-
维生素D受体基因多态性影响儿童流感临床结局的研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨维生素D受体(VDR)基因单核苷酸多态性(SNP)与儿童流感易感性和病情严重程度的相关性。方法:收集2019年2月至2021年2月西安市儿童医院及西安市中心医院收治的甲型流感患儿172例(研究组)和健康儿童88例(健康对照组)的外周静脉血,采用25-羟基维生素D(25-OH-D)试剂盒检测血清25-OH-D水平。根据临床表现将研究组分为轻症组、重症组和危重症组。选取VDR基因的4个候选位点ApaI、TaqI、FokI和BsmI,应用PCR-限制性片段长度多态性技术检测各组VDR基因的多态性并分析其与流感患儿临床结局之间的相关性。结果:与健康对照组[(109.65±4.35)nmol/L]相比,研究组血清25-OH-D水平较低[轻症组(73.55±2.46)nmol/L,重症组(45.59±4.62)nmol/L,危重症组(33.65±3.87)nmol/L, P<0.05];研究组ApaI位点基因型AA、Aa及等位基因A(分别为51.74%、22.67%和63.08%)和FokI位点基因型FF、Ff及等位基因F(分别为41.86%、34.88%和59.30%)占比均显著高于健康对照组(依次分别为11.36%、14.77%、18.75%、10.23%、13.64%和17.05%)( P<0.05)。重症组ApaI位点等位基因A和基因型AA、Aa(分别为63.70%、43.84%和28.76%)的占比显著高于轻症组(分别为47.37%、35.09%和24.56%)( P<0.05);危重症组ApaI位点等位基因A和基因型AA、Aa(分别为92.86%、88.10%和49.52%)占比显著高于重症组( P<0.05)。血清25-OH-D<50 nmol/L( OR=5.087,95% CI 3.114-5.648)、ApaI位点基因型AA( OR=4.011,95% CI 1.217-18.624)和Aa( OR=3.839,95% CI 2.483-1.456)、 FokI位点基因型FF( OR=4.112,95% CI 3.215-20.775)和Ff( OR=4.591,95% CI 0.032-10.936)是儿童流感发病的危险因素。 结论:血清25-OH-D缺乏与儿童流感的发生有关,VDR基因ApaI位点基因型AA、Aa和FokI位点基因型FF、Ff可增加儿童流感易感风险,ApaI位点等位基因A及基因型AA、Aa与流感的病情严重性有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
VDR基因新发突变致维生素D依赖性佝偻病Ⅱ型并文献复习
编辑人员丨1周前
目的:探讨维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因突变致维生素D依赖性佝偻病Ⅱ型患儿的临床表现、治疗方法及基因突变特点。方法:回顾分析一例维生素D依赖性佝偻病Ⅱ型患儿的临床表现及诊疗经过,提取患儿及父母外周血DNA进行VDR基因分析;并复习相关文献总结该病患儿的临床及基因突变特点。结果:患儿,女,1岁8月龄,因"脱发、双下肢弯曲"就诊,生化检查提示低血钙、低血磷,碱性磷酸酶和甲状旁腺激素升高,骨骼X线提示佝偻病活动期表现。VDR基因分析发现2号内含子存在c.146+1G>C纯合新发剪接突变,父母为该突变的携带者,进一步通过RT-PCR证实该突变在VDR基因转录为RNA时导致2号内含子融合到2号和3号外显子之间。给予大剂量钙剂口服治疗27个月,其临床症状、生化指标、骨骼X线明显改善,但毛发无法再生。目前文献共报道126例该病患儿,临床均有佝偻病表现,其中102例有脱发,大剂量钙剂口服治疗有效30例;共检出71种基因突变,其中错义突变48种、无义突变10种、剪接突变5种、缺失突变5种、插入突变2种和重复突变1种。结论:维生素D依赖性佝偻病Ⅱ型的确诊依赖临床表现、生化检查及VDR基因分析,治疗上可尝试口服大剂量钙剂。VDR基因c.146+1G>C剪接突变为新发致病突变。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
