目的:掌握克里米亚-刚果出血热病毒（CCHFV）核蛋白（NP）和糖蛋白（GP）片段的精细抗原表位谱分布，明确优势抗原表位在克里米亚-刚果出血热（CCHF）实验室检测中的价值。方法:2014—2021年在新疆大学生命科学院实验室将CCHFV YL04057株采用改良生物肽合成方法分段表达出由8个氨基酸组成的最小合成短肽，以CCHFV多克隆抗体或单克隆抗体14B7（IgM）或CCHFV阳性羊血清为抗体，用免疫印迹方法鉴定出NP和GP片段上具有抗原活性的最小抗原表位（BCE），并采用邻接法将获得的具有序列多态性的BCE与不同地区的CCHFV进行空间聚类，确定BCE组合方式与地理区域分布的相关性，探讨其在建立血清学诊断中的应用价值。采用原核表达质粒（pET-32a、pGEX-KG）和带有不完整谷胱甘肽（GST188）标签的原核表达质粒（pXXGST-ST-1）构建和表达NP片段上6个不同肽段长度的优势抗原表位，建立间接酶联免疫吸附测定（ELISA）检测方法，以经免疫荧光法（IFA）鉴定的CCHF羊血清为对照，统计分析不同肽段长度的抗原表位重组蛋白与IFA检测结果的特异度、敏感度和总符合率。结果:CCHFV NP和GP片段共有30个具有抗原活性的BCE，其中NP片段抗原表位集中的核心中间片段NP 2（aa 170~305）有6个BCE，两端的NP 1（aa 1~200）和NP 3（aa 286~482）有9个BCE；GP片段的Gc（aa 1~558）和Gn（aa 533~708）片段有14个BCE和1个包含15个氨基酸的长抗原肽（AP），NP片段BCE氨基酸序列的同源性为97.1%，GP片段对应的同源性为89.1%。在GP片段9个具有序列多态性的BCE中，由GnEc1、GnE2、GnE4、GcE3、GcE6和GcAP-4（Ap）6个组合BCE可将15株来自全球不同地区的CCHFV聚类成亚洲Ⅰ、亚洲Ⅱ、非洲Ⅰ、非洲Ⅱ和欧洲 5个地理类群。构建表达的PET-32a-NP（全长）、PGEX-KG-NP 2（aa 170~305）、pGEX-KG-NP 2-1（aa 235~275）、PGEX-KG-NP 2-1-1（aa 237~256）、pXXGST-1-NP 2-1-2（aa 250~265）和PGEX-KG-NP 2-1-3（aa 260~276）6个重组蛋白CCHFV NP兔多克隆抗血清（pAb）免疫印迹反应阳性，以33份经IFA CCHF检测的羊血清为参照，以NP 2和NP 2-1 2个片段构建的重组蛋白为抗原建立的间接ELISA检测方法检测敏感度、特异度和总符合率最好，敏感度分别为73.4%（11/15）和66.7%（10/15），特异度分别为100%（18/18）和94.4%（17/18），总符合率分别为87.9%（29/33）和81.8%（27/33）。 结论:CCHFV NP和GP上分布着数量较多的具有抗原免疫活性的BCE，其中，优势抗原表位在CCHF实验室血清学诊断中具有较高的应用价值。

目的:建立可检测杜贝病毒（dugbe virus，DUGV）、盖勒尤卜病毒（qalyub virus，QALV）和蒂亚福拉病毒（thiafora virus，TFAV）等三种内罗病毒基因组的实时荧光RT-PCR检测方法。方法:收集、整理，比对、分析在公共数据库发布的三种病毒基因组S节段核苷酸序列，确定检测靶标，利用生物信息软件设计特异性引物、探针，优化检测程序，建立实时荧光定量RT-PCR检测方法，利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果:所建实时荧光定量RT-PCR检测方法均可有效扩增检测病毒靶标RNA，检测限分别为160 copies/μL，20 copies/μL和10 copies/μL，检测科萨努尔森林病病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增，三种内罗病毒相互间无交叉反应，重复性分析显示变异系数均在2%以内。结论:本研究建立的检测DUGV、QALV和TFAV的实时荧光RT-PCR方法，可用于相关临床样本、媒介、宿主动物标本以及进出口物品筛查检测。

目的:建立可以检测阿瓦朗病毒(Avalon virus，AVAV)和休斯病毒(Hughes virus，HUGV)两种内罗病毒的实时荧光定量RT-PCR检测方法，并进行初步的评价。方法:收集、整理、比对、分析在公共数据库发布的两种病毒基因组核苷酸序列，确定检测靶标，设计特异性引物、探针，优化检测程序，建立实时荧光定量RT-PCR检测方法。利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果:所建实时荧光定量RT-PCR检测方法可有效扩增检测AVAV和HUGA靶标RNA，检测限分别约为20拷贝/μl和70拷贝/μl，检测科萨努尔森林病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、发热伴血小板减少综合征、内罗毕羊病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增，两种内罗病毒相互间无交叉反应，重复性比较分析显示变异系数小于2%。结论:本研究建立的检测AVAV和HUGV的实时荧光定量RT-PCR方法，可用于临床样本检测和媒介生物、宿主动物标本筛查，便于病原的快速识别和疾病诊断。

