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体外循环变温水箱非结核分枝杆菌培养及鉴定研究
编辑人员丨2024/7/20
目的 本研究旨在了解本中心体外循环变温水箱是否有非结核分枝杆菌(NTM)污染.方法 在含氯消毒剂消毒水箱后次日,留取本中心1号楼19个水箱的水样,进行NTM培养.对于水样分枝杆菌培养阳性的水箱,用无菌拭子分别涂抹水箱内胆生物膜和水箱出风口处,做NTM培养和鉴定,采用rpoβ基因和 16S rRNA基因片段聚合酶链反应扩增测序,将测序结果进行基本局部比对搜索工具(BLAST)比对以确定菌种.结果 4个水箱的水样检测NTM阳性,2 个水箱在内胆和出风口都检测到奇美拉分枝杆菌,1 个水箱仅在内胆区检测到奇美拉分枝杆菌,1 个水箱在内胆区和出风口分别检测到戈登分支杆菌和奇美拉分枝杆菌.结论 本中心体外循环变温水箱存在NTM污染,以奇美拉分枝杆菌为主.应通过加强变温水箱NTM监测、使用过滤水、定期清除生物膜、定期消毒、合理摆放水箱等方法降低NTM污染和感染风险.
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编辑人员丨2024/7/20
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基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法对MGIT960阳性管中微生物的菌种鉴定
编辑人员丨2023/12/16
目的 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)法对BACTEC? MGIT960(简称"MGIT960")仪器报告阳性的培养管中的微生物进行菌种鉴定,并分析不同菌株的分布情况.方法 收集2021-2022年天津市结核病控制中心参比实验室MGIT960仪器报告的阳性管2 662管,将液体培养物分别转种至血平板和中性罗氏培养基,对获得的分离株应用MALDI-TOF MS法进行鉴定,根据质谱结果将同一患者在同一种培养基上不重复的结果全部纳入菌种分布情况的构成比分析.对于质谱未检出的菌株,选取38株进行16SrRNA基因测序.结果 血平板共获得分离株605株,将501株纳入分析,其中分枝杆菌属占17.76%(89/501),以脓肿拟分枝杆菌10.18%(51/501)和偶发分枝菌酸杆形菌3.19%(16/501)为主,分枝杆菌以外的细菌占68.06%(341/501),以皮疽诺卡菌15.57%(78/501)、痰液戈登氏菌9.38%(47/501)和支气管戈登氏菌7.58%(38/501)为主,71株未检出,占14.17%(71/501);中性罗氏培养基获得分离株2 378株,纳入1 748株进行分析,其中分枝杆菌属占 78.72%(1 376/1 748),以结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)60.53%(1 058/1 748)、奇美拉胞内分枝杆菌组4.69%(82/1 748)、慢生黄分枝杆菌3.55%(62/1 748)为主,分枝杆菌以外的细菌占17.11%(299/1 748),以皮疽诺卡菌4.35%(76/1 748)、痰液戈登氏菌2.69%(47/1 748)和支气管戈登氏菌2.12%(37/1 748)为主,73株未检出,占4.18%(73/1 748).38株质谱未检出的细菌经测序发现均为放线菌门和厚壁菌门的菌株.结论 MGIT960仪器报告阳性的培养管中非结核分枝杆菌(nontuberculous Mycobacterium,NTM)和分枝杆菌以外的细菌种类繁多,且绝大多数均可通过质谱快速鉴别.分枝杆菌以外的细菌以诺卡菌属和戈登氏菌属为主,应在鉴别诊断中关注此类细菌感染.