维生素D受体基因多态性与妊娠期糖尿病关系的病例对照研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨维生素D受体( VDR)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)之间的关系,为GDM的机制研究提供线索与依据。 方法:采用病例对照研究设计,以2012年3月1日至2014年7月30日在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇为研究对象,其中334例被诊断为GDM,按年龄、妊娠时间及居住地1∶1匹配相应健康对照。对研究对象进行DNA基因分型,剔除基因分型缺失率>10%者,最终323例病例和320例对照纳入研究。在共显性、显性、隐性和等位基因遗传模型下,通过非条件logistic回归分析 VDR基因位点多态性和GDM之间的关系,并采用Haploview软件分析单倍型与GDM之间的关系。 结果:在基因水平上, VDR基因与GDM发病风险有关( P<0.05)。在调整孕前BMI、糖尿病家族史后,rs7967152位点在共显性(AC vs. AA, OR=1.58,95% CI:1.13~2.21)、显性(AC+CC vs. AA, OR=1.58,95% CI:1.15~2.18)和等位基因(C vs. A, OR=1.41,95% CI:1.10~1.82)遗传模型下与GDM风险升高有关;rs2238140位点在共显性(AA vs. GG, OR=2.24,95% CI:1.19~4.20)、显性(GA+AA vs. GG, OR=1.48,95% CI:1.07~2.03)和等位基因(A vs. G, OR=1.43,95% CI:1.11~1.83)遗传模型下与GDM风险升高有关。在共显性和显性遗传模型下,孕妇携带rs2853564位点AG基因型、AG+GG基因型( OR=1.46,95% CI:1.04~2.05; OR=1.45,95% CI:1.05~2.00)与携带AA基因型相比,是GDM的危险因素;孕妇携带rs2853566位点AG基因型、AG+GG基因型( OR=1.43,95% CI:1.03~2.00; OR=1.41,95% CI:1.02~1.94)与携带AA基因型相比,是GDM的危险因素。在 VDR基因内由rs1544410、rs7967152组成的单倍型区块,其GC单倍型与是GDM的危险因素( OR=1.50,95% CI:1.15~1.97)。 结论:VDR基因rs7967152、rs2238140、rs2853564、rs2853566位点多态性和区块(rs1544410、rs7967152)GC单倍型与GDM的发病风险升高有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
醛固酮腺瘤的关键基因及其生物学功能的生物信息学分析
编辑人员丨1周前
目的:通过生物信息学分析探讨醛固酮腺瘤的关键基因及其相关的生物学功能。方法:从GEO数据库2个训练数据集GSE60042和GSE64957鉴定出醛固酮腺瘤差异表达基因,并进行功能、通路富集和转录调控网络分析;使用差异表达基因构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,通过节点分析从网络中提取枢纽(Hub)基因作为候选关键基因;以测试数据集GSE8514验证关键基因的表达水平;以受试者工作特征(ROC)曲线分析验证关键基因对醛固酮腺瘤的诊断效能;使用基因集富集分析(GSEA)确定各关键基因的生物学功能。结果:从2个数据集获得醛固酮腺瘤中68个差异基因,包括33个上调基因和35个下调基因,这些基因功能体现在醛固酮生物合成过程、细胞内钙信号通路、5-羟色胺受体信号通路、转录激活因子活性和转录调控等方面;转录因子-基因调控网络中JUN和VDR基因处于中心位置。从PPI网络确定了9个Hub基因,在测试数据集,CYP11B2、VDR基因在醛固酮腺瘤中的表达升高,而JUN、NFKBIZ、EGR3、KLF6基因在醛固酮腺瘤中的表达降低(均 P<0.05),这些基因的ROC曲线下面积分别为0.936、0.833、0.953、0.854、0.868和0.929。GSEA显示,这些关键基因的变化引起类固醇合成、细胞黏附、免疫细胞信号通路和补体凝集反应通路上调[标准化的富集分数(NES)>1.5, P<0.05],引起DNA复制、核糖体和自噬调节通路下调(均NES<-1.5, P<0.05)。 结论:生物信息学分析结果提示,JUN和VDR基因为醛固酮腺瘤的关键转录因子,CYP11B2、NFKBIZ、EGR3和KLF6为关键基因,其在醛固酮腺瘤发生中涉及类固醇合成、细胞黏附、免疫细胞信号转导等生物学功能。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
