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真核翻译起始因子4γ1通过哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路促进胰腺癌细胞增殖的机制
编辑人员丨1天前
目的:检测真核翻译起始因子4γ1(EIF4G1)在胰腺癌中的表达,并探究其促进胰腺癌细胞增殖的相关机制。方法:利用在线数据库分析EIF4G1在肿瘤中的表达量与预后意义;实时荧光定量聚合酶链式反应检测人胰腺癌细胞系的EIF4G1表达水平。慢病毒转染构建EIF4G1低表达细胞系,分别为敲减#1,敲减#2与对照;慢病毒转染构建EIF4G1过表达细胞系,为过表达与空载;细胞计数试剂盒(CCK-8)实验与克隆形成实验检测胰腺癌的增殖能力;蛋白印迹法检测EIF4G1敲减后哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号(mTOR)通路的变化,组间比较选择 t检验。 结果:多个数据库显示EIF4G1在胰腺癌中表达量升高,与胰腺癌的不良预后有关;低表达组PANC-1在第5天的吸光度显著低于对照组(0.85±0.03、0.92±0.05比1.35±0.04, t=22.160、14.670, P<0.01);低表达组PA-TU-8988T在第5天的吸光度显著低于对照组(1.00±0.05、0.99±0.04比1.99±0.07, t=26.740、29.390, P<0.01);低表达组PANC-1的克隆形成数目著低于对照组(91.00±7.55、107.00±7.00比147.70±21.83, t=4.250、3.070, P<0.05),低表达组PA-TU-8988T的克隆形成数目著低于对照组(137.00±16.09、147.30±13.50比222.70±18.50, t=6.050、5.700, P<0.01);过表达组MIA PaCa-2在第5天的吸光度显著高于对照组(1.55±0.14比1.21±0.10, t=4.360, P<0.01);过表达组BxPC-3在第5天的吸光度显著高于对照组(1.03±0.01比0.69±0.07, t=10.840, P<0.01);过表达组MIA PaCa-2的克隆形成数目显著高于对照组(127.30±14.57比81.33±10.26, t=4.470, P<0.05);过表达组BxPC-3的克隆形成数目显著高于对照组(105.70±13.58比47.00±7.55, t=6.540, P<0.01)。低表达组PANC-1细胞的p-mTOR含量低于对照组PANC-1细胞(1.00±0.12比0.55±0.19、0.54±0.19, t=3.480、3.450, P<0.05);低表达组PA-TU-8988T细胞的p-mTOR含量低于对照组PA-TU-8988T细胞(1.00±0.05比0.57±0.14、0.49±0.09, t=5.140、8.410, P<0.01)。 结论:EIF4G1在胰腺癌中上调,可能通过mTOR通路促进胰腺癌的增殖。
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编辑人员丨1天前
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miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤中的表达与靶基因验证
编辑人员丨2023/8/6
目的 探索miR-139-5p在多形性胶质母细胞瘤(GBM)患者中的表达水平,预测和验证miR-139-5p的靶基因.方法 利用实时定量PCR检测GBM患者和对照组脑组织中miR-139-5p的相对表达水平.选择starBase在线工具预测miR-139-5p的靶基因,通过TargetScan数据库分析miR-139-5p与靶基因的结合位点,并采用萤光素酶报告实验验证.检索miRPathDB数据库分析miR-139-5p靶基因显著富集的pathways,运用miRTargetLink工具构建miR-139-5p与其靶基因之间的交互网络.结果 相对于对照组,miR-139-5p在GBM患者脑组织中的表达水平显著下调.starBase预测工具取交集后得到8个靶基因,其中真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)为miR-139-5p靶基因之一.萤光素酶报告实验表明EIF4G2基因3′UTR区中含有明确的miR-139-5p结合位点.pathway富集分析发现靶基因显著富集于胰岛素样生长因子(IGF)-1信号通路、神经营养因子通路、趋化因子通路、T细胞受体通路、Ras信号通路和转化生长因子(TGF)-β信号通路等.结论 miR-139-5p在GBM患者中低表达,可能通过抑制靶基因EIF4G2表达参与肿瘤发生相关的过程.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-499a-5p在骨肉瘤中的表达及其对骨肉瘤发生发展的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨miR-499a-5p在骨肉瘤(OS)中的表达及其对OS发生发展的影响.方法:通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证miR-499a-5p在OS细胞系(143B、MNNG)及正常成骨细胞(hFOB1.19)中的差异表达,并使用3种在线预测工具对miR-499a-5p的靶基因进行了预测,并取3种数据共同交集得到的靶基因作为候选靶基因.利用靶基因进行基因功能分析(GO)富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,然后经过蛋白互作网络(PPI)分析,筛选节点最高的3个关键hub基因,并利用生存分析从这3个关键hub基因中筛选出具有预后意义的关键基因.结果:RT-qPCR结果显示,与正常的成骨细胞比较,OS细胞中miR-499a-5p表达降低(P<0.05).通过3种在线预测工具预测miR-499a-5p的靶基因并交集获得181个靶基因.GO分析结果表明,生物过程(BP)最显著富集的是RNA聚合酶Ⅱ促子转录的正向调控,细胞组成(CC)最显著富集的是细胞核,分子功能(MF)最显著富集的是蛋白结合.在KEGG的通路富集中,最显著的是人类T细胞白血病病毒1感染信号通路,其次是轴突引导通路、催产素信号通路和T细胞激活信号通路.靶基因的蛋白互作网络分析发现节点最高的3个关键hub基因分别是异质核糖核蛋白C(HNRNPC)、真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)和真核翻译起始因子4A同工型2(EIF4A2).生存分析结果显示,高度表达HNRNPC的OS患者的生存率显著降低(P<0.05).结论:miR-499a-5p可能通过调控HNRNPC基因对OS发展产生潜在的影响.
