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环状RNA与肿瘤研究进展
编辑人员丨2023/8/6
目的 环状RNA(circular RNA,circRNA)是一大类共价结合形成环形结构的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在生物体内对基因表达具有重要的调控作用.本文拟对环状RNA的生物来源、特征、生物学功能,及其在肿瘤中的研究进展进行综述.方法 应用PubMed和CNKI期刊全文数据库检索系统,以“环状RNA(circRNA)、可变剪切(alternative splicing)、生物来源(biogenesis)、生物功能(biological functions)和肿瘤(cancer/carcinoma)”等为关键词,检索1976-01-01-2016-12-10的相关文献.纳入标准:(1)环状RNA的生物来源、特征、生物学功能;(2)环状RNA与肿瘤之间的关系.剔除标准:(1)阐述机制模糊;(2)实验设计不严谨.符合纳入标准的文献127篇,根据剔除标准剔除文献66篇,最后纳入分析文献61篇.结果 环状RNA作为RNA家族中一类特殊的内源性非编码RNA,如今已经提出了多种产生环状RNA的机制,环状RNA的形成受ALU元件的反向重复序列、外显子跳跃、RNA结合蛋白和其他因素的影响.由于环状RNA具有高度保守、稳定、在细胞质中丰度高等特征,随着研究的深入,发现其具有作为miRNA海绵、可变剪接调节器、转录因子和编码蛋白等作用.环状RNA可以调节大量肿瘤相关的miRNAs表达,环状RNA-miRNA-mRNA轴参与多个肿瘤相关通路的调节,包括促瘤作用和抑瘤作用.结论 环状RNA有多种生成机制,且受多因素影响,由于其稳定、保守、表达量大等特点,发现其有多种生物学功能,且与肿瘤的发生发展有重要的关联,环状RNA很有希望成为肿瘤诊断的新标志物和肿瘤治疗的新分子靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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Alu家族在4种旧世界猴基因组中的特征
编辑人员丨2023/8/6
为了揭示转座子对旧世界猴基因组多样性和进化的影响,基于Repbase数据库和RepeatMasker比较了4种旧世界猴——东非狒狒Papio anubis、猕猴Macaca mulatta、绿猴Chlorocebus sabaeus和长鼻猴Nasalis larvatus基因组中转座子的特征,重点关注Alu家族的组成、插入/缺失多态性Alu位点和物种特有Alu插入.结果 显示,4个基因组中短散在重复序列拷贝数最丰富,平均分歧率最小,其中灵长目Primates特有的Alu逆转座子的拷贝数超过了100万个(长鼻猴除外).4个基因组中转座子的基本组成和分布与它们的进化关系相吻合,东非狒狒和猕猴的转座子特征相似,二者与绿猴、长鼻猴有较大差异.通过基因组的两两比较,鉴定了大量在4个基因组间具有插入/缺失多态性的Alu位点,以及7 882个各物种特有的Alu位点,95％以上的物种特有位点都属于AluY家族.研究结果揭示了Alu的转座活动对于旧世界猴动物基因组的进化及多样性具有重要影响.
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编辑人员丨2023/8/6