维生素D受体基因多态性与抽动秽语综合征的关联研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因多态性与抽动秽语综合征(Tourette syndrome,TS)之间的关系。方法:对417例TS患者和442例健康人群的VDR中的三个多态性位点FokI(rs2228570)、BsmI (rs1544410)和Cdx2 (rs11568820)通过TaqMan等位基因实时鉴别技术进行基因分型,并进行病例对照分析。此外,对417例TS患者进行家系研究。使用IBM SPSS 23.0软件进行 χ2检验和相对风险分析。 结果:FokI(rs2228570)具有三种基因型(CC=109,CT=235,TT=73),BsmI(rs1544410)具有三种基因型(AA=2,AG=45,GG=370),Cdx2 (rs11568820)具有三种基因型(AA=71,AG=200,GG=146),TS患者的FokI、BsmI和Cdx2的基因型( χ2=5.516, P=0.063; χ2=3.466, P=0.177; χ2=0.561, P=0.755)或等位基因频率( χ2=0.840, P=0.359; χ2=3.376, P=0.066; χ2=0.051, P=0.822)与对照组比较,均差异无统计学意义。在家系研究中进行传递不平衡检验分析(transmission disequilibrium test,TDT),这三个多态性位点在417个TS家系中没有发现显著的过度传播(FokI: χ2=0.009, P=0.962;BsmI: χ2=1.220, P=0.320;Cdx2: χ2=0.260, P=0.646)。FokI、BsmI和Cdx2的单倍型相对风险(haplotype relative risk,HRR)分析与基于单倍型的单倍型相对风险(haplotype-based haplotype relative risk,HHRR)分析的等位基因频率分布和相对风险均差异无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:VDR受体基因多态性对中国汉族人群TS易感性没有影响。然而,VDR的潜在作用还需要在更丰富的多态性、不同的种族群体和更大的样本中探索。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
基于靶基因捕获测序法对海南省汉族寻常型银屑病与维生素D受体基因关系的研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨维生素D受体(VDR)基因多态性与寻常型银屑病的关系。方法:2018年3月至2020年2月在海南医学院第二附属医院皮肤性病科和体检中心分别收集101例海南籍汉族寻常型银屑病患者与79例海南籍健康对照。采用靶基因捕获测序法对VDR基因及其上、下游各2 kb进行全长测序,对于最小等位基因频率大于1%的单核苷酸多态性(SNP)进行基于SNP和单倍型的关联分析。采用生物信息学方法预测风险位点对基因功能的影响。结果:基于SNP的关联分析显示,40个SNP(29个位于内含子区、1个位于外显子区及10个位于基因间区)为银屑病的易感位点,其 OR值为0.148(95% CI:0.016~1.294)~2.779(95% CI:1.260~6.130), P < 0.001~0.976。生物信息学预测显示位于外显子2上的rs2228570可引起氨基酸改变(蛋氨酸→苏氨酸),继而导致基因功能改变。基于单倍型的关联分析显示,10个单倍型为寻常型银屑病的保护性单倍型,在健康对照组和银屑病患者组中的频率分别为5.150%~45.570%、1.110%~33.170%,其 OR值为0.198(95% CI:0.040~0.985)~0.630(95% CI:0.419~0.947), P值0.002~0.048。 结论:在海南籍汉族人群中,发现40个寻常型银屑病相关的风险SNP,分别位于内含子区、外显子区及基因间区域,同时发现10个保护性单倍型。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
