目的:分析新型冠状病毒奥密克戎突变株感染合并心房颤动（房颤）患者的临床特征及预后。方法:选择2022年3月23日至5月15日上海市新冠肺炎定点医院周浦医院收治的2 675例年龄≥50岁的本土新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）病例，将合并房颤患者分为轻型组、普通型组和重型/危重型组。收集3组患者的临床资料、影像学检查和实验室检查结果及预后并进行比较。结果:2 675例新冠肺炎患者中位年龄69.0（60.0，81.0）岁，其中135例合并房颤，房颤发生率为5.05%。合并房颤患者的年龄为55~101岁，中位年龄84.0（74.0，89.0）岁；轻型组68例，普通型组30例，重型/危重型组37例（包括重型9例、危重型28例）。重型/危重型组患者年龄55~75岁比例为43.2%，新冠疫苗接种率为32.4%；新发房颤比例在3组中最高，长程持续性房颤比例则以轻型组最高（58.8%）。重型/危重型组伴发热（29.7%）、肝功能不全（13.5%）、肾功能不全（46.0%）、2型糖尿病比例（46.0%）及心功能不全NYHA分级高〔与轻型和普通型比较分别为（分）：1.8±1.1比1.1±0.8、1.2±0.7，均 P<0.05〕。实验室检查方面，与轻型组和普通型组比较，重型/危重型患者的C-反应蛋白（CRP）、丙氨酸转氨酶（ALT）、天冬氨酸转氨酶（AST）水平均明显升高〔CRP（mg/L）：27.2（6.0，60.8）比7.6（3.1，19.3）、12.8（4.9，26.3），ALT（U/L）：31.3±15.4比15.4±9.3、19.3±11.7，AST（U/L）：78.0±21.7比34.7±15.6、38.1±24.4，均 P<0.05〕，血红蛋白（Hb）、白蛋白（ALB）水平均明显降低〔Hb（g/L）：105.3±22.5比125.8±25.4、123.0±20.4，ALB（g/L）：33.7±6.0比39.0±5.5、39.6±13.1，均 P<0.05〕；另外，重型/危重型组肌酸激酶同工酶（CK-MB）明显高于轻型组〔μg/L：2.5（1.5，3.4）比2.2（1.2，2.8）， P<0.05〕。治疗方面，3组间使用抗血小板药物和低分子肝素比例比较差异均有统计学意义，其中重型/危重型组使用抗血小板药物比例最低（27.0%），使用低分子肝素比例则高于轻型组〔81.1%（30/37）比51.5%（35/68）， P<0.05〕。新冠肺炎合并房颤患者病死率为18.5%（25/135），均为危重型患者，其中脑栓塞、肺栓塞及脑出血者占32.0%（8/25），40.0%（10/25）死于多器官衰竭（40.0%合并消化道出血），20.0%（5/25）死于心脏性猝死，12.0%（3/25）死于呼吸衰竭；而轻型、普通型及9例重型患者均无死亡。 结论:奥密克戎变异株感染合并房颤的重型/危重型新冠肺炎患者预后更差，病死率高，主要死因为心、肺、脑等多器官衰竭及栓塞性疾病。

目的 了解中国目前传播的麻风分枝杆菌(M.leprae)菌种及单核苷酸多态性(SNPs)型分布与特征.方法 对来自中国22个省市171例麻风患者皮损组织样本,采用巢式PCR扩增麻风分枝杆菌特异16S rRNA保守片段,并对PCR阳性产物直接测序,经BLAST进行序列比对;采用PCR产物限制性酶切基因多态性方法对麻风分枝杆菌进行SNP分型.结果 171例标本扩增片段与来自巴西的麻风分枝杆菌Br4923相似性达99％,均为M.leprae,未检出M.lepromatosis.在85例SNP分型标本中,SNP3型、SNP1型和SNP2型分别占78.8％(67/85)、20％ (17/85)和1.2％(1/85),未检出SNP4型.130例16S rRNA序列存在C251T位碱基变异,不同临床型别标本中16S rRNA序列突变及SNP型别分布差异无统计学意义;16S rRNA基因C251T突变与麻风分枝杆菌菌株的SNP分型有一定的关联,存在突变的菌株多为SNP3型,少见SNP1型,未见SNP2型;不同地区的SNP型别分布之间差异有统计学意义,内陆地区的SNP3型菌株分布率97.1％(34/35)显著高于沿海66％ (33/50)(x2=11.96,P＜0.01).不同地区的16S rRNA序列突变率差异也有统计学意义,内陆地区的16S rRNA突变率94.8％ (92/97)显著高于沿海51.4％(38/74)(x2 =43.56,P＜0.01).结论 麻风分枝杆菌16S rRNA基因序列突变C251T与SNP分型有关,可提示不同基因型麻风分枝杆菌的地理分布.未发现麻风分枝杆菌M.lepromatosis菌种.

基于Pango命名法,全球曾经或正在流行的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚型或分支已有1379个(截至2021年9月20日).由于传播力、免疫逃逸能力更强的变异株逐渐成为绝对优势流行株,很多基因型别已经消失或接近消失.世界卫生组织定义了4种关切变异株、5种关注变异株和11种需进一步监测的变异株.目前,Delta变异株取代Alpha变异株成为全球优势流行毒株,也是近期我国输入病例和导致输入关联本土疫情的主要毒株.同时,在南美洲部分国家流行的Gamma和Lambda变异株,在南美洲和北美洲部分国家流行的Mu变异株,以及在南非流行的C.1.2变异株,同样引起全球的高度关注.本研究对SARS-CoV-2基因组的变异变迁、重要变异株的研究进展进行综述,并结合SARS-CoV-2变异株的流行现状提出了下一步科学研究关注的要点.

为了了解境外输入的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)变异株的分子特征,本研究对2021年6月深圳市一株从南非输入的SARS-CoV-2毒株进行了全基因组测序和序列分析.Illumina测序技术获得的SARS-CoV-2毒株基因组长度为29567nt.根据"Pango lineages"分型法,本研究测定的毒株属于C.1.2系,该谱系属世界卫生组织定义的监测变异株(Variants Under Monitoring,VUM)成员之一.与参考株 Wuhan-Hu-1(NC_045512.2)比较,本研究 C.1.2系毒株共出现了 58个核苷酸变异位点,其中56个变异位点位于编码区.氨基酸变异位点共有33个,氨基酸变异位点分布于6个开放阅读框,变异数由多到少依次为:S蛋白区12个,ORFlab蛋白区9个,ORF3a蛋白区2个,M区2个,ORF8区2个,E区1个.本研究测定的SARS-CoV-2毒株属我国大陆首例境外输入的C.1.2变异株.开展境外输入的SARS-CoV-2毒株基于基因组测序的分子监测,对防控由境外输入的SARS-CoV-2变异株引起本地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)暴发与流行具有重要意义.