类鼻疽是由类鼻疽伯克霍尔德菌感染引起的一种人畜共患病，易误诊，急性病死率高，治疗困难，反复发作。其病原体类鼻疽伯克霍尔德菌具有特殊的胞内感染特性和潜在的生物威胁，目前医务人员对类鼻疽的认识不足，多数医疗机构对该病的诊治水平有限，缺乏诊疗规范指导。中国微生物学会医学微生物学与免疫学专业委员会联合重庆市微生物学会临床微生物专业委员会组织来自微生物学、流行病学、感染病学、呼吸病学、临床检验诊断学等多学科专家共同制订了《类鼻疽诊断与治疗专家共识》，从该病的流行特征、病原学、临床特征、诊断与鉴别诊断、治疗及预防措施等方面进行详细介绍和建议，以期提高我国类鼻疽诊治水平，规范临床管理，降低病死率。

患儿男，1岁，因“间断发热半个月”入院。查体：腹部膨隆，肝左叶可扪及，剑突下5 cm。实验室检查：ALT 50 U/L，AST 89 U/L，乳酸脱氢酶1 004 U/L，羟丁酸脱氢酶722 U/L；EB病毒IgG阳性，巨细胞病毒IgG阳性，EB病毒核抗原IgG抗体阳性。血液病原微生物监测：洋葱伯克霍尔德菌复合群、EB病毒序列数增加。肿瘤标志物：甲胎蛋白1.22 ng/ml，癌胚抗原0.93 ng/ml。彩超：肝左叶非均质回声，见一大小约56 mm×43 mm低回声区。CT：肝左叶可见稍低密度肿块影，右侧边界欠清，左侧边界清，约38 mm× 42 mm× 51 mm，增强扫描可见轻度不均匀强化（图1）。胸部CT平扫未见异常。超声科会诊后，不建议行“超声引导下肝脏肿物穿刺引流术”，患者反复发热、肝脏占位较前增大，抗感染治疗疗效欠佳。遂行肝左叶肿瘤切除术+肝门淋巴结切除术。术后短期恢复可。病理：EB病毒阳性NK/T细胞增殖性疾病，结合免疫表型及EBER 原位杂交考虑为：（1）结外NK/T 细胞淋巴瘤，鼻型；（2）EB病毒阳性NK/T细胞增殖性疾病肿瘤期（图2）。免疫组化：CD3（+），CD20（-），PAX-5（-），CD5（-），CD2（+），CD7（-），CD56（-），TIA-1（+），GrB（+），Ki-67（约70%+），CD4（±），CD8（+），EBNA-2（-）。原位杂交：EBER（+）。术后淋巴瘤基因重排检测：TCRB Dβ-Jβ 位点存在单克隆重排（+++），提示淋巴瘤可能。患儿病理诊断明确，告知家属NK/T细胞淋巴瘤易并发嗜血细胞综合征，进展快，预后欠佳，建议尽早化疗，家属拒绝继续治疗，术后11 d 出院后失访。

目的:探讨人乳头瘤病毒（HPV）16亚型感染的子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群的分布及特征。方法:前瞻性横断面研究。选取2019年8月至2020年6月就诊于中国医学科学院肿瘤医院的6例HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者（子宫颈癌组），选取同期体检人群中液基薄层细胞学检查未见异常且HPV阴性6名健康女性为健康对照组。患者抗肿瘤治疗前、健康对照者体检时用无菌棉拭子采集子宫颈后穹窿处分泌物，采用高通量测序技术扩增细菌16S rRNA基因V1-V2高变区，分析菌群分布及特征。结果:子宫颈癌组和健康对照组年龄分别为（51±8）岁、（48±3）岁，差异无统计学意义（ t=0.63， P=0.540），两组均有孕产史，无吸烟史。α多样性分析结果显示，与健康对照组比较，子宫颈癌组sobs指数（ t=3.25， P=0.009）及chao指数（ t=2.91， P=0.016）均高，差异均有统计学意义；子宫颈癌组shannon指数高（ t=2.07， P=0.065），simpson指数低（ t=1.74， P=0.113），但差异均无统计学意义。采用基于bray-curtis距离的主坐标分析（PCoA）进行数据降维分析显示，子宫颈癌组与健康对照组间β多样性差异具有统计学意义（ R2=0.154， P=0.018）。门水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组厚壁菌门占比低（30.21%比68.28%），拟杆菌门占比略低（6.87%比8.11%），而放线菌门（26.91%比14.42%）及变形菌门（27.33%比0.67%）占比高。属水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组乳杆菌属及棒状菌属占比低，失去优势菌群，而红球菌属、克雷伯菌属、气球菌属等占比明显高，且子宫颈癌组菌群种类较健康对照组多。线性判别分析（LDA）显示，属水平上，红球菌属（LDA=5.04）、克雷伯菌属（LDA=4.71）、肠杆菌属（LDA=4.29）、罗尔斯通菌属（LDA=4.28）、苍白杆菌属（LDA=4.23）、韦荣球菌属（LDA=4.14）为子宫颈癌组特征菌群；门水平上，健康对照组厚壁菌门（LDA=5.23）可为标志性物种；种水平上，子宫颈癌组红球菌（ P=0.025）、罗尔斯通菌（ P=0.045）、韦荣氏球菌（ P=0.044）、卡氏伯克霍尔德菌（ P=0.045）、假单胞菌（ P=0.043）等均较健康对照组多，差异均有统计学意义。 结论:HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群多样性、丰富度较健康女性增加，乳杆菌属丰度下降；红球菌属、克雷伯菌属可作为其标志性下生殖道菌群，但仍需进一步验证。

