目的:BATMAN-TCM分析工T具及R语言分析荣筋拈痛方对骨关节炎(OA)的作用及靶点并进行动物实验验证.方法:BATMAN-TCM分析工具预测荣筋拈痛方潜在作用靶点、发挥作用的方式途径及可能作用的疾病.R语言分析出OA模型大鼠与正常大鼠膝关节软骨组织的差异基因.韦恩图分析荣筋拈痛方潜在作用靶点与软骨组织差异基因的交集,选择靶点分子进行动物实验验证.将2月龄大鼠随机分为空白组、模型组、荣筋拈痛方组,空白组和模型组予0.9％氯化钠溶液灌胃,荣筋拈痛方组予荣筋拈痛方水提溶液灌胃.各组干预12周后,对关节软骨组织进行HE染色观察及Western Blot检测.结果:荣筋拈痛方具有632个化学成分,其中440个化学成分预测到1 787个潜在作用靶点,其通过多途径发挥作用,能治疗疼痛性疾病、心血管疾病、肾脏疾病、免疫性疾病、关节炎性疾病等多种疾病.OA大鼠软骨组织中差异表达的基因共226条.荣筋拈痛方潜在作用靶点与软骨组织差异基因相同的指标有34个,其中选择CXCR4进行验证.动物实验中HE染色及Western Blot检测显示,模型组软骨组织损伤且CXCR4蛋白表达升高(P＜0.05),荣筋拈痛方组软骨组织损伤减轻且CXCR4蛋白表达降低(P＜0.01).结论:荣筋拈痛方能延缓OA软骨组织退变,作用机制与调节CXCR4表达有关.

目的 基于异病同治理论探究经典名方真武汤治疗心肾交集性疾病的网络药理学分子机制.方法 综合利用中药整合药理学计算平台(TCM-IP)的中药材数据库、中药成分数据库和疾病靶标数据库的数据信息和分析功能,对真武汤治疗慢性心衰和糖尿病肾病的作用靶标、信号通路进行预测,分析二者的作用靶点、信号通路之间的关联性,探究该方“异病同治”治疗心肾交集性疾病的分子机制.结果 对真武汤预测共得到280个活性成分,包括生物碱、皂苷、内酯、有机酸等成分;筛选出治疗慢性心衰115个核心靶标,治疗糖尿病肾病175个核心靶标,其中共同靶标包括谷氨酸脱羧酶2(GAD2)、葡萄糖激酶(GCK)、谷氨酰-脯氨酰-tRNA合成酶(EPRS)、细胞色素C氧化酶5A抗体(COXSA)、AMPA离子能谷氨酸受体2(GRIA2)等;涉及谷氨酸能突触、神经系统、精氨酸和脯氨酸代谢、苯丙胺成瘾以及血管内皮生长因子信号通路、酪氨酸激酶受体信号通路、促性腺激素释放激素信号通路等相关生物过程和信号通路.结论 推测真武汤通过调节中枢神经“下丘脑-垂体”系统、内分泌和血液循环系统维持全身体液平衡,保持内环境稳定,并介导能量代谢和炎症反应过程达到治疗心肾交集性疾病目的,为进一步深入研究其作用机理提供了科学依据.

目的 通过网络药理学的方法对中药沙棘和藏药麻花秦艽配伍防治缺氧的主要活性成分和作用机制进行预测和分析,为临床用药和开发新药提供依据.方法 通过中国知网、万方等数据库、中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)和Swiss Target Prediction平台,收集沙棘和麻花秦艽的活性化合物并对其靶点进行预测,应用人类基因数据库(GeneCard)收集缺氧的相关靶点;用Cytoscape软件来构建沙棘,麻花秦艽活性成分和对应的靶点的成分-靶点网络图;利用STRING数据库构建药物疾病交集靶点的PPI网络,并筛选出关键靶点和中心靶点;利用David数据库进行Go分析和KEGG信号通路富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接,利用Pymol软件进行相应的制图.结果 共筛选出沙棘和麻花秦艽活性成分35个(如熊果酸、山奈酚、木犀草素等),与高原缺氧相关的靶点162个,其中关键靶点28个(如PIK3R1,MAPK3,IL-2和MAPK等).GO功能分析确定了107个条目(P<0.05),涉及凋亡的正负调控作用和氧化应激反应等.KEGG通路分析发现相关的信号通路39条(如Rap1信号通路、ErbB信号通路、肾素-血管紧张素系统等),分子对接结果显示,多数活性成分与关键靶点具有结合作用.结论 本研究初步证明了麻花秦艽和沙棘配伍对缺氧性疾病的预防和治疗有着多靶点多通路的特点.

目的:通过生物信息学方法筛选胃相关性疾病伴肠上皮化生(IM)的关键基因与通路,探讨其发病机制及潜在治疗靶点,进而预测治疗IM的中药.方法:从公共基因芯片数据库(GEO)数据库中下载包含IM患者的胃黏膜基因表达谱数据,利用Rstudio3.5.2筛选出IM组织与正常胃黏膜组织的差异表达基因(DEGs);使用DAVID 6.8数据库对DEGs进行GO和KEGG富集分析;基于STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白相互作用(PPI)网络,明确关键基因及核心功能模块;通过将关键基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medical)相对应,筛选治疗IM的中药.结果:纳入2个包含IM的基因芯片数据集GSE78523和GSE60427,将2个数据集中IM相关的DEGs取交集获得135个基因,其中上调基因90个、下调基因45个.GO分析结果显示,DEGs主要涉及消化、细胞增殖的调控、细胞间黏附、钠离子跨膜转运、钾离子转运、胆囊收缩素信号通路、单核细胞趋化性、白细胞迁移、细胞外泌体等功能.KEGG通路富集结果显示DEGs显著富集于胃酸分泌、氮代谢、肾素-血管紧张素系统、蛋白质的消化吸收、胰腺分泌5条信号通路.通过对PPI网络的结构分析发现9个关键基因:MUC5AC、DEFA5、MUC17、ALPI、SST、FOXA2、MUC13、GCNT3、OLFM4,筛选治疗IM的潜在中药有枳实、桔梗、党参、甘草、沙参、藿香、苍术、半夏、野菊花、车前草等.结论:DEGs和关键基因的分析促进了对IM发生机制的理解,为IM的中药治疗提供了潜在的基因靶标与研发思路.