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肠道微生物来源石胆酸对脓毒症相关肝损伤的保护作用
编辑人员丨3天前
目的:探讨肠道微生物来源的石胆酸(LCA)对脓毒症小鼠肝损伤的保护作用。方法:将15只C57BL/6J小鼠分为假手术组(Sham组)、脓毒症组(Sep组)、粪菌移植组(Sep-fmt组),每组各5只。采用盲肠结扎穿孔术(CLP)构建脓毒症小鼠模型,Sham组仅行腹壁开关手术;Sep-fmt组于CLP后第2天给予粪菌液连续灌胃3 d;Sham组和Sep组根据体质量给予等剂量含10%甘油的无菌磷酸盐缓冲液连续灌胃3 d。采用粪便进行16S核糖体RNA(rRNA)测序分析并筛选出胆汁酸代谢差异代谢产物。然后将30只C57BL/6J小鼠分为假手术组(Sham组,6只)、脓毒症组(Sep组,12只)、LCA组(LCA-Sep组,12只),各组分别保证6只大鼠进行后续实验分析。LCA-Sep组在脓毒症造模之前给予100 mg/kg的LCA灌胃,连续5 d;Sham组、Sep组根据体质量给予等剂量溶媒连续灌胃5 d。采用粪便进行16S rRNA测序分析,观察各组小鼠死亡情况并进行临床严重程度评分(CSS)。检测血清肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)、IL-10水平并评估各组小鼠肝脏组织病理损伤。结果:Sham组、Sep组和Sep-fmt组小鼠各次级胆汁酸比较,差异均有统计学意义(P均< 0.001),且Sep-fmt组中LCA的增幅最大,故后续实验选取LCA对脓毒症小鼠进行灌胃。CLP术后24 h,Sham组小鼠无死亡,Sep组小鼠死亡4只,LCA-Sep组小鼠死亡2只;各组存活小鼠CSS比较,差异具有统计学意义[(1.0 ± 0.0)、(3.5 ± 0.5)、(2.5 ± 0.5)分,F = 47.500,P < 0.001]。α多样性分析显示,3组小鼠肠道菌群丰富度[Chao1指数和基于丰度的覆盖估计值(ACE)指数]和多样性(Shannon指数和Simpson指数)比较,差异均有统计学意义(H = 8.766、8.766、9.704、10.994,P均< 0.05),且LCA-Sep组肠道菌群多样性高于Sep组(P均< 0.05)。β多样性分析显示,3组小鼠的菌群结构存在显著差异(H = 18.322,P = 0.001)。3组小鼠拟杆菌门的平均相对丰度分别为62.17%、11.10%、34.47%,变形菌门的平均相对丰度分别为10.99%、62.81%、40.58%。3组血清TNF-α、IL-6、IL-10及肝脏切片中TUNEL阳性细胞数比较,差异均有统计学意义(H = 14.749、14.363、15.158,F = 131.688,P均< 0.001),且Sep组TNF-α、IL-6水平及肝脏切片中TUNEL阳性细胞数更高,LCA-Sep组IL-10水平更高(P均< 0.05)。免疫荧光结果显示,Sham组M2巨噬细胞数表达较多,Sep组M2巨噬细胞数表达有所减少;给予LCA预处理后,LCA-Sep组小鼠肝组织M2巨噬细胞数表达较Sep组增加。结论:脓毒症可导致小鼠肠道菌群失调、炎症因子升高和肝细胞损伤;肠道菌群代谢产物LCA可以下调脓毒症小鼠肠道菌群中的潜在致病菌丰度,促进M2巨噬细胞的极化,减轻全身炎症水平和肝细胞凋亡。
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编辑人员丨3天前
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山区河流底栖动物多样性和稳定性对土地利用方式的响应机制