目的:探讨慢性肉芽肿病(CGD)患儿的治疗和预后情况，以加强临床医师对该病的管理，提高患儿生存质量。方法:纳入重庆医科大学附属儿童医院明确诊断为CGD且于1999年1月至2016年12月出生的82例患儿，分为存活组和死亡组，对其一般特征、感染、炎症并发症、治疗及生存情况进行分析。结果:82例患儿中存活组55例(67.1%)，死亡组27例(32.9%)。49例(59.8%)新生儿期即出现症状，死亡组所占比例(81.5%)高于存活组(49.1%)，差异有统计学意义( P<0.05)。确诊后58例(70.7%)开始服用复方磺胺甲 唑预防感染，平均用药36.8个月；52例(63.4%)接受伏立康唑或伊曲康唑预防真菌感染，平均用药34.3个月。82例患儿累计因感染住院288次，细菌、真菌、结核分枝杆菌三大病原检出率为41.3%，死亡组(51.8%)高于存活组(36.9%)，差异有统计学意义( P<0.05)。检出细菌以肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、洋葱伯克霍尔德菌、大肠埃希菌为主，其中肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌均为超广谱β-内酰胺酶阳性菌。死亡组患儿使用特殊级抗生素比例(70.4%)高于存活组(40.0%)，差异有统计学意义( P<0.05)。17例(20.7%)患儿出现炎症并发症，以间质性肺病或肺纤维化、炎症性肠病、不完全川崎病为主。32例(39.0%)患儿接受造血干细胞移植(HSCT)，其中25例(78.1%)于重庆医科大学附属儿童医院移植，成功率为96.0%(24/25例)。Kaplan-Meier生存分析曲线显示新生儿期即出现症状、依赖于特殊级抗生素治疗、未接受移植的患儿生存率更低。 结论:CGD患儿临床表现出现越早、特殊级抗生素使用比例越高，提示病情越重，死亡率越高；目前药物保守治疗仍有不足，耐药菌的产生更增加了治疗难度。炎症并发症的认识和治疗仍有待加强。HSCT是目前CGD患儿的唯一治愈方法。

