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基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析
编辑人员丨2023/8/6
在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析.结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157 ～0.190,富含亮氨酸和丝氨酸.亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5～9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成.其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽.这23条MLO蛋白具有15个长度在15～ 50个氨基酸间的保守基序.它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性.将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征.最后,通过qRT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势.上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程.
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编辑人员丨2023/8/6
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七里香蔷薇叶绿体基因组测序及结构分析
编辑人员丨2023/8/6
七里香蔷薇是蔷薇属木香花的一个变种,在秦岭山区广泛分布,具有重要的观赏价值,同时也是蔷薇属花卉育种的重要种质资源.本研究首次以秦巴山区七里香蔷薇为实验材料,采用Illumina HiSeq 4000测序系统对其叶绿体基因组DNA建库测序,建库类型为350 bp DNA小片段文库,测序深度为59×.分析其基因组结构,并且与已报道蔷薇科植物叶绿体基因组进行比较.七里香蔷薇叶绿体基因组序列全长156 544 bp,具有典型被子植物叶绿体基因组环状四分体结构.叶绿体基因组包括大单拷贝区85 678 bp、小单拷贝区18 782 bp和2个反向重复序列26042bp.GC含量为37.22％;检测到116个串联重复序列43个散在重复序列;此外,还检测到72个简单重复序列位点.对其功能基因比对分析,该植物的叶绿体基因组共注释得到129个基因,包括86蛋白编码基因、35个tRNA基因和8个rRNA基因.用MEGA6.0软件通过邻近法基于叶绿体全基因组序列对所有已知叶绿体基因组的蔷薇科22个物种进行聚类分析,其与七里香蔷薇和大花香水月季、缫丝花聚在一起.研究结果对于七里香蔷薇野生植物资源的育种及引种驯化具有参考依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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梁王山大花香水月季居群表型多样性分析
编辑人员丨2023/8/5
以云南省澄江市梁王山一带3个大花香水月季居群240个个体为研究对象,采用巢式方差分析、表型变异系数分析、Pearson相关性分析等方法,对大花香水月季的花、叶等16个表型性状进行分析.结果表明:大花香水月季居群内和居群间均存在丰富的表型多样性,表型分化系数在-1.51％～26.18％之间,在较近的距离内,居群内多样性远高于居群间多样性.表型性状在居群内的平均变异系数为13.62％,离散程度相对较低,其中,变异系数最大的是花梗长,最小的是花瓣长宽比.相关性分析发现,大多数花部性状间、叶部性状间相关性较强,但花部性状与叶部性状之间相关性较低甚至不相关.
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编辑人员丨2023/8/5
