCR 扩增克隆得到3 612 bp cDNA 序列,命名为EuBRI1.序列分析发现EuBRI1 是一个无内含子的完整开放阅读框,编码1 203 个氨基酸的蛋白.分析表明,EuBRI1 为稳定亲水性蛋白,相对分子质量为131.361 kD;理论等电点pI 为6.31;对其二级结构分析显示α-螺旋占31.50％,无规卷曲占55.94％,延伸链占12.55％,EuBRI1 含信号肽序列和跨膜结构以及 BRI1 家族激酶的保守结构域.进化树分析表明,EuBRI1 蛋白序列与醋栗番茄(Solanum pimpinellifolium) BRI1 进化上较接近,与橡胶树(Hevea brasiliensis) BRI1 相对等较远.研究结果为进一步阐明杜仲BR 相关基因的功能奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/6
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