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粗叶悬钩子叶绿体基因组特征及系统发育分析
编辑人员丨1周前
为探讨粗叶悬钩子(Rubus alceifolius)叶绿体基因组特征及其与同科属植物叶绿体基因组的系统发育关系,本研究采用Illumina HiSeq 4000平台对粗叶悬钩子叶绿体基因组进行了测序、组装和注释,并对其序列特征、密码子偏好性、重复序列、简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)和系统发育进行分析.结果表明,粗叶悬钩子叶绿体基因组总长度为156 266 bp,呈典型的四分体结构,包括大单拷贝区85 874 bp、小单拷贝区18 850 bp和反向互补重复区25 771 bp;共含有基因128个,其中蛋白质编码基因86个,tRNA基因34个,rRNA基因8个.密码子偏好性分析表明,亮氨酸(Leu)的密码子数量最多(5 189个),而半胱氨酸(Cys)的密码子数量最少(590个).从粗叶悬钩子叶绿体基因组中共检测出39个长重复序列及52个SSR位点.系统发育分析表明,粗叶悬钩子与七裂叶悬钩子(Rubus reflexus var.lanceolobus)、越南悬钩子(Rubus co-chinchinensis)、棕红悬钩子(Rubus rufus)聚为一支,亲缘关系最密切.本研究为蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus)植物的分子标记、物种鉴定、亲属关系解析和遗传多样性分析等研究提供科学依据.
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编辑人员丨1周前
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粗叶悬钩子的生药学研究
编辑人员丨2023/8/5
目的:通过对粗叶悬钩子进行生药学研究,为粗叶悬钩子的开发利用、质量标准制定提供理论依据.方法:采用性状鉴别、显微鉴别、薄层色谱鉴别及分子鉴别的方法进行研究.结果:粗叶悬钩子根和茎粉末中存在成行排列的草酸钙簇晶;叶粉末中存在两种非腺毛,一种棒状腺毛;根和茎粉末存在具缘纹孔导管.选用内部转录间隔区(ITS)序列作为DNA条形码,可以将13种悬钩子属植物加以区分,ITS序列可作为粗叶悬钩子的DNA条形码.结论:本研究结果可为粗叶悬钩子的进一步开发利用提供参考依据.
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编辑人员丨2023/8/5