沉默维生素D受体的表达对大鼠气道平滑肌细胞增殖及核因子-κB活化的影响
编辑人员丨1周前
目的:研究沉默维生素D受体(VDR)基因表达对气道平滑肌细胞(ASMC)增殖能力的影响,并初步探讨核因子-κB(NF-κB)在其中的作用。方法:构建特异性靶向大鼠VDR基因的RNA干扰慢病毒载体。实验分组为空白组、空载体组和干扰组。嘌呤霉素抗性筛选后建立VDR基因稳定沉默的大鼠ASMC细胞株。四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测细胞增殖;流式细胞仪检测细胞生长周期;免疫荧光双标染色法检测 NF-κB p65的核易位情况;双荧光素酶报告基因法检测NF-κB依赖的转录活性,Western blotting法检测IκBα及p-IκBα蛋白的表达水平;放线菌素D处理细胞,检测IκBα mRNA的稳定性。利用SPSS 23.0统计软件,采用多组间单因素方差(One-Way ANOVA)分析; 组间两两比较采用SNK检验。结果:(1)与空白组与空载体组相比,干扰组ASMC的 A492 nm值及G 2/M期细胞比例显著高( P<0. 05),而G 0/1细胞比例明显低( P<0.05)。(2)干扰组ASMC中NF-κB亚单位p65发生明显核易位;其NF-κB报告基因的相对表达量(1.37±0.28)较空白组(1.00±0.19, P=0.031)及空载体组(0.96±0.18, P=0.027)明显高。(3)干扰组中IκBα的蛋白表达量(0.13±0.04)显著低于空白组(0.29±0.05, P=0.023)及空载体组(0.32±0.07, P=0.014)。相反,干扰组p-IκBα/IκBα为(0.86±0.04),显著高于空白组(0.41±0.07, P=0.026)及空载体组(0.37±0.05, P= 0.017)。(4)干扰组ASMC的IκBα mRNA半衰期(171.31±9.67) min,较空白组[(224.69±7.95) min, P=0.032]及空载体组[(230.41±6.37) min, P=0.035]明显短。 结论:沉默VDR的表达能促进ASMC的细胞增殖,这一作用与其活化ASMC中的NF-κB信号通路有关。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
VitD通过影响VDR/Sirt-1相互作用拮抗低氧诱导的肺动脉内皮细胞凋亡
编辑人员丨1周前
目的:探讨肺动脉高压患者维生素D/维生素D受体(VitD/VDR)表达情况及VitD对于低氧诱导的肺动脉内皮细胞(HPAECs)凋亡的作用。方法:本研究为病例对照研究,采用非随机抽样的方法选取2016年1月至2020年12月西安交通大学第一附属医院结缔组织病合并肺动脉高压(CTD-PH)患者164例,收集患者血清,化学发光法检测患者血清25(OH)D水平;随机抽取20例CTD-PH患者提取外周血单个核细胞(PBMC),Real time PCR检测VDR mRNA表达。体外培养HPAECs,分为常氧组、常氧+VitD组、低氧组、低氧+VitD组,流式细胞仪检测细胞凋亡,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测VDR、Sirt-1胞浆及胞核蛋白的表达。结果:164例CTD-PH组患者25(OH)D浓度为(33.473±10.428) nmol/L,较国际标准50 nmol/L低,提示CTD-PH患者存在VitD缺乏。20例CTD-PH患者PBMCs VDR mRNA表达量为(1.635±0.508),高于健康对照组PBMCs VDR mRNA水平(1.019±0.198),差异有统计学意义( t=3.20, P<0.001)。