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基于DNA双链断裂损伤簇的相对生物效能模拟计算
编辑人员丨1周前
目的:从追溯辐射引起的DNA损伤机制出发,根据基本的生物物理原理获取DNA双链断裂(DSB)损伤簇表示的相对生物效能(RBE)值,探讨DNA损伤与染色体畸变、生殖细胞死亡生物效能的相似性。方法:以低能电子、质子、α粒子作为研究对象,通过辐射物理化学模型,模拟细胞核受粒子辐射的过程。在基于损伤点密度的含噪声密度聚类(DBSCAN)算法的基础上,改进DSB损伤簇分类方法,以减弱模拟过程中损伤点与能量沉积随机分布假设的联系,使得DSB损伤簇更接近于非随机分布。计算获得DSB损伤簇的产额,提出以DSB损伤簇计算RBE值的方法。结果:2 MeV α粒子的DSB损伤簇RBE值(12.29)与生物实验中染色体片段(15.3±5.9)、细胞存活(14.7±5.1)表示的RBE相近。结论:高传能线密度(LET)电离辐射后,不同于简单DSB,DSB损伤簇的RBE与染色体畸变、细胞存活生物效能存在一定的相似性。
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编辑人员丨1周前
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基因编辑技术在疾病中的应用及研究进展
编辑人员丨1周前
基因编辑是一种对生物体基因组特定位点进行精确修饰的技术,通过对基因片段的敲除、插入及替换,实现对生物体某一特性或性状的改变。先后出现了锌指核酸酶、类转录激活因子效应物核酸酶、规律性重复短回文序列簇系统。这3种技术皆是通过在基因组特定位点引入DNA双链断裂损伤,继而通过机体自身的DNA损伤修复机制完成修复。本文重点介绍了近年来基因编辑技术在呼吸系统等疾病中的应用以及研究进展。
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编辑人员丨1周前
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单链退火修复及其在疾病治疗和基因编辑中的作用
编辑人员丨2023/8/5
DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)对细胞生存是致命的.细胞内经典非同源末端连接(classical non-homologous end joining,C-NHEJ)和选择性非同源末端连接(alternative nonhomologous end joining,A-NHEJ)、重组修复(homology-directed repair,HDR)、单链退火修复(singlestrand annealing,SSA)等通路可竞争性修复DNA双链断裂损伤.其中,SSA途径不使用同源染色体或姐妹染色单体,仅依赖于重复序列彼此退火配对,并涉及遗传信息的丢失,是容易出错的修复过程,具有诱变性.相比其他修复途径,在细胞周期S和G2期中,末端切除暴露出更长的同源重复序列(> 20 bp),有利于细胞选择SSA途径进行修复.在一些SSA活性升高的同源重组(homologous recombination,HR)缺陷癌症中,癌症细胞可利用SSA途径获得耐药性,也预示着疾病风险的提高.因此,靶向SSA途径的抑制剂具有抑制癌症进展,以及逆转肿瘤细胞对聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(poly ADP-ribose polymerase,PARP)抑制剂耐药的作用,是一种新型的治疗策略,可能成为特定同源重组缺陷癌症风险评估的有力工具.检测SSA活性将有助于更好区分癌症的发生和进展.同时随着基因编辑技术的发展,基于SSA途径的荧光报告基因方法,用于检测规律成簇的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR-Cas9)系统中引导RNA(gRNA)的特异性和裂解活性被证明是有效、可靠的策略,同时结合CRISPR-Cas9靶向和SSA诱导的DNA编辑,可以特定模式表达多个gRNA并实现多种细胞类型特异性操作和组合遗传靶向.尽管对SSA途径的研究与基于SSA途径的技术应用已取得不错的进展,但仍有许多问题有待阐明.
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编辑人员丨2023/8/5
