目的 观察克山病基因表达谱的变化,从基因水平探讨克山病细胞凋亡发生机制,寻找克山病诊断标志基因,建立克山病诊断质心图.方法 选择来自克山病病区符合克山病诊断指标的10例慢型克山病患者作为克山病组,10例健康居民作为对照组.取受检者空腹静脉血,提取全血RNA,采用Agilent表达谱芯片[Agilent 4×44K全基因组Oligo芯片(单标)]测试全基因组表达谱.采用Agilent Feature Extraction Software 提取数据,克山病组与对照组间差异基因分析采用t检验筛选,经基因关系网络分析(Pathway studio analysis)软件分析基因富集通路,并经分类预测分析(prediction analysis for microarray,PAM)筛选克山病诊断标志基因,建立诊断质心图.结果 与对照组比较,克山病组筛选出3 068个差异基因,其中克山病患者上调1 570个,下调1 498个.富集信息通路38条.其中凋亡通路居于首位,其关系网络图显示6个基因在克山病组表达上调,包括共济失调突变基因(ATM)、cAMP依赖蛋白激酶A(PKA)、杆状病毒IAP repeat-containing 2 (BIRC2)、NLR家族凋亡抑制蛋白(NAIP)、BCL2样11(Bim)、BCL2相关蛋白A1 (BCL2A1);7个基因表达下调,包括细胞凋亡相关蛋白酶8(CASP8)、BCL2结合成分3(BBC3)、BCL2相关永生基因(BAG1)、BCL2-相关X蛋白(BAX)、BCL2样1 (BCL2L1)、BCL2相关卵巢杀手(BOK)、凋亡相关蛋白酶6(CASP6).共筛选出42个诊断标志基因.结论 凋亡相关差异表达基因及信息通路在克山病的发病机制中具有重要作用,筛选的42个诊断标志基因可为克山病的诊断提供基础依据.

目的:比较不同类型凋亡基因在牙龈瘤中的特征性表达,探讨细胞凋亡在牙龈瘤发病中的作用机制.方法:2017年12月-2018年5月治疗36例牙龈瘤患者,收集对应的牙龈瘤组织和正常牙龈组织.其中6对用PCR芯片检测84个凋亡相关基因的表达,30对用实时荧光定量PCR验证芯片结果.根据内参基因△△Ct法计算基因表达改变,采用SPSS 17.0软件包对数据进行统计学分析.结果:与正常牙龈组织相比,牙龈瘤组织中AIFM1、BCL2、BCL2L1、BCL2L2、BFAR、BIRC2、BIRC3、BIRC6、BNIP2、BNIP3、CD40LG、XIAP表达升高,TNFRSF25表达下降.结论:BCL-2家族抗凋亡基因和IAP家族基因过表达,抑制牙龈组织正常凋亡的发生,最终引起牙龈瘤.

背景:microRNAs是一类重要的内源性非编码小RNA分子,可通过调节mRNA的翻译调控基因的表达.近年来发现,miR-214在相关的骨代谢信号通路中起着重要的作用,可通过靶向相关基因调控骨吸收与骨形成.目的:通过回顾国内外相关文献,就miR-214在骨组织代谢中的调控机制及应用研究的新进展作一综述.方法:由第一作者在2019年11月至2020年4月间以"miRNA,miR-214,osteogenesis,osteoblast""miR-214,bone remodeling""miR-214,osteoclast,tissue engineering"为关键词,检索2005至2020年期间PubMed、Web of Science、Medline等数据库中的文献,初步检索到761篇相关文献,排除与文章研究目的无关及重复性的文献,纳入符合标准的63篇文献进行分析.结果与结论:①miR-214可通过靶向磷酸酶-张力蛋白同源基因(PTEN)、肿瘤坏死因子受体相关因子3促进破骨向分化,靶向转化生长因子β激活激酶1结合蛋白2(TAB2)、钙黏蛋白相关蛋白(CTNNB1)、锌指结构转录因子(Osterix)、激活转录因子4(ATF4)、Ⅳ型胶原蛋白基因 α1(COL4A1)、杆状病毒IAP重复序列7(BIRC7)、成纤维细胞生长因子受体1、TAFA趋化因子样家族成员5(TAFA5)、骨形态发生蛋白2等抑制成骨分化;②沉默或过表达miR-214可以调控骨代谢;③目前已发现血清或细胞外囊泡中miR-214可能是一些疾病诊断和预后的检测标志物,同时将miR-214拮抗剂或模拟物与其他载体构成稳定高效安全的缓释系统也是应用研究的热点,因此,以miR-214为基础展开的应用研究可能在未来骨组织代谢相关疾病的治疗方面具有较大的潜力.