编辑人员丨3天前
近年来生物"多样性与稳定性"理论是河流生态学关注的热点之一.为探究河流底栖动物多样性与群落稳定性的分布模式及其驱动因子,于2021年8月,基于环境DNA技术对黄河流域济南段山区河流进行生物监测.根据土地利用类型,将该山区河流分为低干扰区、中干扰区和高干扰区,分析不同干扰区环境因子、底栖动物多样性及群落稳定性的分布特征,并识别其影响要素.研究结果表明:①环境因子中电导率(EC)、总氮(TN)和硝态氮(NO3--N)均值呈现出高干扰区>中干扰区>低干扰区的趋势.②Margalef丰富度指数(d)、Pielou均匀度指数(J)、群落稳定性指数(ICV)和凝聚力指数(|负凝聚力|/正凝聚力)均在中干扰区最高.③氨氮(NH3-N)和生物群落组成变化分别与d(r=0.67,P<0.05)和物种丰度S(r=0.52,P<0.05)具有显著正相关关系.④结构方程模型分析发现,EC、NH3-N和NO3--N是显著影响底栖动物群落稳定性的关键环境因子;S和d是显著影响底栖动物群落稳定性的关键生物因子.其中,EC、NH3-N和d有利于群落趋于稳定;高浓度的NO3--N和较低的S虽然不利于群落稳定,但会促进群落的种间竞争关系.研究揭示了生物与非生物因子对河流底栖动物多样性及其群落稳定性的作用机制,可为今后河流生态系统健康管理提供重要参考.
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编辑人员丨3天前
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土壤基质影响下叶凋落物际细菌群落特征及其与分解速率的关联性
编辑人员丨3天前
植物凋落物在土壤有机质形成过程中扮演重要角色,在局域尺度上其分解速率与土壤生境密切相关.不同土壤基质下的凋落物分解快慢不同,进而影响土壤碳周转及养分利用效率.与叶凋落物分解密切相关的微生物群落主要来源于叶凋落物际,这些微生物群落在土壤养分循环和有机物分解过程中发挥着至关重要的作用,然而目前关于叶凋落物际中微生物群落动态变化的研究还相对较少.研究以喜旱莲子草(Alternanthera philoxeroides)的叶凋落物为研究对象,通过高通量测序研究不同土壤(有机土、铁铝土、冲积土)和分解阶段(30%、60%、90%)下叶凋落物际细菌群落的动态变化及其对凋落物分解的影响.结果表明:随着分解的进行,叶凋落物际细菌群落多样性逐渐升高,并且群落多样性水平越高(Alpha多样性:有机土>冲积土>铁铝土),其分解速率越快(k:有机土>冲积土>铁铝土).研究进一步发现,叶凋落物际细菌群落组成变化受土壤类型和分解阶段显著影响(P<0.001),但前者作用效应更大.具体而言,不同土壤基质下的叶凋落物际优势菌不同,有机土和冲积土基质中均由变形菌门(Proteobacteria)主导(分别占55.33%和53.10%),铁铝土基质中则以放线菌门(Actinobacteriota)为主(占比为63.95%).受分解阶段影响,不同土壤基质下叶凋落物际各优势菌门的平均相对丰度在分解后期均有所下降,而以绿弯菌门(Chloroflexi)为代表的寡营养菌(oligotrophic taxa)在分解后期显著增加(P<0.05),与分解前期相比增加了 5.66-413.80倍.此外,在不同土壤中,叶凋落物际细菌群落构建均受确定性过程影响,其共现网络复杂度在冲积土、有机土、铁铝土中依次降低,变形菌门和放线菌门在整个叶凋落物际细菌群落的构建和维持中扮演着关键角色.研究揭示了不同土壤基质调控叶凋落物际细菌群落组成及多样性进而影响凋落物分解过程,这为深入理解叶凋落物际细菌群落在生态系统养分循环过程中的关键作用提供了数据支撑.
