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圈养条件下新疆马鹿两个亚种的肠道菌群比较分析
编辑人员丨2023/12/30
肠道菌群组成复杂,与宿主肠道内环境动态平衡和健康息息相关.马鹿是鹿科动物中分布最广的种类,亚种分化众多,但现有马鹿肠道菌群研究较少.为丰富马鹿肠道菌群数据,以马鹿的两个亚种为阶元,运用高通量16S rRNA基因测序技术检测了7 头雄性天山马鹿和 7 头雄性塔里木马鹿的肠道微生物,对其核心菌群、结构组成、多样性及肠道微生物的差异进行分析,旨在了解不同马鹿亚种肠道微生物组成差异,为两亚种间肠道菌群的差异提供参考.研究结果表明,塔里木马鹿菌群多样性及丰度低于天山马鹿.厚壁菌门(Fir-micutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)及拟杆菌门(Bacteroidetes)为两组马鹿的优势菌门.此外,天山马鹿肠道中分解蛋白质、脂质的拟杆菌门和变形菌门相对丰度高于塔里木马鹿,而分解植物纤维的双歧杆菌(Bifidobacterium)、瘤胃球菌科UCG 014(Ruminococcaceae UCG 014)的相对丰度低于塔里木马鹿.本研究对天山马鹿及塔里木马鹿肠道菌群组成进行初步了解,可根据研究结果调整其饲料配比,为马鹿饲养管理的改善提供参考.
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编辑人员丨2023/12/30
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新疆不同产区塔里木马鹿鹿茸对比研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 检测新疆5个不同产地塔里木亚种马鹿鹿茸质量性状、多肽(42,26,15 kDa)含量及其对小鼠前成骨细胞增殖和活性的影响.方法 对比分析不同产地鹿茸性状(直径、干鲜比、茸长、眉枝、水分、总灰分和浸出物);采用BCA蛋白定量试剂盒测定鹿茸多肽中的蛋白含量并作聚类分析,采用SDS-PAGE电泳法鉴别鹿茸多肽类型;建立小鼠成骨细胞模型,采用MTT及ELISA法分析其对细胞增殖和功能的作用.结果 不同产地塔里木鹿茸药材中鹿茸质量性状存在差异,塔里木河沙雅县鹿茸质量性状较好,鹿茸多肽含量高,显著提高了小鼠成骨细胞增殖率40.74%及碱性磷酸酶活性.结论 新疆沙雅地区塔里木亚种马鹿鹿茸活性较好.本实验为建立塔里木马鹿亚种鹿茸质量标准的提升提供了数据支撑.
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编辑人员丨2023/8/6
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塔里木马鹿维生素D受体(VDR)基因结构和功能的预测与分析
编辑人员丨2023/8/5
为了分析塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)维生素D受体(VDR)基因的结构和相关功能,本研究从前期研究获得的塔里木马鹿和天山马鹿(C.e.songaricus)皮肤组织转录组测序结果中,获得上调表达的塔里木马鹿VDR基因的序列,对塔里木马鹿VDR基因进行实时荧光定量PCR (qPCR)验证,利用相关软件进行同源性比对、系统进化树构建和生物信息学分析.实时荧光定量PCR结果显示,VDR基因在转录组测序的结果与qPCR的结果中表达趋势一致,均为上调.基于VDR基因同源性比对结果显示,塔里木马鹿与白尾鹿(Odocoileus virginianus,GenBank登录号XM 020889235.1)的遗传距离较近,同源性最高;与褐家鼠(Rattus norvegicus,GenBank登录号NM 017058.1)的遗传距离较远,同源性最低.系统进化树也证实了这个结果.生物信息学分析结果表明,塔里木马鹿VDR蛋白由20种氨基酸组成,分子质量为32.92ku,理论等电点为5.73,不稳定系数为33.56,总平均亲水性为-0.298,脂溶系数94.95,无跨膜区,无信号肽,无O-糖基化位点,有1个N-糖基化位点,有15个磷酸化位点,最有可能位于内质网膜中,二级结构和三级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个低复杂度区域,无保守结构区域.
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编辑人员丨2023/8/5
