目的:探讨长链非编码RNA（lncRNA）ALMS1-IT1在结直肠癌组织中的表达及对结直肠癌HT-29细胞体外增殖和迁移能力影响的分子机制。方法:选取2018年7月至2020年11月湖北六七二中西医结合骨科医院行手术切除并经病理学检查确诊的40例结直肠癌患者癌组织标本及癌旁组织（距肿瘤边缘>5 cm）标本。应用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）检测ALMS1-IT1在结直肠癌组织及癌旁组织中的表达水平，以≥中位相对表达量者为ALMS1-IT1高表达，分析ALMS1-IT1表达与患者临床病理特征的关系。将空载慢病毒和载有ALMS1-IT1沉默序列的慢病毒分别感染HT-29细胞，分别为对照组和si-ALMS1-IT1组。采用qRT-PCR检测两组HT-29细胞中ALMS1-IT1表达情况。应用CCK-8法和Transwell实验分别检测两组HT-29细胞增殖能力和迁移能力。采用starBase v2.0在线数据库预测ALMS1-IT1相互作用的分子，采用qRT-PCR和蛋白质印迹法检测这些分子的表达情况。结果:结直肠癌组织中ALMS1-IT1的相对表达量较癌旁组织增加（4.54±0.61比1.19±0.31； t＝34.89， P<0.01）。40例患者癌组织中ALMS1-IT1中位相对表达量为2.93，ALMS1-IT1高表达率为50.0%（20/40）。TNM分期Ⅲ期患者癌组织ALMS1-IT1高表达率高于Ⅰ~Ⅱ期者，低分化者高表达率高于高、中分化者，淋巴结转移者高表达率高于无淋巴结转移者（均 P<0.01）。si-ALMS1-IT1组HT-29细胞培养第2、3、4、5天的细胞增殖能力（吸光度值）均低于对照组（均 P<0.05）。si-ALMS1-IT1组HT-29细胞24 h细胞迁移数较对照组少[（45±7）个比（112±18）个； t＝3.45， P<0.05]。基于starBase v2.0在线数据库，预测到ALMS1-IT1的靶基因可能为miRNA-889-3p（miR-889-3p），miR-889-3p的靶基因可能为ATAD2。与对照组相比，si-ALMS1-IT1组HT-29细胞中miR-889-3p相对表达量升高（4.24±0.46比1.01±0.11； t＝6.81， P<0.01）。与对照组相比，si-ALMS1-IT1组ATAD2 mRNA（ P<0.01）和蛋白表达水平均降低。 结论:ALMS1-IT1在结直肠癌组织中高表达，ALMS1-IT1表达与患者TNM分期、肿瘤分化程度、淋巴结转移相关。体外下调ALMS1-IT1，可能通过调控miR-889-3p-ATAD2轴而抑制结直肠癌HT-29细胞增殖和迁移。ALMS1-IT1可能是结直肠癌的治疗靶点。

目的:探讨lncRNA ALMS1-IT1在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的表达及预后意义,明确ALMS1-IT1对CRC细胞增殖、侵袭和上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的影响.方法:通过GEPIA网络平台分析癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中ALMS1-IT1在CRC中的表达及其与患者生存的相关性;通过实时荧光定量PCR检测ALMS1-IT1在人正常肠上皮细胞(NCM460)和CRC细胞(HCT116、HT29、LoVo、SW480)中的表达情况;通过质粒转染在LoVo和SW480细胞中分别干扰和过表达ALMS1-IT1;CCK-8实验检测细胞增殖能力;Transwell实验分析细胞迁移和侵袭能力;蛋白免疫印记实验检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)表达变化.结果:TCGA数据分析证实ALMS1-IT1在CRC组织中的表达显著高于正常组织,高表达ALMS1-IT1与患者预后不良显著相关;ALMS1-IT1在CRC细胞(HCT116、HT29、LoVo、SW480)中的表达均显著高于正常肠上皮细胞(NCM460);干扰ALMS1-IT1抑制LoVo细胞增殖、迁移和侵袭,同时导致E-cadherin蛋白水平增加而N-cadherin和Vimentin蛋白水平减少;过表达ALMS1-IT1促进SW480细胞增殖、迁移和侵袭,并导致E-cadherin蛋白水平减少而N-cadherin和Vimentin蛋白水平增加.结论:ALMS1-IT1在CRC组织中高表达并与预后不良密切相关,ALMS1-IT1通过促进细胞增殖、侵袭及上皮间质转化发挥促CRC功能.

目的:探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)ALMS1-IT1在结肠癌组织中的表达及其临床意义,并探索其对结肠癌细胞增殖和侵袭的影响.方法:应用GEPIA平台分析TCGA数据库中ALMS1-IT1在结肠癌与正常组织中的表达水平及其与患者预后的相关性.通过实时荧光定量PCR(real-time quantita-tive PCR,RT-qPCR)检测ALMS1-IT1在结肠癌及癌旁组织中的表达并分析其与临床病理特征的相关性.pcDNA3.1-ALMS1-IT1 和 ALMS1-IT1 siRNA 分别转染 HCT116 细胞,RT-qPCR 检测转染效率,CCK-8、EdU和Transwell小室检测HCT116细胞增殖和侵袭能力.结果:TCGA数据提示,ALMS1-IT1在结肠癌组织中表达显著高于正常组织,我们的数据也证实ALMS1-IT1在结肠癌组织中显著高表达.TCGA数据生存分析发现ALMS1-IT1 高表达的结肠癌患者总生存率和无病生存率均显著降低.干扰ALMS1-IT1 显著抑制HCT116细胞增殖和侵袭,而过表达ALMS1-IT1则明显增强结肠癌细胞增殖和侵袭.结论:ALMS1-IT1在结肠癌组织中表达上调,其高表达提示患者预后不良,ALMS1-IT1通过促进结肠癌细胞增殖和侵袭发挥癌基因功能.

目的 通过生物信息学方法,寻找结肠癌中具有预后意义的焦亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和基因.方法 从TCGA数据库中下载结肠癌患者的基因测序和临床数据,并将筛选出的446例患者采用分层随机抽样法分为训练组(n=224)和验证组(n=222),通过共表达和差异分析筛选表达有差异的焦亡相关lncRNA.根据患者风险评分中位值分为高低风险组,进行生存分析.在训练组中,通过单因素、多因素COX分析和LASSO回归分析构建预后模型,利用Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线、单因素、多因素COX回归来评价上述模型,并绘制列线图预测样本生存情况.将验证组和全组样本代入模型进行验证.共表达分析、突变分析、差异分析筛选焦亡相关基因,并进行免疫组化表达验证.结果 筛选出5个预后相关lncRNA(MIR181A2HG、AP003555.1、LINCO2257、ALMS1-IT1、AL137782.1),高风险组的结肠癌患者生存率较低风险组更低,该风险评分可作为结肠癌患者独立预后因素(P＜0.01).根据年龄、性别、TMN分期和风险评分等预后相关因素构建列线图,可较准确预测患者1、3、5年生存率.最终筛选得到5个焦亡相关基因(SCAF11、IL1A、PJVK、CHMP2A、CHMP6).并选择SCAF11做免疫组化实验,结果显示SCAF11在结肠癌组织中高表达.结论 成功构建预后模型,筛选出5个焦亡相关lncRNA和5个焦亡相关基因,并通过免疫组化验证SCAF11在结肠癌组织较癌旁组织表达量高.