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编辑人员丨3天前
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生物多样性保护成效评估指标体系和评价方法研究进展
编辑人员丨3天前
生物多样性保护是实现生态系统可持续发展的前提,生物多样性保护成效评估是生物多样性监管的基础,科学、有效的评估能够明显提升生物多样性保护与管理水平,并显著改善区域生态环境.总体来看,现有的保护成效评估主要围绕自然保护地、生态环境和生物多样性等研究对象的状态和变化两个层面开展,评估指标体系的侧重点逐渐由管理成效向保护成效转变,评估方法基本涵盖了全球、地区、国家和单个自然保护地等多种空间尺度.然而,由于缺乏统一的指标体系和评价方法,导致区域间的评估结果难以比较,因此多尺度集成评估也难以开展.近年来,全国生物多样性监测网络和数据库的建立,以及多种新技术(如遥感、环境基因组学等)在生物多样性监测中的应用,使得宏观生态系统和微观基因水平的多层次连续监测成为可能.基于此,建议未来我国生物多样性保护成效评估应在认真总结全球生物多样性保护成效评估理论和方法的基础上,加强全国生物多样性监测网络的建设,发展适合中国区域特点的跨学科的综合保护成效评估指标体系.定期的生物多样性保护成效评估,有助于全面了解我国生物多样性保护现状及发展趋势,进而为生物多样性保护和管理决策提供支持和服务,也为中国履行生物多样性公约、实现联合国可持续发展目标提供数据和技术支持.
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编辑人员丨3天前
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重症急性胰腺炎肠道菌群特征及早期肠内营养联合微生态制剂治疗的临床价值
编辑人员丨3天前
目的:分析重症急性胰腺炎(SAP)肠道菌群特征,探讨早期肠内营养联合应用微生态制剂的临床价值。方法:选择前瞻性队列研究方式,选取2021年1月至2022年12月在沧州市人民医院治疗的SAP患者80例作为观察组,按照随机数字表法分为观察A组(40例)和观察B组(40例),选择同期体检健康人群的20例为对照组,以16S rDNA V3-V4区段实施PCR扩增,采取Illumina Miseq高通量测序平台评价肠道菌群特征。观察A组给予早期肠内营养,观察B组给予早期肠内营养联合应用微生态制剂治疗,评价治疗后的临床疗效,对比治疗前后的腹内压、胃肠功能、血清炎症因子以及血清脂肪酶、淀粉酶等指标。结果:α多样性分析结果提示:观察组在Shannon指数上明显低于对照组(P<0.05),在Chao指数方面差异则无统计学意义(P>0.05)。在肠道菌群门水平上,观察组在变形菌门相对丰度较高,厚壁菌门相对丰度明显较低;在属水平上,观察组在大肠志贺菌属和类杆菌相对丰度较高,布劳特菌属、双歧杆菌属及链球菌相对丰度较低。观察B组临床疗效好于观察A组(P<0.05)。治疗7 d、14 d,观察B组淀粉酶、脂肪酶、乳酸脱氢酶、白介素-6、肿瘤坏死因子-α、降钙素原、腹内压、胃肠功能评分均明显低于观察A组(P<0.05)。结论:在SAP患者肠道菌群中致病性菌群多样性和丰度增加、有益菌多样性和丰度减少。早期肠内营养联合微生态制剂应用于SAP治疗能够提高疗效,促进血清指标恢复。
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编辑人员丨3天前
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原发性胶质母细胞瘤瘤内细菌特征基因及其功能研究
编辑人员丨3天前
目的 分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制.方法 采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例.根据GBM患者总生存时间的中位数,将其分为低生存组(78例)和高生存组(74例).使用秩和检验评估组间α多样性的差异;采用非度量多维尺度(NMDS)分析和主坐标分析(PCoA)评估组间β多样性的差异;采用线性判别分析(LDA)比较两组GBM样本中丰富度存在显著差异的细菌种类.分别根据各差异细菌相关特征基因的相对丰富度将152例患者分为高丰富度组和低丰富度组,采用Kaplan-Meier法分析高丰富度组与低丰富度组患者生存率的差异.对与良好预后相关的高丰富度细菌相关特征基因GBM样本中显著上调的基因进行基因本体论(GO)生物过程功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过TCGA转录组测序数据集分析肿瘤免疫微环境景观,应用曼特尔检验分析免疫细胞浸润含量与预后相关细菌特征基因的相关性.所有数据分析均采用R软件,以P<0.05为差异有统计学意义.结果 152例GBM组织中共鉴定出252种细菌相关特征基因,其中234种特征基因在低生存组与高生存组均存在,8种仅存在于低生存组,10种仅存在于高生存组.NMDS和PCoA结果显示,两组的β多样性的差异有统计学意义(P<0.05).LDA显示,高生存组与低生存组的肿瘤组织中细菌相关特征基因的丰富度存在差异(P<0.05),其中脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存组的丰富度较高(P<0.05),并与患者的总生存期呈正相关(x2=4.13,P<0.05).功能富集分析显示,肿瘤内脆弱拟杆菌相关特征基因丰富度较高的患者肿瘤组织中高表达与免疫途径相关的基因(P<0.05).曼特尔检验分析结果显示,原发性GBM肿瘤组织中脆弱拟杆菌相关特征基因的丰富度与M1巨噬细胞浸润呈正相关(P<0.05).结论 脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存原发性GBM患者肿瘤组织中的丰富度较高,并影响肿瘤的免疫微环境.