体外细胞培养结果显示:低氧组细胞凋亡率高于常氧组(10.127±0.179)%比(3.503±0.181)%;常氧+VitD组凋亡率(1.280±0.181)%低于常氧组;低氧+VitD组凋亡率(5.993±0.181)%低于低氧组。检测VDR、Sirt-1蛋白表达结果显示:低氧组VDR、Sirt-1胞核蛋白较常氧组增加( P<0.05);低氧+VitD组与低氧组相比VDR胞浆蛋白、胞核蛋白均增加( P<0.05),Sirt-1胞浆蛋白、胞核蛋白均增加( P<0.05)。 结论:CTD-PH患者存在VitD缺乏,但VDR基因表达适应性增加,VitD可通过调控VDR/Sirt-1的表达,缓解低氧诱导的HPAECs凋亡,发挥保护作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
女性血清维生素D水平与早期自然流产的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨女性血清维生素D水平与早期自然流产的关系,并探索维生素D的作用机制。方法:本研究采用病例对照研究,选择2018年3月至2019年12月期间在桐庐县第一人民医院就诊的52例自然流产女性为研究组,因非意愿妊娠要求终止早期妊娠的患者50例作为对照组,育龄期非妊娠状态的女性体检者40例作为正常组,比较三组患者血清中维生素D 3、钙离子及甲状旁腺激素(PTH)的浓度,收集研究组和对照组人工流产后的绒毛组织及蜕膜组织,采用RT-PCR检测维生素D受体(VDR)及1a-羟酶( CYP27B1基因编码)的mRNA表达量,以免疫组织化学法定位并检测两者的蛋白相对表达量。 结果:研究组血清中维生素D 3浓度[12.4(10.1,17.2) μg/L]均低于对照组[16.7(13.5,21.9) μg/L , P<0.000 1]和正常组[18.9(15.6,26.4) μg/L, P=0.005 6],而血清中钙离子和PTH浓度组间差异均无统计学意义( P>0.05)。在蜕膜组织中,研究组的 VDR mRNA[0.871 3(0.668 6,1.085 7)]及蛋白表达量[3.0(2.5,4.0)]较对照组的 mRNA[1.102 7(0.897 7,1.357 1)]及蛋白表达量[4.5(3.5,5.5)]降低,且差异有统计学意义( P=0.000 3; P<0.000 1),而 CYP27B1 mRNA及蛋白表达量与对照组相比有下降趋势,但差异无统计学意义( P>0.05)。在绒毛组织中,研究组和对照组相比,无论是 VDR还是 CYP27B1的mRNA及蛋白表达量差异均无统计学意义( P>0.05)。 结论:女性早期自然流产可能与低血清维生素D水平有关,低浓度维生素D主要通过下调蜕膜组织中的VDR表达导致早期自然流产的发生。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
维生素D受体在肺腺癌高表达及其对肺腺癌细胞活力和转移能力影响的研究
编辑人员丨2周前
目的:探究维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)在肺腺癌中的表达及其对肺腺癌细胞生物学功能的影响.方法:本研究通过6个肺腺癌数据集(共792例肺腺癌组织和230例相邻非肿瘤组织)分析了VDR的mRNA在肺腺癌中的表达水平及其与预后的关系,免疫组化检测30例肺腺癌患者肿瘤组织和癌旁组织中VDR蛋白表达.以肺腺癌细胞A549和H1650为研究对象,分别转染阴性对照和两条VDR短发夹RNA(shRNA).CCK-8实验比较各实验分组的细胞活力,Transwell实验和划痕实验比较各实验分组细胞的侵袭及迁移能力.基因集富分析肺腺癌VDR高表达的组织富集的相关信号通路.结果:VDR的mRNA在肺腺癌组织中的表达显著增加(P<0.01).免疫组化实验进一步证实了VDR在肺腺癌中显著高表达(P<0.01).生存分析结果显示VDR的表达对肺腺癌患者的整体生存率没有显著影响(P>0.05).敲减VDR可以显著抑制肺腺癌的细胞活力、侵袭及迁移能力(P<0.05).基因集富集分析结果显示VDR高表达的肺腺癌组织显著富集在上皮-间充质转化等信号通路(P<0.05).结论:VDR在肺腺癌中高表达,敲减VDR可以抑制肺腺癌细胞活力、侵袭及迁移能力.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2周前
