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目的 对冬虫夏草进行转录组测序,为虫草素生物合成提供依据.方法 利用Illumina/Solexa HiSeq 2500高通量测序平台对冬虫夏草菌丝体和子实体转录组进行测序、数据组装,分析并预测虫草素生物合成途径、相关基因及差异表达量,发现代谢途径中多数酶在菌丝体发育阶段的表达水平较高.采用cDNA克隆技术从新鲜冬虫夏草子实体中克隆到核糖核苷酸还原酶(RNR)基因亚基.结果 其中RNR是腺苷代谢的关键酶,从转录组数据中挖掘到RNR大、小亚基各1条,及4条RNR同源序列.RNR大亚基(RNRL)cDNA全长2 733 bp,编码910 aa,RNR小亚基(RNRM) cDNA全长1 257 bp,编码418aa.通过保守区域和功能结构域分析发现主要催化活性位点位于RNRL,RNRM含有铁结合蛋白保守位点,大小亚基均含有二聚体和亚基结合区域.结论 基于转录组测序预测,以RNR为切入点研究虫草素合成途径,为最终揭示虫草素生物合成机制提供数据支持.

作者:黄羽琪;童锌芯;陶向;王玉贤;彭成;汪松虎;国锦琳

来源:中草药 2017 年 48卷 19期

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作者:
黄羽琪;童锌芯;陶向;王玉贤;彭成;汪松虎;国锦琳
来源:
中草药 2017 年 48卷 19期
标签:
冬虫夏草 转录组 虫草素 核糖核苷酸还原酶 cDNA克隆 Ophiocordyceps sinensis (Berk.) Sacc. transcriptomes cordycepin RNR enzyme cDNA clone
目的 对冬虫夏草进行转录组测序,为虫草素生物合成提供依据.方法 利用Illumina/Solexa HiSeq 2500高通量测序平台对冬虫夏草菌丝体和子实体转录组进行测序、数据组装,分析并预测虫草素生物合成途径、相关基因及差异表达量,发现代谢途径中多数酶在菌丝体发育阶段的表达水平较高.采用cDNA克隆技术从新鲜冬虫夏草子实体中克隆到核糖核苷酸还原酶(RNR)基因亚基.结果 其中RNR是腺苷代谢的关键酶,从转录组数据中挖掘到RNR大、小亚基各1条,及4条RNR同源序列.RNR大亚基(RNRL)cDNA全长2 733 bp,编码910 aa,RNR小亚基(RNRM) cDNA全长1 257 bp,编码418aa.通过保守区域和功能结构域分析发现主要催化活性位点位于RNRL,RNRM含有铁结合蛋白保守位点,大小亚基均含有二聚体和亚基结合区域.结论 基于转录组测序预测,以RNR为切入点研究虫草素合成途径,为最终揭示虫草素生物合成机制提供数据支持.

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