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编辑人员丨3天前
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糖尿病肾病患者肠道菌群生态特点与胃肠道功能障碍的关联性研究
编辑人员丨3天前
目的:分析糖尿病肾病(DKD)患者肠道菌群生态特点,并探究肠道菌群生态特点与患者胃肠道功能障碍的关联性。方法:选取无锡市锡山人民医院2021年3月至2023年3月收治的150例DKD患者,纳入DKD组,并选取同期2型糖尿病(T2DM)患者80例,纳入T2DM组。采集患者新鲜粪便样本,行16sRNA检测,比较2组肠道菌群组成、丰度和多样性差异。按照DKD组患者胃肠道功能障碍症状是否存在,将其分别纳入有功能障碍组、无功能障碍组,对比2亚组患者肠道菌群特点,分析DKD及胃肠道功能障碍与肠道菌群生态特点的关联。结果:α多样性分析提示,DKD组Chao指数明显高于T2DM组,Shannon指数明显低于T2DM组,差异均有统计学意义(P<0.05)。β多样性主成分分析提示,DKD组、T2DM组肠道菌群结构存在差异性(P<0.05)。门水平上,DKD组厚壁菌门相对丰度较低,变形菌门相对丰度较高;在属水平上,DKD组在大肠志贺菌属相对丰度增加,布劳特菌属、拟杆菌相对丰度降低。150例DKD患者中,103例(68.67%)合并胃肠道功能障碍症状。在厚壁菌门相对丰度水平方面比较,有功能障碍组低于T2DM组和无功能障碍组。在变形菌门相对丰度水平方面,有功能障碍组高于T2DM组和无功能障碍组(P<0.01)。有功能障碍组在厚壁菌门与超敏C反应蛋白、白介素-6呈现正相关,而变形菌门与超敏C反应蛋白、白介素-6呈现负相关(P<0.05)。结论:DKD患者致病性菌群多样性和丰度增加、有益菌多样性和丰度减少。DKD患者发生胃肠道功能障碍可能与厚壁菌门相对丰度降低,变形菌门相对丰度升高有关。
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编辑人员丨3天前
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Temperature is a cryptic factor shaping the geographical pattern of genetic variation in Ceratophyllum demersum across a subtropical freshwater lake
编辑人员丨3天前
Macrophyte habitats exhibit remarkable heterogeneity,encompassing the spatial variation of abiotic and biotic components such as changes in water conditions and weather as well as anthropogenic stressors.Environmental factors are thought to be important drivers shaping the genetic and epigenetic variation of aquatic plants.However,the links among genetic diversity,epigenetic variation,and environmental variables remain largely unclear,especially for clonal aquatic plants.Here,we performed population genetic and epigenetic analyses in conjunction with habitat discrimination to elucidate the environ-mental factors driving intraspecies genetic and epigenetic variation in hornwort(Ceratophyllum demer-sum)in a subtropical lake.Environmental factors were highly correlated with the genetic and epigenetic variation of C.demersum,with temperature being a key driver of the genetic variation.Lower temper-ature was detected to be correlated with greater genetic and epigenetic variation.Genetic and epigenetic variation were positively driven by water temperature,but were negatively affected by ambient air temperature.These findings indicate that the genetic and epigenetic variation of this clonal aquatic herb is not related to the geographic feature but is instead driven by environmental conditions,and demonstrate the effects of temperature on local genetic and epigenetic variation in aquatic systems.