目的:了解2016年至2018年我国下呼吸道感染患儿的肺泡灌洗液病原菌分布及其对抗菌药物的耐药情况。方法:采集2016年1月至2018年12月10家三级医院收治的年龄<18岁的下呼吸道感染患儿的肺泡灌洗液标本，培养分离获得病原菌。采用纸片扩散法或最低抑菌浓度法对分离菌株进行药物敏感试验，分析病原菌的分布情况，以及菌株来源科室情况。统计学分析采用 χ2检验。 结果:共收集肺泡灌洗液阳性分离菌株1 271株，其中革兰阴性菌606株(47.7%)，革兰阳性菌628株(49.4%)，真菌37株(2.9%)。常见的病原菌依次为肺炎链球菌(466株，36.7%)、鲍曼不动杆菌(214株，16.8%)、金黄色葡萄球菌(162株，12.7%)、肺炎克雷伯菌(105株，8.3%)、流感嗜血杆菌(94株，7.4%)、铜绿假单胞菌(79株，6.2%)、洋葱伯克霍尔德菌(67株，5.3%)和大肠埃希菌(47株，3.7%)。重症监护病房(intensive care unit，ICU)来源分离菌以革兰阴性菌为主(80.1%，428/534)，其中鲍曼不动杆菌最常见(37.3%，199/534)；非ICU来源菌株以革兰阳性菌为主(70.8%，522/737)。ICU和非ICU来源菌株中，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出率分别为45.1%(23/51)和43.2%(48/111)，耐青霉素肺炎链球菌检出率分别为10.9%(6/55)和18.5%(76/411)，耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌检出率分别为57.3%(43/75)和33.3%(10/30)。ICU来源耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌检出率高于非ICU来源菌株[49.1%(27/55)比25.0%(6/24)]，差异有统计学意义( χ2＝3.98， P＝0.046)。耐碳青霉烯类大肠埃希菌检出率为17.0%(8/47)，耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌检出率为76.6%(164/214)。78株流感嗜血杆菌分离自非ICU患儿标本，流感嗜血杆菌对氨苄西林的耐药率为57.4%(54/94)；洋葱伯克霍尔德菌均分离自ICU患儿标本，其对哌拉西林他唑巴坦、左氧氟沙星、环丙沙星、复方磺胺甲噁唑的耐药率分别为13.4%(9/67)、3.0%(2/67)、0(0/67)和9.0%(6/67)。 结论:肺炎链球菌依然是我国儿童下呼吸道感染最常见的致病菌，革兰阴性杆菌是ICU下呼吸道感染患儿主要的致病菌。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐青霉素肺炎链球菌、耐碳青霉烯类革兰阴性杆菌检出率均较高，流感嗜血杆菌对氨苄西林耐药率较高。临床经验治疗中应结合临床背景选择合适的初始抗菌药物。

洋葱伯克霍尔德菌复合群（Burkholderia cepacia complex, Bcc）是一种机会致病菌，易感染囊性纤维化（cystic fibrosis, CF）患者及免疫功能低下的非CF患者 [1]。目前缺乏相关指南明确Bcc感染患者的最佳治疗方案及预防措施 [2]。本文对Bcc感染的治疗和预防研究进展进行综述。

鼻疽伯克霍尔德菌引起的重症肺炎是一种罕见但严重的人畜共患疾病，临床早期诊断较为困难。本病例患者男，66岁，因“发热伴咳嗽、咳痰、气喘3 d”入院，胸部影像提示两肺多发病变；血培养阳性，质谱分析提示伯克霍尔德菌属，血液mNGS及肺穿刺组织mNGS测定均提示鼻疽伯克霍尔德菌。鼻疽伯克霍尔德菌肺炎临床表现无特征性，早期诊断较为困难，目前大部分医院微生物室难以鉴定鼻疽伯克霍尔德菌种。依据病马密切接触流行病学史及微生物二代测序（mNGS）有助于本病确诊。

目的:分析导管相关性血流感染草螺菌属的鉴定和药敏试验过程，提高临床医师和微生物检验工作者对罕见病原微生物关注和认知。方法:采集1例慢性肾衰竭血液透析患者经透析导管留取的血培养阳性标本，涂片、染色、镜检，并对分离到单个菌落，分别进行质谱分析、生化鉴定和药敏试验；提取细菌基因组DNA，扩增细菌16S rDNA并测序；细菌基因组高通量测序。结果:血培养瓶孵育20 h后阳性报警，涂片见革兰阴性杆菌。血琼脂上孵育16 h，见乳白色、凸起和无溶血菌落。VITEK2 Compact鉴定为洋葱伯克霍尔德菌，N335药敏卡检测药敏结果，发现该菌对氨曲南和多黏菌素耐药，其余抗生素均敏感。VITEK MS质谱仪临床数据库无法鉴定出种属，VITEK MS科研数据库鉴定为 Herbaspirillum huttiense/Herbaspirillum aquaticum。该菌16S rDNA与草螺菌属 Herbaspirillum huttiense、Herbaspirillum aquaticum一致性均>99%。细菌基因组高通量测序，发现本例临床分离株与Genbank数据库中 Herbaspirillum huttiense subsp putei IAM 15032同源性为100%，证实本例分离株为 Herbaspirillum huttiense。 结论:环境微生物演变成人类病原菌种类不断增多，草螺菌属因其生化特性与其他菌种相似，极易被误鉴定，需引起检验工作者的重视。

