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细胞周期蛋白激酶9(CDK9)对卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)裂解复制周期的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨细胞周期蛋白激酶9(cyclin-dependent kinase 9,CDK9)在卡波氏肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi′s sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)裂解复制周期中的作用.方法 分别应用CDK9特异性抑制剂FIT-039处理或CDK9小干扰RNA(siRNA)转染iSLK.219及TREx-K-Rta BCBL-1细胞,四环素(Dox)或佛波酯(TPA)和丁酸钠刺激48 h后,分别采用荧光显微镜和实时定量PCR(qPCR)方法观察红色荧光蛋白(RFP,病毒裂解复制)阳性细胞数目及KSHV相关基因的mRNA转录水平.染色质免疫沉淀(ChIP)试验检测KSHV PAN启动子上RNA PolⅡ及其磷酸化CTD-S2的富集含量.结果 FIT-039处理和CDK9-siRNA转染后,iSLK.219细胞RFP阳性率显著降低、TREx-K-Rta BCBL-1细胞中KSHV裂解复制周期相关基因ORF50、PAN及K2的mRNA转录水平明显下降.且FIT-039处理后,TREx-K-Rta BCBL-1细胞中KSHV PAN启动子上结合的RNA PolⅡ及其磷酸化CTD-S2含量显著下降.结论 CDK9可能通过磷酸化RNA PolⅡ丝氨酸调控KSHV病毒裂解复制.
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编辑人员丨2023/8/6
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经典型卡波济肉瘤1例
编辑人员丨2023/8/6
卡波济肉瘤(Kaposi's sarcoma)又名多发性良性色素性特发性出血性肉瘤,属于内皮细胞肿瘤.该病在我国较为罕见,主要发生于新疆地区.由于获得性免疫缺陷综合征(AIDS)的蔓延,发病率明显上升[1],其发生与感染人类第8型疱疹病毒(HHV-8)相关.本文报告本院最近确诊的1例经典型卡波济肉瘤,报道如下.
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编辑人员丨2023/8/6
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卡波济肉瘤相关疱疹病毒/人类疱疹病毒8型与多发性骨髓瘤的关系
编辑人员丨2023/8/5
卡波济肉瘤相关疱疹病毒/人类疱疹病毒8型(KSHV/HHV8)与卡波济肉瘤(KS)、多中心Castleman病(MCD)、原发渗出性淋巴瘤(PEL)等多种疾病相关,最近又在多发性骨髓瘤(MM)骨髓的树突状细胞(dendritic cells)中发现其DNA存在,且有病毒源性白介素6-RNA(v-IL6-RNA)的转录。HHV8在这些疾病发病中的地位和致病机制尚不很清楚。本文简要介绍HHV8的病毒学、流行病学特征及相关疾病,重点讨论其与MM之间的关系及目前在此问题上的争论。
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编辑人员丨2023/8/5
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卡波济肉瘤临床治疗研究进展
编辑人员丨2023/8/5
卡波济肉瘤(Kaposi sarcoma,KS)是一种侵袭性淋巴血管增生性肿瘤,其发生与卡波济肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus,KSHV)感染内皮细胞密切相关.由KSHV引发的KS是艾滋病常见的并发性恶性肿瘤,多见于地中海和非洲地区,死亡率较高.卡波济肉瘤的治疗是临床面临的难题之一,近年来KS的治疗取得一定突破,尤其是联合抗逆转录病毒治疗(CART)问世后,KS发病率显著下降,患者预后得到明显改善.本文就卡波济肉瘤的临床治疗研究进展进行综述.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于网络药理学和分子对接的陈皮干预COVID-19的可能机制
编辑人员丨2023/8/5