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编辑人员丨3天前
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载脂蛋白E在急性缺血性脑卒中的预测和功能转归评估中的应用
编辑人员丨3天前
目的 近年来许多研究证明多种疾病与载脂蛋白E(APOE)基因多样性相关,本文旨在探讨APOE基因在颅内血管狭窄引起的急性缺血性卒中的预测价值及评估其预后的作用.方法 收集2022年1月-2023年12月中国科学技术大学附属第一医院收治的急性缺血性脑卒中(AIS)患者511例,根据是否有颅内动脉狭窄将其分成颅内动脉狭窄(ICAS)组(317例)和非颅内动脉狭窄(NCAS)组(194例)及6个月随访时根据是否携带APOE-e4将其分为携带e4基因(213例)组和非携带e4(298例)组,分析年龄、性别、合并症、血脂、载脂蛋白E(包括等位基因分型)和脂蛋白a的差异,并进行血管壁高分辨率磁共振成像.术后6个月随访患者的功能转归,随访高清血管壁成像结果.结果 ICAS组的APOE浓度显著低于NCAS组(r=0.481,P<0.01).携带APOE-e4基因的患者中45.54%(97/213)和未携带APOE-e4基因的患者中16.11%(48/298)在治疗结束6个月随访时预后不良(OR=4.622,95%CI:3.512~6.091,P<0.01).结论 血浆APOE水平低是ICAS引起的急性缺血性卒中的高危因素,携带APOE-e4基因是AIS患者功能预后不良的高危因素.APOE-e4基因型联合高分辨率血管壁成像在预测急性缺血性卒中发生及评估功能转归方面具有一定的应用价值.
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编辑人员丨3天前
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北京丰台区过敏性鼻炎患者血清过敏原检测结果分析
编辑人员丨3天前
目的 回顾性分析北京丰台区1 193 例过敏性鼻炎(AR)患者的血清过敏原检测结果,为预防和诊断AR提供临床依据.方法 纳入 2022 年 1 月至 12 月北京中医药大学东方医院耳鼻咽喉科诊断为AR且进行过敏原血清特异性IgE检测的患者1 193例,进一步分析血清过敏原结果与患者性别、年龄和季节的相关性.结果 在 1 193 例AR患者中,共有 947 例患者的血清过敏原检测结果呈阳性,阳性检出率为 79.38%.AR患者的主要过敏原为刺柏/桦、蒿、念珠菌/点青霉/分枝孢霉/交链孢霉/黑曲霉.其中,男性患者过敏原阳性率(82.15%)显著高于女性(77.23%),差异具有统计学意义(P<0.05).秋季过敏原阳性率(85.35%)最高,且不同季节之间的过敏原阳性率差异有统计学意义(P<0.05).≤14 岁组过敏原阳性率(95.68%)最高,且不同年龄段患者过敏原阳性率差异亦有统计学意义(P<0.001).结论 北京丰台区AR患者的血清过敏原具有差异性和多样性,且存在性别、季节、年龄等方面差异.
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编辑人员丨3天前