目的:获得不同方案培养海南岛东北部沿岸表层海水中快速生长型细菌的多样性和丰度，从而为海水来源的细菌样本分离以及海洋源病原菌感染预防提供参考。方法:基于分类设计原则，在2021年3月、6月、10月和12月对海南岛东北部沿岸6个地点的表层海水进行收集采样。然后，使用传统沙门菌、弧菌、类鼻疽伯克霍尔德菌、放线菌以及通用海洋细菌培养方案进行细菌的富集培养。之后，使用16S rDNA一代测序和宏基因组测序鉴定细菌物种分类。结果:5种方案共培养到了1 151株快速生长型可培养细菌，可鉴定为66个属，213个种。在不同培养方案中，芽孢杆菌（ Bacillus）和克雷伯菌（ Klebsiella）具有广泛的鉴别优势，并且数量排名前列。方案1的优势属为埃希菌（ Escherichia）、克雷伯菌（ Klebsiella）以及柠檬酸杆菌（ Citrobacter）。在实验已论证的病原菌中，方案1的优势检出菌为肺炎克雷伯菌（ Klebsiella pneumoniae）和大肠杆菌（ Escherichia coli），数量分别为37株和29株，独特检出菌为肠道沙门菌（ Salmonella enterica），数量为7株。方案2的优势属为变形杆菌（ Proteus）、肠球菌（ Enterococcus）和普罗威登斯菌（ Providencia）。方案2的优势检出病原菌为奇异变形杆菌（ Proteus mirabilis），数量为66株，丰度较高的独特检出菌为霍乱弧菌（ Vibrio cholerae），数量为6株。方案3的优势菌属为克雷伯菌 、埃希菌和不动杆菌（ Acinetobacter）。方案3的优势检出病原菌为肺炎克雷伯菌，数量为53株。丰度较高的独特检出菌是医院不动杆菌（ Acinetobacter nosocomialis），共培养到7株。方案4的优势属为弧菌（ Vibrio）和假交替单胞菌（ Pseudoalteromonas），在分离培养海洋性弧菌上具有优势。方案5的优势属为微小杆菌（ Exiguobacterium） 、葡萄球菌（ Staphylococcus）和芽孢杆菌（ Bacillus）。优势检出病原菌为蜡样芽孢杆菌（ Bacillus cereus）和乳酸乳球菌（ Lactococcus lactis），数量为20株和15株，丰度较高的独特检出菌也是乳酸乳球菌。宏基因组测序发现，肺炎克雷伯菌具有显著优势，基因丰度达到51.11%，其次为 Alcanivorax sp.，占比12.57%。 结论:海南岛东北部沿岸表层海水中的细菌具有丰富的多样性，肺炎克雷伯菌在该区域海水中丰度很高。不同培养方案对不同菌属和病原菌的选择性优势不同，个别海洋细菌需要进一步优化培养条件。

目的:探讨糖尿病肾病(diabetes kidney disease, DKD)模型小鼠肠肾组织晚期糖基化终产物(advanced glycosylation end product, AGEs)/钠-葡萄糖1型协同转运体(sodium-glucose cotransporter-1, SGLT-1)及肠道菌群的变化。方法:选取KKay小鼠20只，分为糖尿病组(DM组， n＝10)和糖尿病肾病组(DKD组， n＝10)，检测血清AGEs、脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α，TNF-α)、白细胞介素6(intereukin-6，IL-6)的浓度，Western blot技术检测AGEs及SGLT-1在肠肾组织的蛋白表达，高通量测序分析肠道菌群的差异。 结果:与DM组比较，DKD组小鼠炎症指标TNF-α、IL-6及内毒素水平升高，血清、肠肾组织中AGEs的含量升高、SGLT-1在肠道组织含量升高( P<0.05)。Metastats检验显示DKD组门水平上疣状微生物菌门丰度减低，变形菌门丰度升高( P<0.05)，气单胞菌属、肠杆菌属、摩根氏菌属、克雷伯菌属、沙雷氏菌属、伯克霍尔德菌属等G -菌相对优势分布，阿克曼氏菌属丰度显著低于DM组( P<0.05)。 结论:DKD小鼠肠道AGEs的升高可能诱发肠道菌群失调，尤其是变形菌门升高、疣状微生物菌门及阿克曼氏菌属降低，导致G -菌渗漏入血产生肠源性内毒素血症引起炎症反应，这可能是DKD发病的重要因素。SGLT-1在肠道组织升高，这可能进一步参与DKD的病情发展。