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SPATS2通过激活NOTCH信号通路促进喉鳞状细胞癌进展的机制研究
编辑人员丨3天前
目的:探究丝氨酸精子发生相关蛋白2(spermatogenesis associated serine rich 2,SPATS2)影响喉 鳞 状 细 胞 癌(larynx squamous cell carcinoma,LSCC)增 殖、迁 移、侵 袭 和 上 皮 间 质 转 化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)发生的分子机制,从而为寻找LSCC筛查、诊断和治疗的潜在靶点提供理论依据.方法:从TCGA数据库中下载LSCC临床及RNA-seq数据并进行整理,从中提取SPATS2的mRNA表达数据,并用R 4.3.1进行分析作图;用R4.3.1进行单基因差异分析后所得基因集进行基因本体分析(gene ontology,GO)和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA);用CCK8、克隆形成实验、划痕实验、Transwell实验、Western blot验证敲减或过表达SPATS2后细胞的增殖、迁移和侵袭能力,用qRT-PCR检测目的基因mRNA水平变化,并用ImageJ、GraphPad Prism8和IBM SPSS Statistics 25对结果进行定量与统计学分析.结果:通过生信分析发现,LSCC组织中SPATS2的mRNA水平显著高于癌旁组织(P<0.001),且高水平SPATS2不利于患者生存(P=0.021).过表达或敲减SPATS2后,细胞的增殖、迁移、侵袭能力及波形蛋白(Vimentin)、N-钙黏蛋白(N-Cadherin)、NOTCH1、cleaved-NOTCH1的表达水平、NOTCH信号通路下游靶基因的mRNA水平均随之升高或降低.在过表达SPATS2的同时抑制NOTCH信号通路可以逆转由单独过表达SPATS2导致的细胞增殖、迁移、侵袭能力增强和EMT水平升高的结果.结论:SPATS2能够通过影响NOTCH信号通路影响LSCC细胞的增殖、迁移、侵袭和EMT等恶性表型,进而影响LSCC进展.
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编辑人员丨3天前
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胃癌中新颖hsa_circ_0003071的特征、功能及预后分析
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究胃癌中环状RNA hsa_circ_0003071的基本特征、功能预测及生存预后分析.方法:通过PCR扩增验证胃癌与癌旁组织中hsa_circ_0003071的表达量,利用PCR扩增及一代测序验证hsa_circ_0003071反向剪接位点,利用核糖核酸酶R(RNase R)处理,细胞质细胞核RNA分离和定量PCR以及蛋白质翻译的潜能分析研究hsa_circ_0003071的基本特征.利用生信方法预测hsa_circ_0003071上微RNA(miRNA)的结合位点以及miRNA的靶基因,并构建circRNA-miRNA-mRNA网络,随后利用基因本体论(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)对miRNA的下游靶基因合集进行功能注释.结合生信方法获得hsa_circ_0003071调控的下游关键靶基因在胃癌的生存预后分析.结果:PCR实验证实胃癌中hsa_circ_0003071的表达量显著低于癌旁组织.CircBase注释显示hsa_circ_0003071是由基因SPATS2L转录本NM_001100422中第6号外显子经反向剪接构成,并且PCR扩增和一代测序共同验证了hsa_circ_0003071的反向剪接位点.hsa_circ_0003071可以抵抗RNase R处理,并且主要分布于细胞质.蛋白质翻译分析显示,hsa_circ_0003071具有翻译蛋白的潜能,其开放阅读框可能编码含124个氨基酸的蛋白质.生信预测显示hsa_circ_0003071具有多个miRNA结合位点,取数据库交集的两个miRNA(has-miR-604、has-miR-1205)预测其下游靶基因共148个,随之构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络.GO分析结果显示,上述靶基因合集分别在12个生物学过程条目和2个分子功能条目中显著富集;KEGG通路分析结果显示,上述靶基因合集在mRNA监测通路和Hippo信号通路显著富集.结论:本研究分析了胃癌中新型环状RNA hsa_circ_0003071的表达量、反向剪接位点、RNase R酶的抵抗性和主要分布在细胞质等基本特征,从蛋白质翻译、circRNA-miRNA-mRNA调控网络和环状RNA下游调控关键基因在胃癌中的预后生存分析角度为hsa_circ_0003071的功能研究提供了新的方向.
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编辑人员丨2023/8/5
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斑蝥酸钠维生素B6注射液联合不同化疗药物对晚期肝癌患者RBM38、SPATS2及预后的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的:观察斑蝥酸钠维生素B6注射液联合不同化疗药物对晚期肝癌患者RBM38、丝氨酸精子发生相关蛋白2(SPATS2)及预后的影响.方法:将64例晚期肝癌患者随机分成治疗组和对照组.治疗组患者予斑蝥酸钠维生素B6+OXA+5-Fu,对照组患者予OXA+5-Fu化疗.比较两组患者用药后血清中RBM38、SPATS2、AFP含量及临床表现、肝功能、药物毒性反应、生活质量改变情况及生存时间.同时根据实体瘤进行疗效评价.结果:治疗组患者缓解率高于对照组;其血清中SPATS2、AFP表达水平比对照组降低,RBM38、WBC表达升高,差异有统计学意义(均P<0.05);治疗组患者肝功能、生活质量和体力状况较对照组提高,临床症状也较对照组明显改善,差异均具有统计学意义(P<0.05);RBM38与凝血酶原、总胆红素、腹水、肝性脑病、乏力、食欲不振、腹胀、AFP、呈显著负相关(P<0.05),SPATS2与上述指标呈显著正相关(P<0.05);RBM38与白蛋白、白细胞、血钾具有显著正相关(P<0.05),SPATS2与上述指标呈显著负相关(P<0.05);RBM38与SPATS2呈显著负相关(P<0.05);治疗组患者18个月内总有效率为68.75%,24个月生存率50% 远高于对照组的33.33%和6.67%;Kaplan-Meier分析显示,RBM38和SPATS2是晚期肝癌患者的预后因素,RBM38阳性表达越高,患者预后越好,风险比为2.385,95%置信区间1.618~4.016,χ2=15.425,P<0.05.SPATS2阳性表达越高,患者预后越差,风险比为2.619,95%置信区间1.408~3.744,χ2=19.73,P<0.05.结论:斑蝥酸钠维生素B6注射液联合5-Fu+OXA可明显延长晚期肝癌患者生存时间,提高远期生存率和生活质量,改善肝功能,药物毒副反应小,晚期肝癌患者SPATS2、RBM38表达水平联合预测RBM38和SPATS2对晚期肝癌患者预后具有重要价值.
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编辑人员丨2023/8/5
