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木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆与表达分析
编辑人员丨2023/8/5
月季黑斑病是由真菌蔷薇盘二孢(Marssonina rosae)引起的.本研究以高抗黑斑病菌的野生种木香花(Rosa banksiae)作为实验材料,采用TA克隆法和RACE技术,克隆获得抗黑斑病候选基因RbRdrl(GenBank登录号MK584935),并对其进行相关生物信息学分析.序列分析结果显示,RbRdrl含有1个3 396 bp的完整的开放阅读框,能编码1 131个氨基酸;其编码的蛋白是一个亲水性蛋白,亚细胞定位于线粒体及过氧化物酶体上,不具有信号肽及跨膜结构域.氨基酸同源序列多重比对发现,该基因与野蔷薇(R.multiflora)和玫瑰(R.rugosa)具有较高的同源性,其中与野蔷薇同源性为86%,玫瑰同源性为84%.实时荧光定量PCR结果表明,该基因在木香花不同组织中均有表达且存在组织特异性,在幼叶及成熟叶中的表达量相对较高,在根、茎及花瓣中的表达量相对较低.RbRdr1基因在受黑斑病菌侵染不同时期的成熟叶片中,其相对表达量均表现为诱导积极上调,且在侵染6h最高.综上,RbRdrl基因可能参与了木香花与黑斑病菌早期的互作过程.
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编辑人员丨2023/8/5
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