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编辑人员丨2023/12/16
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胞内分枝杆菌临床分离株亚种组成及体外耐药性分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析深圳地区胞内分枝杆菌临床分离株的亚种组成及其耐药谱,为治疗胞内分枝杆菌肺病提供科学依据.方法 选取中国疾病预防控制中心国家结核病参比实验室保存且初步鉴定为胞内分枝杆菌的临床分离株,共计97株.菌株均分离自深圳市第三人民医院2018年收集的疑似肺结核和非结核分枝杆菌(NTM)肺病患者的呼吸道标本.采用PCR及基因测序鉴定胞内分枝杆菌临床分离株亚种,使用Sensititre? SLOWMYCO药敏板测定菌株对13种药品(克拉霉素、阿米卡星、莫西沙星、利奈唑胺、利福平、利福布汀、乙胺丁醇、链霉素、多西环素、环丙沙星、异烟肼、乙硫异烟胺及复方磺胺甲噁唑)的药物敏感性情况.结果 97株胞内分枝杆菌临床分离株以亚种胞内分枝杆菌最多[63.92% (62/97)],其次为奇美拉分枝杆菌[18.56% (18/97)]和副胞内分枝杆菌[17.53%(17/97)].药物敏感性试验显示,胞内分枝杆菌的MIC50和MIC90值最低的是利福布汀(0.5和8 μg/ml),最高的是链霉素(32和64 μg/ml);亚种胞内分枝杆菌和副胞内分枝杆菌的MIC90均为2 μg/ml,而奇美拉分枝杆菌则高达64 μg/ml.胞内分枝杆菌临床分离株对克拉霉素、乙胺丁醇、利福平、利福布汀、链霉素、阿米卡星、利奈唑胺和莫西沙星总的耐药率分别为9.28% (9/97)、44.33%(43/97)、42.27% (41/97)、15.46% (15/97)、36.08%(35/97)、11.34%(11/97)、38.14% (37/97)和46.39% (45/97);奇美拉分枝杆菌对克拉霉素的耐药率[27.78%(5/18)]明显高于亚种胞内分枝杆菌[4.84%(3/62)],差异有统计学意义(x2=8.156,P=0.012).结论 深圳地区胞内分枝杆菌以亚种胞内分枝杆菌为主,对各药品的敏感性有差异,且各亚种对同一药品的敏感性也不同,建议临床治疗前应鉴定至亚种并行药物敏感性试验,以实现个性化治疗.
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编辑人员丨2023/8/5
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非结核分枝杆菌肺病临床特征及其菌种鉴定
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析非结核分枝杆菌肺病(NTMPD)临床特征,通过宏基因组测序进行非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定及聚类分析.方法 收集2015年1月-2020年12月福建省立医院确诊NTMPD患者共计79例,收集相关临床资料,利用宏基因组二代测序(mNGS)技术对29株NTM临床分离株进行全基因组测序,分析平均核苷酸一致性(ANI)进行菌种鉴定,绘制NTM临床分离株的ANI值聚类热图.结果 NTMPD确诊病例数呈逐年上升趋势,79例NTMPD患者中,男性40例、女性39例,平均年龄为(60.78±12.04)岁,约55.70%(44/79)存在支气管扩张.NTMPD患者主要表现为咳嗽(86.08%)、咳痰(75.95%),CT影像特征以支气管扩张(55.70%,44/79)、树芽征(43.04%,34/79)及结节(35.44%,28/79)表现多见,NTM培养阳性标本中肺泡灌洗液占比最高,达60.76%(48/79).29株NTM临床分离株共鉴定出10种NTM菌种,其中鸟分枝杆菌复合群(MAC)占58.62%,其次为脓肿分枝杆菌占24.14%.MAC中的胞内分枝杆菌、副胞内分枝杆菌、奇美拉分枝杆菌具有较近的亲缘关系,快生长的脓肿分枝杆菌与慢生长NTM菌株亲缘关系均较远.结论 NTMPD患者缺乏典型的临床症状,CT影像上表现为支气管扩张伴结节和树芽征者,应警惕NTM感染可能.NTM菌株的基因型与表型之间可能存在一定相关性.
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编辑人员丨2023/8/5