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编辑人员丨2023/8/5
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内质网应激与非折叠蛋白反应激活对骨骼肌纤维免疫行为的调控作用
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨干扰素-γ(IFN-γ)诱导的炎症环境中,骨骼肌纤维内质网应激(ERS)与非折叠蛋白反应(UPR)的激活对肌纤维免疫行为的调控作用.方法 体外培养的C57BL/6小鼠原代成肌干细胞,经马血清分化成多核肌管后分成以下10组:1.对照组;2.IFN-γ组;3.衣霉素(TM)组;4.毒胡萝卜素(TG)组;5.IFN-γ+4-苯基丁酸(4-PBA)联合处理组;6.IFN-γ+TG+4-PBA联合处理组;7.IFN-γ+4μ8c联合处理组;8.IFN-γ+TG+4μ8c联合处理组;9.IFN-γ+GSK2606414联合处理组;10.1FN-γ+TG+GSK2606414联合处理组,并进行对应的处理.利用Real-time PCR检测相关肌细胞因子基因水平;免疫荧光观察UPR关键分子:真核翻译起始因子2α(eIF2α)、肌醇需要酶1α(IRE1α)、转录激活因子6(ATF6)在肌纤维内的表达;Western blotting检测肌细胞相关免疫分子和肌细胞因子及UPR关键分子;Luminex分析肌纤维内促炎症的肌细胞因子的蛋白水平.结果 IFN-γ诱导的炎症环境中,肌纤维H-2Kb、H2-Ea、Toll样受体3(TLR3)以及p-eIF2α、p-IRE1α表达上调;添加UPR抑制剂4-PBA的分组肌纤维H-2Kb、H2-Ea、TLR3以及肌细胞因子的表达较IFN-γ组下调,添加IRE1α特异性抑制剂4μ8c的分组上述分子表达较IFN-γ组亦下调,而添加蛋白激酶R样内质网激酶(PERK)特异性抑制剂GSK2606414的分组则无明显变化.结论 IFN-γ诱导的炎症环境中,UPR-IRE1α通路激活并抑制肌纤维免疫相关分子合成,从而进一步抑制肌纤维介导的免疫反应,有利于肌再生.
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编辑人员丨2023/8/5
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真核翻译起始因子4γ2调控N-乙酰氨基半乳糖转移酶1 mRNA对胃癌细胞恶性表型的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)通过调控N-乙酰氨基半乳糖转移酶1(GALNT1)mRNA对胃癌进展的影响.方法 通过生物信息数据库分析GALNT1、EIF4G2在胃癌细胞和胃癌组织中的表达及与胃癌患者预后的关系,并分析胃癌组织中EIF4G2、GALNT1表达的相关性.采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测GALNT1 mRNA、EIF4G2 mRNA在人胃黏膜上皮细胞GES-1和人胃癌细胞(AGS细胞等)中的表达水平,并采用蛋白质印迹法(Western blot)检测GALNT1、EIF4G2蛋白表达水平.建立干扰GALNT1和过表达EIF4G2的AGS细胞株,采用CCK-8法和克隆形成实验检测细胞增殖能力,采用TUNEL实验检测细胞凋亡能力,采用划痕实验和Transwell实验分别检测细胞迁移和侵袭能力,采用Western blot检测凋亡和转移相关蛋白表达水平,采用RIP实验和RNA下拉实验检测GALNT1 mRNA与EIF4G2的结合关系.结果 胃癌组织和胃癌细胞中的GALNT1、EIF4G2水平分别高于正常组织和人胃黏膜上皮细胞,差异有统计学意义(P<0.001),且与胃癌患者预后差相关;胃癌组织中,EIF4G2表达与GALNT1表达呈正相关.敲低GALNT1后,AGS细胞活力降低,克隆形成数、迁移和侵袭细胞数减少,凋亡细胞数增加,Bcl-2、MMP2、MMP9蛋白表达降低,Bax、cleaved-caspase3、cleaved-caspase9蛋白表达增加,差异有统计学意义(P<0.001).EIF4G2可与GALNT1 mRNA结合,促进GALNT1 mRNA、GALNT1蛋白表达及GALNT1 mRNA稳定性,差异有统计学意义(P<0.001).共转染sh-GALNT1-1与oe-EIF4G2可逆转sh-GALNT1-1对AGS细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的作用,差异有统计学意义(P<0.05或P<0.01或P<0.001).结论 EIF4G2可通过稳定GALNT1 mRNA促进胃癌细胞增殖、迁移、侵袭并抑制细胞凋亡,其或可成为胃癌临床诊疗的新靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