目的·从表观遗传角度寻找和鉴定弥漫内生性脑桥胶质瘤(diffuse intrinsic pontine glioma,DIPG)的单药治疗和组合靶向治疗新策略.方法·以已发表的基于8例DIPG肿瘤组织和6例正常脑组织的转录组数据为基础选择用于筛选实验的靶向小分子库.在DIPG原代细胞SU DIPG13中进行单药筛选并寻找新的能显著抑制DIPG细胞生长的靶向小分子.通过实时定量PCR和Western blotting检测药物处理后其靶基因在mRNA和蛋白水平的表达变化.EdU和Annexin V/碘化丙啶染色后利用流式细胞术分别检测药物处理对DIPG原代细胞增殖和凋亡的影响.靶向小分子库中的药物分别与溴结构域和外端家族(bromodomain and extra terminal protein,BET)抑制剂JQ1和panobinostat组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)进行组合筛选,并体外验证对DIPG存在抑制作用的药物组合.结果·选择了包含66个小分子靶向小分子的药物库用于单药和组合筛选.单药筛选鉴定出的YM155能够显著抑制DIPG原代细胞SU DIPG13和SU_DIPG17的生长,其靶基因BIR C5(baculoviral IAP repeat containing 5;编码survivin)在DIPG肿瘤组织中的表达高于正常组织(P=0.018).YM155能抑制BIR C5在mRNA和蛋白水平的表达.YM155既能抑制DIPG原代细胞的增殖又能促进其凋亡.靶向小分子库中的CX4945、ABT-737分别与JQ1、panobinostat联用能在体外协同抑制DIPG细胞活性.结论·通过单药和组合药物筛选鉴定出了DIPG的靶向治疗新策略,为后续体内验证这些DIPG的新靶向治疗策略和挖掘治疗机制奠定了基础.

目的 基于转录组学探讨双氢青蒿素(DHA)干预肝癌细胞HepG2215后的基因表达差异.方法 将HepG2215细胞分为DHA组和对照组,DHA组以22.5μmol·L-1 DHA干预24 h,对照组以含有0.1％DMSO的培养基进行干预.提取各组肝癌细胞的总RNA,利用Illumina平台测序获得2组HepG2215细胞间的差异表达基因[DEG,|log2FC|＞1且错误发现率(FDR)＜0.05],并通过qRT-PCR实验验证转录组测序数据的可靠性.通过GO功能及KEGG通路富集分析、蛋白互作(PPI)网络分析对DEG进行功能预测和分析.结果 与对照组相比,DHA组HepG2215细胞鉴定出238个DEG,其中上调基因73个,下调基因165个.qRT-PCR实验结果表明,与对照组相比,DHA组细胞AKR1C1 mRNA表达显著上调(P＜0.01),而PLA2G2A、PGC mRNA表达显著下调(P＜0.01),与转录组测序结果一致.在细胞组分中,与细胞外区域相关富集的基因较多;在生物过程中,与受体、配体活性调节相关富集的基因较多;在分子功能中,与对细菌的反应、对金属离子的反应、免疫和炎症反应及氨基糖苷类抗原代谢富集的相关基因较多.显著富集的前3条KEGG信号通路为矿物质吸收通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、NF-κB信号通路.TNF-α诱导蛋白3(TNFAIP3)、杆状病毒IAP重复序列3(BIRC3)、核苷酸结合寡聚化结构域蛋白2(NOD2)可能是DHA干预HepG2215细胞的关键核心靶点.结论 DHA可能作用于TNFAIP3、BIRC3、NOD2等靶点基因,通过金属硫蛋白(MT)家族、IL-17及NF-κB信号通路,影响肝癌细胞的金属稳态、NK细胞介导的肿瘤杀伤效应和炎症反应,发挥对HepG2215细胞的干预作用.