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环状RNA CCDC66A在肝细胞癌组织中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/12/9
目的 探究环状RNA卷曲螺旋结构域 66(circRNA CCDC66,下文简称CCDC66)在肝细胞癌(HCC)组织及癌旁组织中的表达及临床意义.方法 选择 2016 年 1 月至 2017 年 6 月在西北大学附属神木市医院行手术切除治疗的 106 例HCC患者作为研究对象,收集手术切除的HCC组织和癌旁组织标本.采用实时定量PCR法检测CCDC66 的表达水平.对患者进行为期 5 年的随访,探究CCDC66的表达水平与HCC患者临床病理特征及预后的关系.结果 HCC组织中CCDC66的相对表达量为 2.93±0.17,显著高于癌旁组织(1.02±0.26),差异有统计学意义(P<0.05).与CCDC66 低表达组相比,CCDC66 高表达组中TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期者、有乙型肝炎病史者、有淋巴结转移者的占比较高,且CCDC66高表达组的5年生存率较低,差异均有统计学意义(P均<0.05).多因素Cox比例风险回归模型分析结果显示,TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移和CCDC66 高表达均为HCC患者预后的独立危险因素(P均<0.05).结论 HCC患者肿瘤组织中CCDC66 表达上调,其可作为预测患者预后的生物标志物.
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编辑人员丨2023/12/9
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菘蓝ItSnRK2.1基因的克隆及其序列特性分析
编辑人员丨2023/8/6
SnRK2是ABA通路中至关重要的蛋白激酶,可通过调节下游相关蛋白质的活性来调节胁迫响应基因的表达,显著改进植物对高盐和干旱等非生物胁迫的抗性.基于SnRK2成员cDNA的UTR保守区域设计兼并引物,利用RT-PCR方法从菘蓝中克隆得到一个SnRK2全长cDNA序列,命名为ItSnRK2.1.测序显示该基因长度为1305 bp,包含一个1071 bp的完整开放阅读框,编码356个氨基酸,在GenBank数据库的登录号为MF423122.ItSnRK2.1蛋白激酶理论等电点为5.64,理论分子量为40.6 kD,属于亲水性蛋白,存在二个显著跨膜结构域,含有42处磷酸化位点,没有信号肽,最可能定位的位置是在细胞质上.ItSnRK2.1蛋白激酶的二级结构具有151个 α-螺旋、109个无规则卷曲、66个延伸链和30个 β-转角.ItSnRK2.1蛋白包含一个ATP结合位点和一个丝氨酸/苏氨酸酶活结构域,同AtSnRK2.1、AtSnRK2.5和StSnRK2.6蛋白亲缘关系最近,处在同一进化分枝.实时定量RT-PCR检测结果显示,ItSnRK2.1基因在菘蓝幼苗的根部表达量最高,其次是叶,茎的表达量最低;ItSnRK2.1基因积极参与高盐和干旱胁迫应答反应,但对ABA胁迫不敏感,表明该基因可能与植物抗逆境胁迫有关,且不依赖ABA调控通路.
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编辑人员丨2023/8/6
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CCDC家族蛋白与恶性肿瘤研究现状
编辑人员丨2023/8/5
卷曲螺旋结构域(CCDC)蛋白是存在于多种天然蛋白质中的一种蛋白质结构域,具有多项生物学功能,主要参与细胞间跨膜信号转导、遗传信号转录、促进细胞增殖和凋亡、调控恶性肿瘤细胞的侵袭和转移等多种生物学行为.CCDC19、CCDC67、CCDC134、CCDC12、CCDC66、CCDC34、CCDC85B蛋白表达异常,可导致鼻咽癌、甲状腺癌、胃癌、结直肠癌、膀胱癌以及肺癌等多种恶性肿瘤的发生.研究CCDC蛋白在恶性肿瘤细胞中的分子机制,可以为恶性肿瘤的诊断和靶向治疗提供理论依据.
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编辑人员丨2023/8/5