目的:运用网络药理学及分子对接技术,筛选陈皮中与人类新型冠状病毒3CL水解酶及ACE2受体蛋白结合能力较好的活性成分,研究其干预COVID-19的潜在分子机制,为中药单体成分治疗新冠肺炎药物的研发提供参考.方法:利用TCMSP数据库获取陈皮活性成分及靶标,利用GeneCards数据库获取新冠肺炎相关靶标,通过韦恩图获取陈皮与新冠肺炎交集靶点,在STRING数据库进行交集靶点的蛋白网络互作,运用数据包进行GO富集和KEGG通路富集分析,最后通过分子对接技术,将陈皮核心化学成分与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2受体对接,筛选出结合能力较好的化学成分.结果:获得陈皮有效化学成分5个,陈皮与新冠肺炎的交集靶点15个,PPI网络主要涉及MAPK、MAPK8、CASP3、MAPK1、PTGS2、CAT、PPARG、NOS2等核心靶蛋白;GO功能富集分析,得到生物过程条目898个,细胞组成条目35个,分子功能条目70个(P<0.05);KEGG富集得139条通路(P<0.05),主要涉及肺结核、乙型肝炎、卡波济氏肉瘤疱疹病毒感染等通路;分子对接筛选得到与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2受体结合能力较好的活性成分是柚皮素和陈皮素.结论:陈皮中筛选出的关键活性成分(柚皮素和陈皮素)与SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白(Mpro)和ACE2受体有结合潜力,陈皮或可通过抗病毒、抗炎、调控细胞凋亡、调节免疫等途径,发挥抑制肺纤维化的作用.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于数据挖掘和网络药理学的中药抗血栓用药规律分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 深静脉血栓是新型冠状病毒肺炎(coronavirusdisease2019,COVID-19)危重症患者病亡和预后不佳的重要原因,挖掘中医药防治血栓的组方用药规律,为中医药用于防治COVID-19危重症患者出现深静脉血栓提供参考.方法 以中国知网和万方数据库收录的相关文献为资料来源,使用Excel 2010、Clementine 12.0软件,对纳入标准的中药进行关联规则分析,运用网络药理学的方法对核心药物组合进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,研究其作用机制并借助分子对接加以验证.结果 从中国知网和万方数据库中筛选出抗血栓方剂356个,发现25味高频中药,进一步关联分析得到7个高频药物组合.其中,核心药物组合"红花-桃仁-赤芍-川芎"的有效化学成分23个,核心药物组合与血栓的交集靶点41个,PPI网络主要涉及IL-6、VEGFA、CASP3、ALB、EGFR、MAPK8等关键靶蛋白,GO功能富集分析,得到生物过程条目971个(P<0.05),KEGG富集得到105条通路(P<0.05),主要涉及卡波济氏肉瘤疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、流体剪切力和动脉粥样硬化、乙型肝炎等通路;分子对接筛选得到与IL-6结合能力较好的活性成分是木犀草素、槲皮素、黄芩素.结论 核心药物组合中的关键活性成分可通过调控IL-6等关键靶点,借助卡波济氏肉瘤疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、流体剪切力和动脉粥样硬化、乙型肝炎等通路发挥抗血栓作用,为新冠肺炎危重症患者出现深静脉血栓的预防和治疗提供参考.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于网络药理学研究红花治疗膜性肾病的分子机制
编辑人员丨2023/8/5
目的:基于网络药理学研究红花治疗膜性肾病(MN)的潜在作用靶点及机制.方法:使用中药系统药理学数据库和分析平台筛选红花的有效成分和靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、GAD等数据库查找红花治疗膜性肾病相关的靶点.利用Cytoscape软件构建红花作用靶点与有效成分之间的关系网络,通过生物学信息注释数据库(DAVID)将红花作用于膜性肾病的有效靶点基因进行GO富集分析和KEGG通路分析.结果:根据口服利用度和药物相似性标准共筛选红花的22个有效成分,128个可作用于MN的作用靶点.关键靶点主要有蛋白激酶1(AKT1)、炎症因子白介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子(VEGF)、Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK)和细胞凋亡相关因子Caspase-3等,主要生物学过程主要包括DNA结合转录激活活性、细胞因子受体结合性、受体配体活动、细胞因子活性等,关键信号通路主要涉及晚期糖基化终末产物-受体信号通路、人类巨细胞病毒感染、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染、流体剪切应力与动脉粥样硬化、乙型肝炎等.结论:红花可能主要通过抗炎、抗细胞凋亡、促进血管生成等发挥对MN的治疗作用.