2024年6月,全球共监测到传染病72种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(116个)、麻疹(28个)、登革热(27个)和霍乱(18个).病死率位于前5位的传染病分别为裂谷热(62.50％)、人感染H5N1禽流感(51.70％)、拉沙热(17.9％)、炭疽(10.70％)和克里米亚-刚果出血热(7.40％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、登革热、麻疹、霍乱和猴痘.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、登革热、克里米亚-刚果出血热和猴痘;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、黄热病、鼠疫、拉沙热、猴痘、麻疹、疟疾和脊髓灰质炎;美洲主要流行新型冠状病毒感染、登革热、基孔肯雅热和猴痘;欧洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘和麻疹.

2024年3月,全球共监测到传染病75种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(117个)、登革热(31个)、霍乱(19个)和麻疹(18个).病死率位于前5位的传染病分别为人感染H5N1禽流感(52.10％)、链球菌中毒性休克综合征(24.80％)、拉沙热(18.60％)、克里米亚-刚果出血热(9.20％)和猴痘(6.70％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、麻疹、霍乱、登革热和猴痘.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、登革热、猴痘、克里米亚-刚果出血热和链球菌中毒性休克综合征;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、黄热病、拉沙热、猴痘、麻疹、疟疾和登革热;美洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘、登革热、基孔肯雅热和寨卡病毒病;欧洲主要流行新型冠状病毒感染和猴痘.

2024年2月,全球共监测到传染病74种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(117个)、登革热(34个)、麻疹(18个)和霍乱(16个).病死率位于前5位的传染病分别为尼帕病毒病(100.00％)、人感染H5N1禽流感(52.10％)、猴痘(45.80％)、拉沙热(18.10％)和克里米亚-刚果出血热(9.20％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、霍乱、麻疹、登革热和脑膜炎.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚-刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、黄热病、拉沙热、猴痘、麻疹、疟疾和登革热;美洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘、登革热、基孔肯雅热和寨卡病毒病;欧洲主要流行新型冠状病毒感染、猴痘、麻疹和白喉.

2023年 11月,全球共监测到传染病69种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(116个)、登革热(34个)、麻疹(25个)和霍乱(18个).病死率位于前5位的传染病分别为人感染H5N1禽流感(52.3％)、拉沙热(17.1％)、克里米亚-刚果出血热(9.3％)、西尼罗热(8.6％)和白喉(5.6％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、疟疾、登革热、麻疹和霍乱.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚-刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、拉沙热、白喉、疟疾、脊髓灰质炎和麻疹;美洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘和登革热;欧洲主要流行西尼罗热和麻疹.

2023年10月,全球共监测到传染病72种,涉及236个国家和地区.除流行性感冒外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(115个)、登革热(38个)、麻疹(28个)和疟疾(15个).病死率位于前5位的传染病分别为人感染H5N1禽流感(52.3％)、拉沙热(17.2％)、白喉(10.8％)、克里米亚-刚果出血热(9.2％)和西尼罗热(7.6％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、登革热、麻疹、霍乱和白喉.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚-刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、拉沙热、白喉、疟疾、脊髓灰质炎和麻疹;美洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘和登革热;欧洲主要流行西尼罗热.

2023年9月,全球共监测到传染病73种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(115个)、登革热(31个)、麻疹(26个)和霍乱(14个).病死率位于前5位的传染病分别为尼帕病毒病(33.3％)、鼠疫(20.0％)、拉沙热(17.1％)、克里米亚-刚果出血热(9.4％)和西尼罗热(7.1％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、疟疾、登革热、麻疹和霍乱.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚-刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、拉沙热、白喉、脊髓灰质炎和麻疹;美洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、登革热、基孔肯雅热和寨卡病毒病;欧洲主要流行西尼罗热.

2023年8月,全球共监测到传染病72种,涉及236个国家和地区.除流感外,涉及国家和地区数量位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染(236个)、猴痘(114个)、登革热(31个)、麻疹(31个)和霍乱(16个).病死率位于前3位的传染病分别为出血热(11.8％)、脑膜炎(6.7％)和西尼罗热(6.1％).死亡病例数位于前5位的传染病分别为新型冠状病毒感染、登革热、霍乱、麻疹和白喉.亚洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、克里米亚-刚果出血热和登革热;非洲主要流行新型冠状病毒感染、霍乱、猴痘、拉沙热、脑膜炎和脊髓灰质炎;美洲主要流行新型冠状病毒感染、登革热、基孔肯雅热和猴痘;欧洲主要流行西尼罗热.