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编辑人员丨2023/8/5
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新型人疱疹病毒8型
编辑人员丨2023/8/5
人疱疹病毒8型(HHV-8)是近年来通过分子生物学途径从卡波济氏肉瘤(KS)病变部位发现并被命名的一种新型疱疹病毒,其独特的DNA序列与EB病毒及Saimiri疱疹病毒(SHV)的基因组有很高的同源性。它广泛存在于各种形式的KS中,可能是KS致病的相关因子,此外还与B细胞淋巴瘤和增生性皮肤病有关。深入研究这种病毒将有助于进一步理解病毒与宿主的相互关系以及病毒在感染复制和潜伏过程中的机制。本文就有关这方面的研究进展作了综述。
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编辑人员丨2023/8/5
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基于数据挖掘和网络药理学的中医药治疗肺结节用药规律及作用机制分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonarynodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考.方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结.构建肺结节处方数据库,运用R语言对处方进行频次统计和关联规则、聚类分析.利用网络药理学方法预测核心药物的潜在作用靶点和通路,从TCMSP数据库和OMIM等数据库中分别获取药物与肺结节相关的靶点,取交集靶点后上传至STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape 3.7.2软件中,运用Network Analyzer工具计算网络拓扑参数并得到关键靶点.最后通过分子对接技术对关键成分与靶点进行反向验证.结果 数据库共筛选得到53首处方,涉及213味中药,统计发现这些中药多味甘、苦,性寒,归肺经.关联规则分析提示甘草与茯苓、半夏是具有强关联性的3组合药对.核心药物组合"甘草-茯苓-半夏"与肺结节的交集靶点85个,经拓扑分析得到其治疗肺结节的17个关键靶点,包括转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸激酶 1(serine/threonine kinase 1,AKT1)等.基于DIVID平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,提示主要涉及肿瘤相关信号通路如癌症中的蛋白多糖(proteoglycans in cancer)、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路和丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路,以及病毒相关通路如乙型肝炎(hepatitisB)、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)和糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路等多种复杂信号通路.分子对接结果显示关键活性成分与靶点对接良好,其中黄芩素与MAPK3结合性最好.结论 中医药治疗肺结节组方用药多以健脾益肺、行气化痰、活血祛瘀为主,辅以清热散结的同时,注重调畅气机;其核心药物组合"甘草-茯苓-半夏"治疗肺结节的潜在靶点和作用机制主要参与炎症反应、免疫调控等生物学过程,为中医药治疗肺结节提供理论依据,以及进一步发掘其潜在作用机制提供方向.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于古籍文献挖掘和网络药理学的《圣济总录·口齿门》揩齿方用药规律及其核心方抗炎机制探析
编辑人员丨2023/8/5
目的 挖掘《圣济总录·口齿门》揩齿方的用药规律并分析其核心方的抗炎机制.方法 收集整理《圣济总录·口齿门》中的揩齿方,对其进行描述性统计分析、高频药对与药组分析、核心方发现分析、核心方抗炎分子机制分析.结果 共收集102首揩齿方,方剂以治疗齿龈类疾病为主,其中频数超过5的高频药物有细辛、升麻、皂荚、大青盐、麝香等33种,通过关联规则分析得到46个药对与药组,发现了药物组成为升麻、白芷、细辛、藁本的核心方.核心方中山柰酚、白芷醇等成分可通过作用于PTGS2、PIK3CA、MAPK8等多个靶点影响脂质与动脉粥样硬化、癌症、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染等多条通路发挥抗炎作用.结论 揩齿方善用风药,注重祛风止痛、芳香除臭、清热泻火.其核心方发挥抗炎作用具有多成分、多靶点、多通路的特点.
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编辑人员丨2023/8/5
